MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 45355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_009828	TGG	2	6	633443	633448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363482
13503	NC_009828	TA	3	6	633491	633496	50 %	50 %	0 %	0 %	157363482
13504	NC_009828	CA	3	6	633502	633507	50 %	0 %	0 %	50 %	157363482
13505	NC_009828	AGA	2	6	633582	633587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363482
13506	NC_009828	AT	3	6	633590	633595	50 %	50 %	0 %	0 %	157363482
13507	NC_009828	TGC	2	6	633605	633610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363482
13508	NC_009828	AAG	2	6	633626	633631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363482
13509	NC_009828	CATT	2	8	633634	633641	25 %	50 %	0 %	25 %	157363482
13510	NC_009828	TCT	2	6	633684	633689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363482
13511	NC_009828	CT	3	6	633714	633719	0 %	50 %	0 %	50 %	157363482
13512	NC_009828	GAA	2	6	633774	633779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363482
13513	NC_009828	TTTC	2	8	633817	633824	0 %	75 %	0 %	25 %	157363482
13514	NC_009828	GTT	2	6	633835	633840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363482
13515	NC_009828	CCT	2	6	633864	633869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363483
13516	NC_009828	AGA	2	6	633874	633879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363483
13517	NC_009828	T	6	6	633883	633888	0 %	100 %	0 %	0 %	157363483
13518	NC_009828	TGT	2	6	633982	633987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363483
13519	NC_009828	T	6	6	634091	634096	0 %	100 %	0 %	0 %	157363483
13520	NC_009828	ACC	2	6	634111	634116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363483
13521	NC_009828	ATC	2	6	634153	634158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363483
13522	NC_009828	CCT	2	6	634210	634215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363483
13523	NC_009828	TTC	2	6	634221	634226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363483
13524	NC_009828	TA	3	6	634246	634251	50 %	50 %	0 %	0 %	157363483
13525	NC_009828	A	6	6	634259	634264	100 %	0 %	0 %	0 %	157363483
13526	NC_009828	T	7	7	634409	634415	0 %	100 %	0 %	0 %	157363483
13527	NC_009828	T	6	6	634452	634457	0 %	100 %	0 %	0 %	157363483
13528	NC_009828	TTCTAT	2	12	634471	634482	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157363483
13529	NC_009828	ATT	2	6	634541	634546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363483
13530	NC_009828	AC	3	6	634547	634552	50 %	0 %	0 %	50 %	157363483
13531	NC_009828	A	7	7	634566	634572	100 %	0 %	0 %	0 %	157363484
13532	NC_009828	A	6	6	634587	634592	100 %	0 %	0 %	0 %	157363484
13533	NC_009828	T	6	6	634599	634604	0 %	100 %	0 %	0 %	157363484
13534	NC_009828	GA	3	6	634650	634655	50 %	0 %	50 %	0 %	157363484
13535	NC_009828	TTC	2	6	634802	634807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363484
13536	NC_009828	ACA	2	6	634837	634842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363484
13537	NC_009828	GGT	2	6	634940	634945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363484
13538	NC_009828	GGA	2	6	634987	634992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363484
13539	NC_009828	TA	3	6	635004	635009	50 %	50 %	0 %	0 %	157363484
13540	NC_009828	TTA	2	6	635105	635110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363484
13541	NC_009828	CGAG	2	8	635147	635154	25 %	0 %	50 %	25 %	157363484
13542	NC_009828	ACC	2	6	635313	635318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363484
13543	NC_009828	ACTA	2	8	635334	635341	50 %	25 %	0 %	25 %	157363484
13544	NC_009828	AAT	2	6	635437	635442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363485
13545	NC_009828	TAT	2	6	635509	635514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363485
13546	NC_009828	CATC	2	8	635535	635542	25 %	25 %	0 %	50 %	157363485
13547	NC_009828	GTT	2	6	635695	635700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363485
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13549	NC_009828	TATC	2	8	635718	635725	25 %	50 %	0 %	25 %	157363485
13550	NC_009828	TGCAT	2	10	635744	635753	20 %	40 %	20 %	20 %	157363485
13551	NC_009828	ATT	2	6	635807	635812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363485
13552	NC_009828	GCA	2	6	635813	635818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363485
13553	NC_009828	T	6	6	635881	635886	0 %	100 %	0 %	0 %	157363485
13554	NC_009828	TGC	2	6	635905	635910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363485
13555	NC_009828	GTT	3	9	635924	635932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363485
13556	NC_009828	CAA	2	6	635952	635957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363485
13557	NC_009828	AT	3	6	636071	636076	50 %	50 %	0 %	0 %	157363485
13558	NC_009828	AGC	2	6	636131	636136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363485
13559	NC_009828	CAT	2	6	636175	636180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363485
13560	NC_009828	CT	3	6	636211	636216	0 %	50 %	0 %	50 %	157363485
13561	NC_009828	TCT	2	6	636221	636226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363485
13562	NC_009828	TGC	2	6	636290	636295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363485
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13564	NC_009828	TCT	2	6	636334	636339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363485
13565	NC_009828	TACCAA	2	12	636342	636353	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	157363485
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13567	NC_009828	T	6	6	636364	636369	0 %	100 %	0 %	0 %	157363485
13568	NC_009828	TGC	2	6	636372	636377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363485
13569	NC_009828	T	6	6	636412	636417	0 %	100 %	0 %	0 %	157363485
13570	NC_009828	AT	3	6	636452	636457	50 %	50 %	0 %	0 %	157363485
13571	NC_009828	TCA	2	6	636623	636628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363486
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13573	NC_009828	T	7	7	636733	636739	0 %	100 %	0 %	0 %	157363486
13574	NC_009828	CAT	2	6	636776	636781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363486
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13576	NC_009828	TGT	2	6	636852	636857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363486
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13579	NC_009828	TCAC	2	8	636982	636989	25 %	25 %	0 %	50 %	157363486
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13588	NC_009828	TAT	3	9	637923	637931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363486
13589	NC_009828	ACGA	2	8	637950	637957	50 %	0 %	25 %	25 %	157363486
13590	NC_009828	CCAT	2	8	637969	637976	25 %	25 %	0 %	50 %	157363486
13591	NC_009828	CTGTT	2	10	638031	638040	0 %	60 %	20 %	20 %	157363486
13592	NC_009828	ATA	2	6	638161	638166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363486
13593	NC_009828	TA	3	6	638196	638201	50 %	50 %	0 %	0 %	157363486
13594	NC_009828	ATT	2	6	638383	638388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363486
13595	NC_009828	GAA	2	6	638418	638423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363486
13596	NC_009828	A	7	7	638458	638464	100 %	0 %	0 %	0 %	157363486
13597	NC_009828	CAA	2	6	638486	638491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363486
13598	NC_009828	TTTTCA	2	12	638504	638515	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157363486
13599	NC_009828	TAAA	2	8	638524	638531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_009828	GTT	2	6	638629	638634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363487
13601	NC_009828	TTTC	2	8	638684	638691	0 %	75 %	0 %	25 %	157363487
13602	NC_009828	TTC	2	6	638757	638762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363487
13603	NC_009828	GTTA	2	8	638799	638806	25 %	50 %	25 %	0 %	157363487
13604	NC_009828	TGC	2	6	638830	638835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363487
13605	NC_009828	CCT	3	9	638877	638885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363487
13606	NC_009828	CTTC	2	8	638896	638903	0 %	50 %	0 %	50 %	157363487
13607	NC_009828	CTC	2	6	638916	638921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363487
13608	NC_009828	AAT	2	6	638978	638983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363487
13609	NC_009828	TAAG	2	8	639034	639041	50 %	25 %	25 %	0 %	157363487
13610	NC_009828	GAT	2	6	639300	639305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363487
13611	NC_009828	AT	3	6	639357	639362	50 %	50 %	0 %	0 %	157363487
13612	NC_009828	CTT	2	6	639527	639532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363487
13613	NC_009828	TCTTCG	2	12	639543	639554	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	157363487
13614	NC_009828	G	6	6	639554	639559	0 %	0 %	100 %	0 %	157363487
13615	NC_009828	T	6	6	639572	639577	0 %	100 %	0 %	0 %	157363487
13616	NC_009828	CTT	2	6	639615	639620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363487
13617	NC_009828	A	6	6	639623	639628	100 %	0 %	0 %	0 %	157363487
13618	NC_009828	GCT	2	6	639651	639656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363487
13619	NC_009828	A	6	6	639664	639669	100 %	0 %	0 %	0 %	157363487
13620	NC_009828	ATC	2	6	639687	639692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363488
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13623	NC_009828	CATT	2	8	639748	639755	25 %	50 %	0 %	25 %	157363488
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13743	NC_009828	AGA	2	6	646510	646515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363496
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