MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 45355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009828	A	7	7	181793	181799	100 %	0 %	0 %	0 %	157363047
4002	NC_009828	CCT	2	6	181817	181822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363048
4003	NC_009828	TA	3	6	181845	181850	50 %	50 %	0 %	0 %	157363048
4004	NC_009828	CCAA	2	8	181878	181885	50 %	0 %	0 %	50 %	157363048
4005	NC_009828	ACC	2	6	182024	182029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363048
4006	NC_009828	TGAT	2	8	182054	182061	25 %	50 %	25 %	0 %	157363048
4007	NC_009828	AT	3	6	182118	182123	50 %	50 %	0 %	0 %	157363048
4008	NC_009828	TCC	2	6	182127	182132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363048
4009	NC_009828	GTC	2	6	182197	182202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363048
4010	NC_009828	T	6	6	182207	182212	0 %	100 %	0 %	0 %	157363048
4011	NC_009828	CAA	2	6	182262	182267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363048
4012	NC_009828	CCT	2	6	182272	182277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_009828	TAT	2	6	182285	182290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_009828	AGA	2	6	182329	182334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_009828	A	6	6	182334	182339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_009828	TA	3	6	182365	182370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_009828	GT	3	6	182470	182475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_009828	TGT	2	6	182555	182560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363049
4019	NC_009828	ACAA	2	8	182680	182687	75 %	0 %	0 %	25 %	157363049
4020	NC_009828	TCG	2	6	182739	182744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363049
4021	NC_009828	CAA	2	6	182854	182859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363049
4022	NC_009828	ACA	2	6	182860	182865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363049
4023	NC_009828	AGT	2	6	182894	182899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363049
4024	NC_009828	AGGT	2	8	182938	182945	25 %	25 %	50 %	0 %	157363049
4025	NC_009828	GATC	2	8	182978	182985	25 %	25 %	25 %	25 %	157363049
4026	NC_009828	GCA	2	6	183084	183089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363049
4027	NC_009828	ACA	2	6	183139	183144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363049
4028	NC_009828	CA	3	6	183147	183152	50 %	0 %	0 %	50 %	157363049
4029	NC_009828	TGT	2	6	183374	183379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363049
4030	NC_009828	GAAA	2	8	183383	183390	75 %	0 %	25 %	0 %	157363049
4031	NC_009828	AGAA	2	8	183429	183436	75 %	0 %	25 %	0 %	157363049
4032	NC_009828	TCG	2	6	183596	183601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363050
4033	NC_009828	ATG	2	6	183617	183622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363050
4034	NC_009828	A	7	7	183666	183672	100 %	0 %	0 %	0 %	157363050
4035	NC_009828	TTG	3	9	183695	183703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363050
4036	NC_009828	A	6	6	183779	183784	100 %	0 %	0 %	0 %	157363050
4037	NC_009828	AAT	2	6	183829	183834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363050
4038	NC_009828	GAA	2	6	183850	183855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363050
4039	NC_009828	TC	4	8	183864	183871	0 %	50 %	0 %	50 %	157363050
4040	NC_009828	A	6	6	183880	183885	100 %	0 %	0 %	0 %	157363050
4041	NC_009828	ATA	2	6	183907	183912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363050
4042	NC_009828	A	6	6	184048	184053	100 %	0 %	0 %	0 %	157363050
4043	NC_009828	GGA	2	6	184060	184065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363050
4044	NC_009828	A	6	6	184065	184070	100 %	0 %	0 %	0 %	157363050
4045	NC_009828	AGT	2	6	184147	184152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363050
4046	NC_009828	TTG	2	6	184178	184183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363050
4047	NC_009828	AGG	2	6	184192	184197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363050
4048	NC_009828	TTG	2	6	184310	184315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363051
4049	NC_009828	ATA	2	6	184351	184356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363051
4050	NC_009828	T	6	6	184503	184508	0 %	100 %	0 %	0 %	157363051
4051	NC_009828	T	6	6	184527	184532	0 %	100 %	0 %	0 %	157363051
4052	NC_009828	TGAA	2	8	184580	184587	50 %	25 %	25 %	0 %	157363051
4053	NC_009828	TAA	2	6	184638	184643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363051
4054	NC_009828	TGA	2	6	184698	184703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363051
4055	NC_009828	A	6	6	184730	184735	100 %	0 %	0 %	0 %	157363051
4056	NC_009828	TTTG	2	8	184740	184747	0 %	75 %	25 %	0 %	157363051
4057	NC_009828	GAA	3	9	184764	184772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363051
4058	NC_009828	TA	3	6	184785	184790	50 %	50 %	0 %	0 %	157363051
4059	NC_009828	GAA	2	6	184807	184812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363051
4060	NC_009828	AGT	2	6	184857	184862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363051
4061	NC_009828	TGG	2	6	184916	184921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363051
4062	NC_009828	AGA	2	6	184932	184937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363051
4063	NC_009828	TAC	2	6	184942	184947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363051
4064	NC_009828	GAA	2	6	184969	184974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363051
4065	NC_009828	A	6	6	185002	185007	100 %	0 %	0 %	0 %	157363051
4066	NC_009828	TTCA	2	8	185030	185037	25 %	50 %	0 %	25 %	157363051
4067	NC_009828	A	6	6	185146	185151	100 %	0 %	0 %	0 %	157363051
4068	NC_009828	AATA	2	8	185157	185164	75 %	25 %	0 %	0 %	157363051
4069	NC_009828	AGA	2	6	185205	185210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363051
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4071	NC_009828	CCA	2	6	185233	185238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363051
4072	NC_009828	T	6	6	185293	185298	0 %	100 %	0 %	0 %	157363051
4073	NC_009828	A	6	6	185314	185319	100 %	0 %	0 %	0 %	157363051
4074	NC_009828	AAAC	2	8	185346	185353	75 %	0 %	0 %	25 %	157363051
4075	NC_009828	GTG	2	6	185399	185404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363051
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4077	NC_009828	TGA	2	6	185466	185471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363051
4078	NC_009828	ATA	2	6	185602	185607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363051
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4080	NC_009828	A	6	6	185697	185702	100 %	0 %	0 %	0 %	157363051
4081	NC_009828	GA	3	6	185760	185765	50 %	0 %	50 %	0 %	157363052
4082	NC_009828	T	6	6	185825	185830	0 %	100 %	0 %	0 %	157363052
4083	NC_009828	TAAC	2	8	185845	185852	50 %	25 %	0 %	25 %	157363052
4084	NC_009828	CAATTT	2	12	185994	186005	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157363052
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4087	NC_009828	ATG	2	6	186117	186122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363052
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4089	NC_009828	GTT	2	6	186246	186251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363052
4090	NC_009828	GAA	2	6	186295	186300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363052
4091	NC_009828	CAA	2	6	186320	186325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363052
4092	NC_009828	ACT	2	6	186364	186369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363052
4093	NC_009828	GCA	2	6	186435	186440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363052
4094	NC_009828	CTG	2	6	186451	186456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363052
4095	NC_009828	AGG	2	6	186497	186502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363052
4096	NC_009828	GGA	2	6	186579	186584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363052
4097	NC_009828	TCT	2	6	186587	186592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363052
4098	NC_009828	GATG	2	8	186706	186713	25 %	25 %	50 %	0 %	157363053
4099	NC_009828	CAAT	2	8	186721	186728	50 %	25 %	0 %	25 %	157363053
4100	NC_009828	CAC	2	6	186759	186764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363053
4101	NC_009828	CAA	2	6	186783	186788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363053
4102	NC_009828	T	7	7	186851	186857	0 %	100 %	0 %	0 %	157363053
4103	NC_009828	TTG	2	6	186884	186889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363053
4104	NC_009828	A	7	7	186903	186909	100 %	0 %	0 %	0 %	157363053
4105	NC_009828	GTGG	2	8	186927	186934	0 %	25 %	75 %	0 %	157363053
4106	NC_009828	GAA	2	6	186963	186968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363053
4107	NC_009828	A	6	6	186967	186972	100 %	0 %	0 %	0 %	157363053
4108	NC_009828	GT	3	6	186982	186987	0 %	50 %	50 %	0 %	157363053
4109	NC_009828	TTA	2	6	187056	187061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363053
4110	NC_009828	A	6	6	187075	187080	100 %	0 %	0 %	0 %	157363053
4111	NC_009828	A	6	6	187094	187099	100 %	0 %	0 %	0 %	157363053
4112	NC_009828	AAT	2	6	187119	187124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363053
4113	NC_009828	A	6	6	187128	187133	100 %	0 %	0 %	0 %	157363053
4114	NC_009828	AGA	2	6	187293	187298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363053
4115	NC_009828	AAG	2	6	187303	187308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363053
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4119	NC_009828	T	6	6	187420	187425	0 %	100 %	0 %	0 %	157363054
4120	NC_009828	TGC	2	6	187475	187480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363054
4121	NC_009828	TGTTC	2	10	187499	187508	0 %	60 %	20 %	20 %	157363054
4122	NC_009828	TTA	2	6	187587	187592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363054
4123	NC_009828	A	7	7	187708	187714	100 %	0 %	0 %	0 %	157363054
4124	NC_009828	AT	3	6	187876	187881	50 %	50 %	0 %	0 %	157363054
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4126	NC_009828	TAA	2	6	187934	187939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363054
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4134	NC_009828	GCT	2	6	188166	188171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363054
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4235	NC_009828	TGGAT	2	10	193018	193027	20 %	40 %	40 %	0 %	157363059
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