MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_010483	CAG	2	6	315234	315239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288134
7002	NC_010483	TC	3	6	315248	315253	0 %	50 %	0 %	50 %	170288134
7003	NC_010483	TC	3	6	315262	315267	0 %	50 %	0 %	50 %	170288134
7004	NC_010483	TGA	2	6	315306	315311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288134
7005	NC_010483	CT	3	6	315470	315475	0 %	50 %	0 %	50 %	170288134
7006	NC_010483	GAT	2	6	315478	315483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288134
7007	NC_010483	CGA	2	6	315498	315503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288134
7008	NC_010483	TCTT	2	8	315511	315518	0 %	75 %	0 %	25 %	170288134
7009	NC_010483	GAT	2	6	315538	315543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288134
7010	NC_010483	CCTC	2	8	315592	315599	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7011	NC_010483	TG	3	6	315739	315744	0 %	50 %	50 %	0 %	170288135
7012	NC_010483	CTC	2	6	315794	315799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288135
7013	NC_010483	GAA	2	6	315806	315811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288135
7014	NC_010483	TCT	2	6	315859	315864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288135
7015	NC_010483	GTT	2	6	315881	315886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288135
7016	NC_010483	T	6	6	315924	315929	0 %	100 %	0 %	0 %	170288135
7017	NC_010483	AG	3	6	315933	315938	50 %	0 %	50 %	0 %	170288135
7018	NC_010483	CT	3	6	316036	316041	0 %	50 %	0 %	50 %	170288135
7019	NC_010483	T	6	6	316093	316098	0 %	100 %	0 %	0 %	170288135
7020	NC_010483	GAGG	2	8	316183	316190	25 %	0 %	75 %	0 %	170288136
7021	NC_010483	TTC	2	6	316204	316209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288136
7022	NC_010483	TTC	2	6	316241	316246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288136
7023	NC_010483	GTT	2	6	316441	316446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288136
7024	NC_010483	TTC	2	6	316447	316452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288136
7025	NC_010483	TTC	2	6	316457	316462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288136
7026	NC_010483	TC	4	8	316488	316495	0 %	50 %	0 %	50 %	170288136
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7028	NC_010483	CGT	2	6	316607	316612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288137
7029	NC_010483	TTG	2	6	316621	316626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288137
7030	NC_010483	AGC	2	6	316671	316676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288137
7031	NC_010483	CT	3	6	316722	316727	0 %	50 %	0 %	50 %	170288137
7032	NC_010483	GGGTG	2	10	316784	316793	0 %	20 %	80 %	0 %	170288137
7033	NC_010483	GTG	2	6	316945	316950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288137
7034	NC_010483	GTG	2	6	317011	317016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288137
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7036	NC_010483	CGA	2	6	317174	317179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288137
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7038	NC_010483	TCG	2	6	317266	317271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288137
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7040	NC_010483	AGG	2	6	317366	317371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288137
7041	NC_010483	GAA	2	6	317427	317432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288137
7042	NC_010483	GTG	2	6	317457	317462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288137
7043	NC_010483	TTCG	2	8	317484	317491	0 %	50 %	25 %	25 %	170288137
7044	NC_010483	TC	3	6	317645	317650	0 %	50 %	0 %	50 %	170288137
7045	NC_010483	CATC	2	8	317681	317688	25 %	25 %	0 %	50 %	170288137
7046	NC_010483	AGT	2	6	317714	317719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288137
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7048	NC_010483	TGA	2	6	317783	317788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288137
7049	NC_010483	GCTC	2	8	317799	317806	0 %	25 %	25 %	50 %	170288137
7050	NC_010483	TCA	2	6	317838	317843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288138
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7052	NC_010483	TTTC	2	8	317856	317863	0 %	75 %	0 %	25 %	170288138
7053	NC_010483	GAC	2	6	317880	317885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288138
7054	NC_010483	TCT	2	6	317897	317902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288138
7055	NC_010483	AGAT	2	8	317905	317912	50 %	25 %	25 %	0 %	170288138
7056	NC_010483	CTC	2	6	317922	317927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288138
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7059	NC_010483	CTT	2	6	318020	318025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288138
7060	NC_010483	GAT	2	6	318036	318041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288138
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7063	NC_010483	TTC	2	6	318135	318140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288138
7064	NC_010483	TCCA	2	8	318228	318235	25 %	25 %	0 %	50 %	170288138
7065	NC_010483	ACG	2	6	318283	318288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288138
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7067	NC_010483	CGT	2	6	318425	318430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288138
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7070	NC_010483	GGTGA	2	10	318496	318505	20 %	20 %	60 %	0 %	170288138
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7073	NC_010483	GA	4	8	318695	318702	50 %	0 %	50 %	0 %	170288138
7074	NC_010483	ATG	2	6	318808	318813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288138
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7078	NC_010483	TGTCC	2	10	318887	318896	0 %	40 %	20 %	40 %	170288138
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7082	NC_010483	GA	3	6	319161	319166	50 %	0 %	50 %	0 %	170288138
7083	NC_010483	CGA	2	6	319220	319225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288138
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7089	NC_010483	CAGAAG	2	12	319455	319466	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	170288138
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7091	NC_010483	CCT	2	6	319489	319494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7092	NC_010483	TGAA	2	8	319523	319530	50 %	25 %	25 %	0 %	170288139
7093	NC_010483	TGAAGA	2	12	319542	319553	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	170288139
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7119	NC_010483	AG	3	6	320703	320708	50 %	0 %	50 %	0 %	170288139
7120	NC_010483	CTTT	2	8	320710	320717	0 %	75 %	0 %	25 %	170288139
7121	NC_010483	T	6	6	320722	320727	0 %	100 %	0 %	0 %	170288139
7122	NC_010483	CGA	2	6	320739	320744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288139
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7124	NC_010483	GTA	2	6	320800	320805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288139
7125	NC_010483	TTCT	2	8	320846	320853	0 %	75 %	0 %	25 %	170288139
7126	NC_010483	CTT	2	6	320928	320933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288139
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7128	NC_010483	AGA	2	6	320989	320994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288139
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7130	NC_010483	TCCTT	2	10	321036	321045	0 %	60 %	0 %	40 %	170288139
7131	NC_010483	GA	3	6	321084	321089	50 %	0 %	50 %	0 %	170288139
7132	NC_010483	GTA	2	6	321172	321177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288139
7133	NC_010483	GAA	2	6	321181	321186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288139
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7155	NC_010483	TCG	2	6	322112	322117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288140
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7159	NC_010483	GTA	2	6	322276	322281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288140
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7212	NC_010483	CTTTT	2	10	324247	324256	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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7232	NC_010483	CCGCTC	2	12	325405	325416	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	170288142
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7237	NC_010483	TCTCGC	2	12	325622	325633	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	170288142
7238	NC_010483	GCT	2	6	325646	325651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288142
7239	NC_010483	GCA	2	6	325671	325676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7240	NC_010483	TAA	2	6	325685	325690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7241	NC_010483	GGT	2	6	325697	325702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7242	NC_010483	A	6	6	325709	325714	100 %	0 %	0 %	0 %	170288143
7243	NC_010483	TTC	2	6	325731	325736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288143
7244	NC_010483	TCT	2	6	325752	325757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288143
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7492	NC_010483	CTC	2	6	336643	336648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288154
7493	NC_010483	GGT	2	6	336649	336654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288154
7494	NC_010483	GGT	2	6	336664	336669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288154
7495	NC_010483	CAA	2	6	336681	336686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288154
7496	NC_010483	GAC	2	6	336790	336795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288154
7497	NC_010483	TTC	2	6	336803	336808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288154
7498	NC_010483	TGG	2	6	336825	336830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288154
7499	NC_010483	TCG	2	6	336869	336874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288154
7500	NC_010483	CTT	2	6	336922	336927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288154

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