MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 45355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_009828	TTC	2	6	2029090	2029095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157364804
43003	NC_009828	A	6	6	2029161	2029166	100 %	0 %	0 %	0 %	157364804
43004	NC_009828	TAAA	2	8	2029210	2029217	75 %	25 %	0 %	0 %	157364804
43005	NC_009828	AAC	2	6	2029267	2029272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157364804
43006	NC_009828	CAA	2	6	2029318	2029323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157364804
43007	NC_009828	TGTC	2	8	2029344	2029351	0 %	50 %	25 %	25 %	157364804
43008	NC_009828	CAG	2	6	2029392	2029397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157364804
43009	NC_009828	ACC	2	6	2029438	2029443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157364804
43010	NC_009828	A	6	6	2029478	2029483	100 %	0 %	0 %	0 %	157364804
43011	NC_009828	TG	3	6	2029506	2029511	0 %	50 %	50 %	0 %	157364804
43012	NC_009828	AGCCA	2	10	2029528	2029537	40 %	0 %	20 %	40 %	157364804
43013	NC_009828	ACT	2	6	2029541	2029546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157364804
43014	NC_009828	CTTT	2	8	2029585	2029592	0 %	75 %	0 %	25 %	157364804
43015	NC_009828	CCT	2	6	2029623	2029628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157364805
43016	NC_009828	TAA	2	6	2029657	2029662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157364805
43017	NC_009828	TCA	2	6	2029701	2029706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157364805
43018	NC_009828	ACCA	2	8	2029709	2029716	50 %	0 %	0 %	50 %	157364805
43019	NC_009828	ATT	2	6	2029752	2029757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157364805
43020	NC_009828	ATCAA	2	10	2029812	2029821	60 %	20 %	0 %	20 %	157364805
43021	NC_009828	TAA	2	6	2029858	2029863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157364805
43022	NC_009828	T	8	8	2030044	2030051	0 %	100 %	0 %	0 %	157364805
43023	NC_009828	TTG	2	6	2030079	2030084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157364805
43024	NC_009828	TTC	2	6	2030204	2030209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157364805
43025	NC_009828	CAT	2	6	2030230	2030235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157364805
43026	NC_009828	TCA	2	6	2030302	2030307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43027	NC_009828	A	6	6	2030333	2030338	100 %	0 %	0 %	0 %	157364806
43028	NC_009828	TGG	2	6	2030424	2030429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157364806
43029	NC_009828	TCA	2	6	2030468	2030473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157364806
43030	NC_009828	TCTG	2	8	2030568	2030575	0 %	50 %	25 %	25 %	157364806
43031	NC_009828	AGA	2	6	2030601	2030606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157364806
43032	NC_009828	ATT	2	6	2030609	2030614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157364806
43033	NC_009828	AGT	2	6	2030667	2030672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157364806
43034	NC_009828	CAA	2	6	2030693	2030698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157364806
43035	NC_009828	TC	3	6	2030726	2030731	0 %	50 %	0 %	50 %	157364806
43036	NC_009828	CAAG	2	8	2030783	2030790	50 %	0 %	25 %	25 %	157364806
43037	NC_009828	AT	3	6	2030797	2030802	50 %	50 %	0 %	0 %	157364806
43038	NC_009828	GAA	2	6	2030845	2030850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157364806
43039	NC_009828	GATG	2	8	2030884	2030891	25 %	25 %	50 %	0 %	157364806
43040	NC_009828	TC	3	6	2030946	2030951	0 %	50 %	0 %	50 %	157364806
43041	NC_009828	TTATC	2	10	2031033	2031042	20 %	60 %	0 %	20 %	157364806
43042	NC_009828	TGA	2	6	2031051	2031056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157364806
43043	NC_009828	ACA	2	6	2031071	2031076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157364806
43044	NC_009828	TATGA	2	10	2031100	2031109	40 %	40 %	20 %	0 %	157364806
43045	NC_009828	AT	3	6	2031145	2031150	50 %	50 %	0 %	0 %	157364806
43046	NC_009828	ATTA	2	8	2031238	2031245	50 %	50 %	0 %	0 %	157364806
43047	NC_009828	GAT	2	6	2031406	2031411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157364806
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43049	NC_009828	GAT	2	6	2031460	2031465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157364806
43050	NC_009828	ATC	2	6	2031493	2031498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157364806
43051	NC_009828	AG	3	6	2031547	2031552	50 %	0 %	50 %	0 %	157364806
43052	NC_009828	CAGC	2	8	2031581	2031588	25 %	0 %	25 %	50 %	157364806
43053	NC_009828	TGA	2	6	2031612	2031617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157364806
43054	NC_009828	A	6	6	2031626	2031631	100 %	0 %	0 %	0 %	157364806
43055	NC_009828	T	6	6	2031737	2031742	0 %	100 %	0 %	0 %	157364807
43056	NC_009828	GTC	2	6	2031755	2031760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157364807
43057	NC_009828	T	7	7	2031811	2031817	0 %	100 %	0 %	0 %	157364807
43058	NC_009828	CTT	2	6	2031820	2031825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157364807
43059	NC_009828	TCAGTT	2	12	2031876	2031887	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157364807
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43063	NC_009828	ATA	2	6	2032238	2032243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157364807
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43067	NC_009828	CAT	2	6	2032435	2032440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157364807
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43074	NC_009828	T	7	7	2032974	2032980	0 %	100 %	0 %	0 %	157364807
43075	NC_009828	CTTT	2	8	2033189	2033196	0 %	75 %	0 %	25 %	157364808
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43084	NC_009828	AACC	2	8	2033655	2033662	50 %	0 %	0 %	50 %	157364808
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43088	NC_009828	A	7	7	2033836	2033842	100 %	0 %	0 %	0 %	157364808
43089	NC_009828	CAA	2	6	2033856	2033861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157364808
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43092	NC_009828	GTAT	2	8	2033965	2033972	25 %	50 %	25 %	0 %	157364808
43093	NC_009828	AT	3	6	2033984	2033989	50 %	50 %	0 %	0 %	157364808
43094	NC_009828	TTA	2	6	2034026	2034031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157364808
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43098	NC_009828	AGAT	2	8	2034307	2034314	50 %	25 %	25 %	0 %	157364808
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43102	NC_009828	TCCT	2	8	2034480	2034487	0 %	50 %	0 %	50 %	157364809
43103	NC_009828	CCT	2	6	2034509	2034514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157364809
43104	NC_009828	TTC	2	6	2034525	2034530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157364809
43105	NC_009828	TCCTTC	2	12	2034570	2034581	0 %	50 %	0 %	50 %	157364809
43106	NC_009828	TGC	2	6	2034669	2034674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157364809
43107	NC_009828	T	6	6	2034708	2034713	0 %	100 %	0 %	0 %	157364809
43108	NC_009828	ACA	2	6	2034748	2034753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157364809
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43110	NC_009828	CCT	2	6	2034858	2034863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157364810
43111	NC_009828	ATAC	2	8	2035056	2035063	50 %	25 %	0 %	25 %	157364810
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43113	NC_009828	TTA	2	6	2035140	2035145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157364810
43114	NC_009828	AT	3	6	2035244	2035249	50 %	50 %	0 %	0 %	157364810
43115	NC_009828	ATTC	2	8	2035326	2035333	25 %	50 %	0 %	25 %	157364810
43116	NC_009828	CA	3	6	2035334	2035339	50 %	0 %	0 %	50 %	157364810
43117	NC_009828	ATC	2	6	2035348	2035353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157364810
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43353	NC_009828	AATA	2	8	2045375	2045382	75 %	25 %	0 %	0 %	157364821
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