MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 45355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_009828	A	6	6	610800	610805	100 %	0 %	0 %	0 %	157363444
13003	NC_009828	AAG	2	6	610822	610827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363444
13004	NC_009828	AG	3	6	610862	610867	50 %	0 %	50 %	0 %	157363444
13005	NC_009828	A	6	6	610952	610957	100 %	0 %	0 %	0 %	157363445
13006	NC_009828	TTA	2	6	610973	610978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363445
13007	NC_009828	GGT	3	9	611039	611047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363445
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13009	NC_009828	TGG	2	6	611326	611331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363445
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13011	NC_009828	GTT	2	6	611456	611461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363445
13012	NC_009828	GAA	2	6	611502	611507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363445
13013	NC_009828	GAA	2	6	611520	611525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363445
13014	NC_009828	GTG	2	6	611574	611579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363445
13015	NC_009828	GAAG	2	8	611582	611589	50 %	0 %	50 %	0 %	157363445
13016	NC_009828	CCAA	2	8	611627	611634	50 %	0 %	0 %	50 %	157363445
13017	NC_009828	AGG	2	6	611704	611709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363445
13018	NC_009828	GTA	2	6	611711	611716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_009828	A	6	6	611736	611741	100 %	0 %	0 %	0 %	157363446
13020	NC_009828	A	7	7	611769	611775	100 %	0 %	0 %	0 %	157363446
13021	NC_009828	GAAAA	2	10	611799	611808	80 %	0 %	20 %	0 %	157363446
13022	NC_009828	GAGCA	2	10	611822	611831	40 %	0 %	40 %	20 %	157363446
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13024	NC_009828	TGGT	2	8	611917	611924	0 %	50 %	50 %	0 %	157363446
13025	NC_009828	CAA	2	6	611947	611952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363446
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13029	NC_009828	GGA	2	6	612017	612022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_009828	GTGA	2	8	612036	612043	25 %	25 %	50 %	0 %	157363447
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13032	NC_009828	ATA	2	6	612103	612108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363447
13033	NC_009828	GTCAG	2	10	612156	612165	20 %	20 %	40 %	20 %	157363447
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13036	NC_009828	TA	3	6	612313	612318	50 %	50 %	0 %	0 %	157363447
13037	NC_009828	GCT	2	6	612325	612330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363447
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13040	NC_009828	TTAGG	2	10	612493	612502	20 %	40 %	40 %	0 %	157363448
13041	NC_009828	GAA	2	6	612539	612544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363448
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13044	NC_009828	AAGTG	2	10	612617	612626	40 %	20 %	40 %	0 %	157363448
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13050	NC_009828	CTT	2	6	612847	612852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363448
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13052	NC_009828	AGG	2	6	613099	613104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_009828	AGC	3	9	613144	613152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363449
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13056	NC_009828	AAG	2	6	613289	613294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363449
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13059	NC_009828	ATT	2	6	613416	613421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363449
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13100	NC_009828	AACA	2	8	614903	614910	75 %	0 %	0 %	25 %	157363454
13101	NC_009828	ATCA	2	8	615183	615190	50 %	25 %	0 %	25 %	157363454
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13104	NC_009828	AAT	2	6	615320	615325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363455
13105	NC_009828	A	6	6	615344	615349	100 %	0 %	0 %	0 %	157363455
13106	NC_009828	GT	3	6	615381	615386	0 %	50 %	50 %	0 %	157363455
13107	NC_009828	AGGG	2	8	615491	615498	25 %	0 %	75 %	0 %	157363455
13108	NC_009828	AGGA	2	8	615626	615633	50 %	0 %	50 %	0 %	157363456
13109	NC_009828	TA	3	6	615652	615657	50 %	50 %	0 %	0 %	157363456
13110	NC_009828	AGAGA	2	10	615707	615716	60 %	0 %	40 %	0 %	157363456
13111	NC_009828	AAG	2	6	615857	615862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363456
13112	NC_009828	TTGGAG	2	12	615872	615883	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	157363456
13113	NC_009828	AT	4	8	615897	615904	50 %	50 %	0 %	0 %	157363456
13114	NC_009828	GAG	2	6	615908	615913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363456
13115	NC_009828	GAA	2	6	615916	615921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13155	NC_009828	AGGA	2	8	617397	617404	50 %	0 %	50 %	0 %	157363459
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13214	NC_009828	AT	3	6	620287	620292	50 %	50 %	0 %	0 %	157363464
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13232	NC_009828	A	7	7	620963	620969	100 %	0 %	0 %	0 %	157363465
13233	NC_009828	TAGA	2	8	620971	620978	50 %	25 %	25 %	0 %	157363465
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13489	NC_009828	CAG	2	6	632823	632828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363481
13490	NC_009828	CCA	2	6	632872	632877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363481
13491	NC_009828	AAT	2	6	632906	632911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363481
13492	NC_009828	T	7	7	632938	632944	0 %	100 %	0 %	0 %	157363481
13493	NC_009828	TGC	2	6	633010	633015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363481
13494	NC_009828	AATT	2	8	633030	633037	50 %	50 %	0 %	0 %	157363481
13495	NC_009828	CCA	2	6	633130	633135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363481
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13497	NC_009828	TTTC	2	8	633208	633215	0 %	75 %	0 %	25 %	157363481
13498	NC_009828	CTG	2	6	633218	633223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363481
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13500	NC_009828	CAT	2	6	633370	633375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363482

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