MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga sp. RQ2 chromosome

Total Repeats: 41425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010483	GAG	2	6	204720	204725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288014
4502	NC_010483	CT	3	6	204740	204745	0 %	50 %	0 %	50 %	170288014
4503	NC_010483	GT	3	6	204792	204797	0 %	50 %	50 %	0 %	170288014
4504	NC_010483	CTT	2	6	204826	204831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288014
4505	NC_010483	CTT	2	6	204859	204864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288014
4506	NC_010483	CAC	2	6	204874	204879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288014
4507	NC_010483	CGA	2	6	204960	204965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288014
4508	NC_010483	ATG	2	6	204980	204985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288014
4509	NC_010483	CAC	2	6	205021	205026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288014
4510	NC_010483	C	6	6	205045	205050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4511	NC_010483	TGT	2	6	205086	205091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288015
4512	NC_010483	TTC	2	6	205261	205266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288015
4513	NC_010483	CTCTT	2	10	205279	205288	0 %	60 %	0 %	40 %	170288015
4514	NC_010483	TTC	2	6	205309	205314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288015
4515	NC_010483	CTT	2	6	205347	205352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288015
4516	NC_010483	CTTCCA	2	12	205398	205409	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	170288015
4517	NC_010483	CAC	3	9	205429	205437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288015
4518	NC_010483	TCT	2	6	205455	205460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288015
4519	NC_010483	CCT	2	6	205461	205466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288016
4520	NC_010483	CCAG	2	8	205467	205474	25 %	0 %	25 %	50 %	170288016
4521	NC_010483	T	7	7	205475	205481	0 %	100 %	0 %	0 %	170288016
4522	NC_010483	T	7	7	205511	205517	0 %	100 %	0 %	0 %	170288016
4523	NC_010483	CCG	2	6	205562	205567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288016
4524	NC_010483	TTC	2	6	205584	205589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288016
4525	NC_010483	TC	3	6	205592	205597	0 %	50 %	0 %	50 %	170288016
4526	NC_010483	TCT	2	6	205610	205615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288016
4527	NC_010483	CAA	2	6	205622	205627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288016
4528	NC_010483	TC	3	6	205635	205640	0 %	50 %	0 %	50 %	170288016
4529	NC_010483	GAA	2	6	205650	205655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288016
4530	NC_010483	AGA	2	6	205670	205675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288016
4531	NC_010483	A	6	6	205695	205700	100 %	0 %	0 %	0 %	170288016
4532	NC_010483	ACCTC	2	10	205738	205747	20 %	20 %	0 %	60 %	170288017
4533	NC_010483	TTC	2	6	205771	205776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288017
4534	NC_010483	TTTCG	2	10	205791	205800	0 %	60 %	20 %	20 %	170288017
4535	NC_010483	TC	4	8	205835	205842	0 %	50 %	0 %	50 %	170288017
4536	NC_010483	GCT	2	6	205876	205881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288017
4537	NC_010483	CTG	2	6	205899	205904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288017
4538	NC_010483	TTC	2	6	205911	205916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288017
4539	NC_010483	TCT	2	6	205926	205931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288017
4540	NC_010483	TCT	2	6	205936	205941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288017
4541	NC_010483	GAA	2	6	205948	205953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288017
4542	NC_010483	ATA	2	6	205975	205980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170288017
4543	NC_010483	CTC	2	6	206078	206083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288017
4544	NC_010483	AGC	2	6	206143	206148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288017
4545	NC_010483	CCG	2	6	206170	206175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288017
4546	NC_010483	TGA	2	6	206255	206260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288017
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4548	NC_010483	GGA	2	6	206277	206282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288017
4549	NC_010483	GAA	2	6	206400	206405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288017
4550	NC_010483	TGA	2	6	206429	206434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288017
4551	NC_010483	TC	3	6	206437	206442	0 %	50 %	0 %	50 %	170288017
4552	NC_010483	TCC	2	6	206488	206493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288017
4553	NC_010483	TTC	2	6	206532	206537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288017
4554	NC_010483	GTT	2	6	206541	206546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288017
4555	NC_010483	TCC	2	6	206659	206664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288017
4556	NC_010483	CCA	2	6	206735	206740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288017
4557	NC_010483	CAC	2	6	206817	206822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288017
4558	NC_010483	GAG	2	6	206952	206957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288017
4559	NC_010483	TCT	2	6	206966	206971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288017
4560	NC_010483	GCC	2	6	206994	206999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170288017
4561	NC_010483	GA	3	6	207017	207022	50 %	0 %	50 %	0 %	170288017
4562	NC_010483	TTC	2	6	207035	207040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288017
4563	NC_010483	TC	3	6	207047	207052	0 %	50 %	0 %	50 %	170288017
4564	NC_010483	GAG	2	6	207159	207164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288017
4565	NC_010483	TTC	2	6	207267	207272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288017
4566	NC_010483	ATG	2	6	207312	207317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288018
4567	NC_010483	TCC	2	6	207326	207331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288018
4568	NC_010483	T	6	6	207367	207372	0 %	100 %	0 %	0 %	170288018
4569	NC_010483	TCT	2	6	207381	207386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288018
4570	NC_010483	ATT	2	6	207401	207406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170288018
4571	NC_010483	AAGAT	2	10	207481	207490	60 %	20 %	20 %	0 %	170288018
4572	NC_010483	CTT	2	6	207501	207506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288018
4573	NC_010483	AAG	2	6	207527	207532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288018
4574	NC_010483	TCGTT	2	10	207540	207549	0 %	60 %	20 %	20 %	170288018
4575	NC_010483	CTT	2	6	207687	207692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288018
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4579	NC_010483	CCTG	2	8	207924	207931	0 %	25 %	25 %	50 %	170288018
4580	NC_010483	GTT	2	6	207944	207949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288018
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4582	NC_010483	CT	3	6	207989	207994	0 %	50 %	0 %	50 %	170288018
4583	NC_010483	GTT	2	6	207995	208000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170288018
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4587	NC_010483	TCC	2	6	208120	208125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170288018
4588	NC_010483	TC	3	6	208193	208198	0 %	50 %	0 %	50 %	170288018
4589	NC_010483	TCTT	2	8	208208	208215	0 %	75 %	0 %	25 %	170288018
4590	NC_010483	GTA	2	6	208258	208263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288018
4591	NC_010483	AG	3	6	208313	208318	50 %	0 %	50 %	0 %	170288018
4592	NC_010483	CAA	2	6	208401	208406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170288018
4593	NC_010483	AGA	2	6	208439	208444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288018
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4595	NC_010483	GAG	2	6	208504	208509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288018
4596	NC_010483	GAG	2	6	208549	208554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288018
4597	NC_010483	T	6	6	208609	208614	0 %	100 %	0 %	0 %	170288018
4598	NC_010483	CTT	2	6	208649	208654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288018
4599	NC_010483	CCA	2	6	208713	208718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288018
4600	NC_010483	CCA	3	9	208758	208766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288018
4601	NC_010483	TCG	2	6	208770	208775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288018
4602	NC_010483	ATG	2	6	208778	208783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170288018
4603	NC_010483	TTC	2	6	208835	208840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288018
4604	NC_010483	TACC	2	8	208848	208855	25 %	25 %	0 %	50 %	170288018
4605	NC_010483	TCA	2	6	208902	208907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288018
4606	NC_010483	CTT	2	6	208917	208922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288018
4607	NC_010483	ACC	2	6	208943	208948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288018
4608	NC_010483	GGA	2	6	208980	208985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170288018
4609	NC_010483	CAC	2	6	208990	208995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170288018
4610	NC_010483	CTT	2	6	209019	209024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288018
4611	NC_010483	TCG	2	6	209033	209038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288018
4612	NC_010483	GT	3	6	209075	209080	0 %	50 %	50 %	0 %	170288018
4613	NC_010483	GA	3	6	209104	209109	50 %	0 %	50 %	0 %	170288018
4614	NC_010483	TTC	2	6	209136	209141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288018
4615	NC_010483	TCT	2	6	209154	209159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288018
4616	NC_010483	TTTCC	2	10	209187	209196	0 %	60 %	0 %	40 %	170288018
4617	NC_010483	CAT	2	6	209197	209202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288018
4618	NC_010483	CAG	2	6	209323	209328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288018
4619	NC_010483	TTC	2	6	209350	209355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288018
4620	NC_010483	GAA	2	6	209438	209443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288018
4621	NC_010483	A	6	6	209442	209447	100 %	0 %	0 %	0 %	170288018
4622	NC_010483	GTC	2	6	209461	209466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170288018
4623	NC_010483	AG	3	6	209469	209474	50 %	0 %	50 %	0 %	170288018
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4991	NC_010483	TAC	2	6	225968	225973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170288037
4992	NC_010483	GAA	2	6	225995	226000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288037
4993	NC_010483	GAGAA	2	10	226006	226015	60 %	0 %	40 %	0 %	170288037
4994	NC_010483	AGA	2	6	226066	226071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288037
4995	NC_010483	CT	3	6	226096	226101	0 %	50 %	0 %	50 %	170288038
4996	NC_010483	GAC	2	6	226108	226113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170288038
4997	NC_010483	CTT	2	6	226140	226145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170288038
4998	NC_010483	GAA	2	6	226156	226161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170288038
4999	NC_010483	TCTG	2	8	226165	226172	0 %	50 %	25 %	25 %	170288038
5000	NC_010483	GT	3	6	226205	226210	0 %	50 %	50 %	0 %	170288038

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