MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010483	AT	3	6	292005	292010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_010483	CCT	2	6	292012	292017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6503	NC_010483	AAAG	2	8	292044	292051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_010483	T	7	7	292057	292063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_010483	AG	3	6	292090	292095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_010483	GAA	2	6	292117	292122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_010483	CTC	2	6	292153	292158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288111
6508	NC_010483	TGG	2	6	292286	292291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288111
6509	NC_010483	GAA	2	6	292299	292304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288111
6510	NC_010483	GAA	2	6	292311	292316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288111
6511	NC_010483	GAA	2	6	292339	292344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288111
6512	NC_010483	GA	3	6	292348	292353	50 %	0 %	50 %	0 %	170288111
6513	NC_010483	TGA	2	6	292400	292405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288111
6514	NC_010483	TC	3	6	292412	292417	0 %	50 %	0 %	50 %	170288111
6515	NC_010483	CAG	2	6	292523	292528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288111
6516	NC_010483	AG	3	6	292621	292626	50 %	0 %	50 %	0 %	170288111
6517	NC_010483	CTT	2	6	292681	292686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288111
6518	NC_010483	TGT	2	6	292725	292730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288111
6519	NC_010483	ACG	2	6	292745	292750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288111
6520	NC_010483	A	6	6	292774	292779	100 %	0 %	0 %	0 %	170288111
6521	NC_010483	AAGAA	2	10	292785	292794	80 %	0 %	20 %	0 %	170288111
6522	NC_010483	GA	3	6	292874	292879	50 %	0 %	50 %	0 %	170288111
6523	NC_010483	TTC	2	6	292915	292920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288111
6524	NC_010483	A	6	6	292947	292952	100 %	0 %	0 %	0 %	170288111
6525	NC_010483	GAA	2	6	292994	292999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288111
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6527	NC_010483	AGA	2	6	293061	293066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288111
6528	NC_010483	TGT	2	6	293079	293084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288111
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6531	NC_010483	GAA	2	6	293191	293196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288111
6532	NC_010483	AGGA	2	8	293228	293235	50 %	0 %	50 %	0 %	170288111
6533	NC_010483	GA	3	6	293257	293262	50 %	0 %	50 %	0 %	170288111
6534	NC_010483	GGAAA	2	10	293293	293302	60 %	0 %	40 %	0 %	170288111
6535	NC_010483	GTG	2	6	293320	293325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288111
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6537	NC_010483	AT	3	6	293386	293391	50 %	50 %	0 %	0 %	170288112
6538	NC_010483	ATAA	2	8	293406	293413	75 %	25 %	0 %	0 %	170288112
6539	NC_010483	TCG	2	6	293437	293442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288112
6540	NC_010483	AT	3	6	293466	293471	50 %	50 %	0 %	0 %	170288112
6541	NC_010483	T	6	6	293505	293510	0 %	100 %	0 %	0 %	170288112
6542	NC_010483	TTC	2	6	293561	293566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288112
6543	NC_010483	TTG	2	6	293635	293640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288112
6544	NC_010483	GTT	2	6	293726	293731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288112
6545	NC_010483	ATC	2	6	293748	293753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288112
6546	NC_010483	AAG	2	6	293784	293789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288112
6547	NC_010483	CT	3	6	293817	293822	0 %	50 %	0 %	50 %	170288112
6548	NC_010483	AT	3	6	293885	293890	50 %	50 %	0 %	0 %	170288112
6549	NC_010483	TA	3	6	293922	293927	50 %	50 %	0 %	0 %	170288112
6550	NC_010483	TGT	2	6	294092	294097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288112
6551	NC_010483	A	6	6	294189	294194	100 %	0 %	0 %	0 %	170288112
6552	NC_010483	ACAA	2	8	294199	294206	75 %	0 %	0 %	25 %	170288112
6553	NC_010483	TAT	2	6	294219	294224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288112
6554	NC_010483	ACA	2	6	294339	294344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288112
6555	NC_010483	ATC	2	6	294450	294455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288112
6556	NC_010483	AGC	2	6	294515	294520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288112
6557	NC_010483	AAGGT	2	10	294650	294659	40 %	20 %	40 %	0 %	170288113
6558	NC_010483	GA	3	6	294733	294738	50 %	0 %	50 %	0 %	170288113
6559	NC_010483	A	7	7	294747	294753	100 %	0 %	0 %	0 %	170288113
6560	NC_010483	GAA	2	6	294861	294866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288113
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6563	NC_010483	TCG	2	6	295055	295060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288113
6564	NC_010483	TGA	2	6	295095	295100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288113
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6566	NC_010483	A	7	7	295167	295173	100 %	0 %	0 %	0 %	170288113
6567	NC_010483	TA	3	6	295189	295194	50 %	50 %	0 %	0 %	170288113
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6572	NC_010483	AG	3	6	295336	295341	50 %	0 %	50 %	0 %	170288113
6573	NC_010483	GTG	2	6	295370	295375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288113
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6592	NC_010483	TG	3	6	296252	296257	0 %	50 %	50 %	0 %	170288113
6593	NC_010483	AAG	2	6	296270	296275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288113
6594	NC_010483	CT	3	6	296280	296285	0 %	50 %	0 %	50 %	170288113
6595	NC_010483	T	6	6	296370	296375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_010483	TGC	2	6	296394	296399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_010483	TTCG	2	8	296457	296464	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6598	NC_010483	A	6	6	296680	296685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_010483	AGT	2	6	296698	296703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6602	NC_010483	CAGA	2	8	296837	296844	50 %	0 %	25 %	25 %	170288114
6603	NC_010483	TA	3	6	296860	296865	50 %	50 %	0 %	0 %	170288114
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6609	NC_010483	G	6	6	297073	297078	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_010483	A	6	6	297098	297103	100 %	0 %	0 %	0 %	170288115
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6622	NC_010483	T	6	6	297403	297408	0 %	100 %	0 %	0 %	170288115
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6999	NC_010483	TCC	2	6	315208	315213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288134
7000	NC_010483	ACTCG	2	10	315217	315226	20 %	20 %	20 %	40 %	170288134

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