MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_010483	GCTTTT	2	12	336959	336970	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	170288154
7502	NC_010483	TTTC	2	8	337041	337048	0 %	75 %	0 %	25 %	170288154
7503	NC_010483	TCC	2	6	337061	337066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288155
7504	NC_010483	CTT	2	6	337067	337072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288155
7505	NC_010483	T	6	6	337095	337100	0 %	100 %	0 %	0 %	170288155
7506	NC_010483	GAA	2	6	337113	337118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288155
7507	NC_010483	CAGC	2	8	337122	337129	25 %	0 %	25 %	50 %	170288155
7508	NC_010483	CTT	2	6	337139	337144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288155
7509	NC_010483	TTC	2	6	337222	337227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288155
7510	NC_010483	T	7	7	337239	337245	0 %	100 %	0 %	0 %	170288155
7511	NC_010483	TCT	2	6	337272	337277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288155
7512	NC_010483	TCC	2	6	337387	337392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288155
7513	NC_010483	TCT	2	6	337396	337401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288155
7514	NC_010483	CCT	2	6	337446	337451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288155
7515	NC_010483	TCA	2	6	337480	337485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288155
7516	NC_010483	GAA	2	6	337612	337617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288155
7517	NC_010483	TGG	2	6	337685	337690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288155
7518	NC_010483	AAC	2	6	337866	337871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288155
7519	NC_010483	A	6	6	337885	337890	100 %	0 %	0 %	0 %	170288155
7520	NC_010483	CTG	2	6	337907	337912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288155
7521	NC_010483	GT	3	6	337921	337926	0 %	50 %	50 %	0 %	170288155
7522	NC_010483	AG	3	6	337933	337938	50 %	0 %	50 %	0 %	170288155
7523	NC_010483	TC	3	6	337991	337996	0 %	50 %	0 %	50 %	170288155
7524	NC_010483	GTA	2	6	338043	338048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288155
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7527	NC_010483	TCT	2	6	338128	338133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288155
7528	NC_010483	CTTT	2	8	338134	338141	0 %	75 %	0 %	25 %	170288155
7529	NC_010483	T	6	6	338160	338165	0 %	100 %	0 %	0 %	170288155
7530	NC_010483	CTT	2	6	338268	338273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288155
7531	NC_010483	TCG	2	6	338281	338286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288155
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7533	NC_010483	TC	3	6	338295	338300	0 %	50 %	0 %	50 %	170288155
7534	NC_010483	GAG	2	6	338325	338330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288155
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7536	NC_010483	GGAA	2	8	338379	338386	50 %	0 %	50 %	0 %	170288155
7537	NC_010483	CAA	2	6	338387	338392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288155
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7539	NC_010483	CT	3	6	338443	338448	0 %	50 %	0 %	50 %	170288155
7540	NC_010483	TCT	2	6	338490	338495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288156
7541	NC_010483	TCA	2	6	338583	338588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288156
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7544	NC_010483	CGA	2	6	338784	338789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288156
7545	NC_010483	TCG	2	6	338834	338839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288156
7546	NC_010483	CAT	2	6	338887	338892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288156
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7548	NC_010483	CAGA	2	8	338915	338922	50 %	0 %	25 %	25 %	170288157
7549	NC_010483	CTC	2	6	338926	338931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288157
7550	NC_010483	TTTC	2	8	338951	338958	0 %	75 %	0 %	25 %	170288157
7551	NC_010483	CAG	2	6	338961	338966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288157
7552	NC_010483	TGT	2	6	338978	338983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288157
7553	NC_010483	TTA	2	6	339005	339010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288157
7554	NC_010483	CTT	2	6	339053	339058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288157
7555	NC_010483	AAGA	2	8	339117	339124	75 %	0 %	25 %	0 %	170288157
7556	NC_010483	CTTC	2	8	339134	339141	0 %	50 %	0 %	50 %	170288157
7557	NC_010483	TTC	2	6	339162	339167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288157
7558	NC_010483	AC	3	6	339183	339188	50 %	0 %	0 %	50 %	170288157
7559	NC_010483	ACC	2	6	339256	339261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288157
7560	NC_010483	TCT	2	6	339262	339267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288157
7561	NC_010483	GCT	2	6	339268	339273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288157
7562	NC_010483	GTTC	2	8	339308	339315	0 %	50 %	25 %	25 %	170288157
7563	NC_010483	TCC	2	6	339334	339339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288157
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7567	NC_010483	CGC	2	6	339588	339593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288157
7568	NC_010483	CGA	2	6	339623	339628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288157
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7570	NC_010483	TCT	2	6	339707	339712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288157
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7593	NC_010483	CGT	2	6	340541	340546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288157
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7601	NC_010483	TC	3	6	340909	340914	0 %	50 %	0 %	50 %	170288158
7602	NC_010483	TAT	2	6	340927	340932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288158
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7605	NC_010483	T	6	6	341047	341052	0 %	100 %	0 %	0 %	170288158
7606	NC_010483	ACTCT	2	10	341118	341127	20 %	40 %	0 %	40 %	170288158
7607	NC_010483	GAAAA	2	10	341212	341221	80 %	0 %	20 %	0 %	170288158
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7612	NC_010483	CAA	2	6	341442	341447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288158
7613	NC_010483	TC	3	6	341463	341468	0 %	50 %	0 %	50 %	170288158
7614	NC_010483	TGA	2	6	341514	341519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288158
7615	NC_010483	CTCTT	2	10	341521	341530	0 %	60 %	0 %	40 %	170288158
7616	NC_010483	CTTT	2	8	341643	341650	0 %	75 %	0 %	25 %	170288158
7617	NC_010483	CT	3	6	341680	341685	0 %	50 %	0 %	50 %	170288158
7618	NC_010483	AG	3	6	341721	341726	50 %	0 %	50 %	0 %	170288158
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7621	NC_010483	TGATCT	2	12	341844	341855	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	170288158
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7996	NC_010483	GAAGT	2	10	359893	359902	40 %	20 %	40 %	0 %	170288175
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7998	NC_010483	AG	3	6	359977	359982	50 %	0 %	50 %	0 %	170288175
7999	NC_010483	TC	3	6	359995	360000	0 %	50 %	0 %	50 %	170288175
8000	NC_010483	TCT	2	6	360021	360026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288175

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