MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010483	TCA	2	6	247466	247471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288061
5502	NC_010483	GA	3	6	247487	247492	50 %	0 %	50 %	0 %	170288061
5503	NC_010483	CGC	2	6	247500	247505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288061
5504	NC_010483	T	6	6	247513	247518	0 %	100 %	0 %	0 %	170288061
5505	NC_010483	CTG	2	6	247535	247540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288061
5506	NC_010483	ATC	2	6	247546	247551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288061
5507	NC_010483	TC	3	6	247583	247588	0 %	50 %	0 %	50 %	170288062
5508	NC_010483	AGA	2	6	247593	247598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288062
5509	NC_010483	CAGAA	2	10	247628	247637	60 %	0 %	20 %	20 %	170288062
5510	NC_010483	CAT	2	6	247652	247657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288062
5511	NC_010483	TGT	2	6	247732	247737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288062
5512	NC_010483	CTT	2	6	247768	247773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288062
5513	NC_010483	CACC	2	8	247867	247874	25 %	0 %	0 %	75 %	170288062
5514	NC_010483	AGCG	2	8	247973	247980	25 %	0 %	50 %	25 %	170288062
5515	NC_010483	CTT	2	6	248063	248068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288062
5516	NC_010483	CAA	2	6	248140	248145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288062
5517	NC_010483	TTCTTT	2	12	248186	248197	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	170288062
5518	NC_010483	TCT	2	6	248215	248220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288062
5519	NC_010483	AGT	2	6	248257	248262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288062
5520	NC_010483	CTC	2	6	248349	248354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288062
5521	NC_010483	TTA	2	6	248449	248454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288062
5522	NC_010483	A	7	7	248454	248460	100 %	0 %	0 %	0 %	170288062
5523	NC_010483	A	6	6	248466	248471	100 %	0 %	0 %	0 %	170288062
5524	NC_010483	CCTC	2	8	248502	248509	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5525	NC_010483	ATCT	2	8	248531	248538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_010483	GAAA	2	8	248678	248685	75 %	0 %	25 %	0 %	170288063
5527	NC_010483	GA	3	6	248706	248711	50 %	0 %	50 %	0 %	170288063
5528	NC_010483	TGA	2	6	248733	248738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288063
5529	NC_010483	GAC	2	6	248810	248815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288063
5530	NC_010483	AAG	2	6	248820	248825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288063
5531	NC_010483	AGAA	2	8	248836	248843	75 %	0 %	25 %	0 %	170288063
5532	NC_010483	GAA	2	6	248872	248877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288063
5533	NC_010483	GAAAA	2	10	248880	248889	80 %	0 %	20 %	0 %	170288063
5534	NC_010483	CTC	2	6	248907	248912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288063
5535	NC_010483	TCT	2	6	248923	248928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288063
5536	NC_010483	GTT	2	6	248936	248941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288063
5537	NC_010483	A	6	6	248973	248978	100 %	0 %	0 %	0 %	170288063
5538	NC_010483	G	6	6	248987	248992	0 %	0 %	100 %	0 %	170288063
5539	NC_010483	AGC	2	6	249003	249008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288063
5540	NC_010483	GAA	2	6	249021	249026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288064
5541	NC_010483	AGA	2	6	249186	249191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288064
5542	NC_010483	ATC	2	6	249192	249197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288064
5543	NC_010483	TC	3	6	249226	249231	0 %	50 %	0 %	50 %	170288064
5544	NC_010483	A	6	6	249266	249271	100 %	0 %	0 %	0 %	170288064
5545	NC_010483	CGAAGA	2	12	249317	249328	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	170288064
5546	NC_010483	TGG	2	6	249331	249336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288064
5547	NC_010483	GAC	2	6	249432	249437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288064
5548	NC_010483	CTGG	2	8	249453	249460	0 %	25 %	50 %	25 %	170288064
5549	NC_010483	AG	3	6	249462	249467	50 %	0 %	50 %	0 %	170288064
5550	NC_010483	GGCCAC	2	12	249560	249571	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	170288064
5551	NC_010483	GGT	2	6	249578	249583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288064
5552	NC_010483	A	7	7	249598	249604	100 %	0 %	0 %	0 %	170288064
5553	NC_010483	CTT	2	6	249625	249630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288065
5554	NC_010483	TCG	2	6	249636	249641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288065
5555	NC_010483	CTT	2	6	249675	249680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288065
5556	NC_010483	TAA	2	6	249765	249770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288065
5557	NC_010483	CCG	2	6	249772	249777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288065
5558	NC_010483	CT	4	8	249787	249794	0 %	50 %	0 %	50 %	170288065
5559	NC_010483	CT	3	6	249811	249816	0 %	50 %	0 %	50 %	170288065
5560	NC_010483	CAC	2	6	249842	249847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288065
5561	NC_010483	TCC	2	6	249882	249887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288065
5562	NC_010483	T	6	6	249911	249916	0 %	100 %	0 %	0 %	170288065
5563	NC_010483	CTC	2	6	249917	249922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288065
5564	NC_010483	TC	3	6	249956	249961	0 %	50 %	0 %	50 %	170288065
5565	NC_010483	TCG	2	6	250017	250022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288065
5566	NC_010483	TTTC	2	8	250058	250065	0 %	75 %	0 %	25 %	170288065
5567	NC_010483	TTC	2	6	250094	250099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288065
5568	NC_010483	CCG	2	6	250131	250136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288065
5569	NC_010483	TTC	2	6	250155	250160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288065
5570	NC_010483	GAAA	2	8	250165	250172	75 %	0 %	25 %	0 %	170288065
5571	NC_010483	CGC	2	6	250181	250186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288065
5572	NC_010483	CAC	2	6	250216	250221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288065
5573	NC_010483	ATC	2	6	250269	250274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288065
5574	NC_010483	T	6	6	250364	250369	0 %	100 %	0 %	0 %	170288065
5575	NC_010483	AAG	2	6	250473	250478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288065
5576	NC_010483	ACC	2	6	250494	250499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288065
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5578	NC_010483	TTC	2	6	250601	250606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288065
5579	NC_010483	TCT	2	6	250613	250618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288065
5580	NC_010483	TC	3	6	250624	250629	0 %	50 %	0 %	50 %	170288065
5581	NC_010483	TC	3	6	250691	250696	0 %	50 %	0 %	50 %	170288065
5582	NC_010483	ACG	2	6	250823	250828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288066
5583	NC_010483	GTTC	2	8	250845	250852	0 %	50 %	25 %	25 %	170288066
5584	NC_010483	TGG	2	6	250873	250878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288066
5585	NC_010483	TC	3	6	250937	250942	0 %	50 %	0 %	50 %	170288066
5586	NC_010483	TTC	2	6	250952	250957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288066
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5588	NC_010483	CTT	2	6	251008	251013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288066
5589	NC_010483	GAA	2	6	251030	251035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288066
5590	NC_010483	TCTGA	2	10	251072	251081	20 %	40 %	20 %	20 %	170288066
5591	NC_010483	AAC	2	6	251119	251124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288066
5592	NC_010483	T	7	7	251174	251180	0 %	100 %	0 %	0 %	170288066
5593	NC_010483	GA	3	6	251193	251198	50 %	0 %	50 %	0 %	170288066
5594	NC_010483	GAA	2	6	251206	251211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288066
5595	NC_010483	ACC	2	6	251237	251242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288066
5596	NC_010483	CTTC	2	8	251292	251299	0 %	50 %	0 %	50 %	170288066
5597	NC_010483	CGT	2	6	251301	251306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288066
5598	NC_010483	AGA	2	6	251328	251333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288066
5599	NC_010483	TTC	2	6	251366	251371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288066
5600	NC_010483	CAC	2	6	251398	251403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288066
5601	NC_010483	GAT	2	6	251434	251439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288066
5602	NC_010483	TGCGTG	2	12	251477	251488	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	170288066
5603	NC_010483	CCA	2	6	251490	251495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288066
5604	NC_010483	CTC	2	6	251507	251512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5605	NC_010483	TAC	2	6	251524	251529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_010483	A	6	6	251545	251550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_010483	TGA	2	6	251572	251577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_010483	GGT	2	6	251639	251644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_010483	GTT	3	9	251665	251673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288067
5610	NC_010483	TTC	2	6	251690	251695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288067
5611	NC_010483	CGC	2	6	251761	251766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288067
5612	NC_010483	AG	3	6	251767	251772	50 %	0 %	50 %	0 %	170288067
5613	NC_010483	TCT	2	6	251790	251795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288067
5614	NC_010483	CTTC	2	8	251799	251806	0 %	50 %	0 %	50 %	170288067
5615	NC_010483	TCT	2	6	251838	251843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288067
5616	NC_010483	TTA	2	6	251878	251883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288067
5617	NC_010483	GTGTT	2	10	251892	251901	0 %	60 %	40 %	0 %	170288067
5618	NC_010483	CATC	2	8	251911	251918	25 %	25 %	0 %	50 %	170288067
5619	NC_010483	GTG	2	6	251942	251947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170288067
5620	NC_010483	TGA	2	6	252081	252086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288067
5621	NC_010483	AAC	2	6	252128	252133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288067
5622	NC_010483	GTC	2	6	252155	252160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288067
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5624	NC_010483	GAT	2	6	252236	252241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288067
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5998	NC_010483	GAG	2	6	268313	268318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288088
5999	NC_010483	ACGT	2	8	268326	268333	25 %	25 %	25 %	25 %	170288088
6000	NC_010483	GGA	2	6	268334	268339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288088

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