MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 45355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_009828	TA	4	8	518607	518614	50 %	50 %	0 %	0 %	157363351
11003	NC_009828	TC	3	6	518675	518680	0 %	50 %	0 %	50 %	157363351
11004	NC_009828	CAA	2	6	518688	518693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363351
11005	NC_009828	TCT	2	6	518696	518701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363351
11006	NC_009828	TGA	2	6	518764	518769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363351
11007	NC_009828	GT	3	6	518813	518818	0 %	50 %	50 %	0 %	157363351
11008	NC_009828	T	6	6	518834	518839	0 %	100 %	0 %	0 %	157363351
11009	NC_009828	GAT	2	6	519001	519006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363351
11010	NC_009828	GAA	2	6	519035	519040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363351
11011	NC_009828	TAA	2	6	519139	519144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363351
11012	NC_009828	GAA	2	6	519162	519167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363351
11013	NC_009828	AAC	2	6	519181	519186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363351
11014	NC_009828	TTGAA	2	10	519205	519214	40 %	40 %	20 %	0 %	157363351
11015	NC_009828	GT	3	6	519234	519239	0 %	50 %	50 %	0 %	157363351
11016	NC_009828	AAC	2	6	519307	519312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363351
11017	NC_009828	GTC	2	6	519314	519319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363351
11018	NC_009828	T	6	6	519370	519375	0 %	100 %	0 %	0 %	157363352
11019	NC_009828	TCC	2	6	519377	519382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363352
11020	NC_009828	TCT	2	6	519414	519419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363352
11021	NC_009828	TTTC	2	8	519457	519464	0 %	75 %	0 %	25 %	157363352
11022	NC_009828	TCC	2	6	519528	519533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363352
11023	NC_009828	AAC	2	6	519549	519554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363352
11024	NC_009828	TCC	2	6	519603	519608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363352
11025	NC_009828	ACC	2	6	519609	519614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363352
11026	NC_009828	ATT	2	6	519676	519681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363352
11027	NC_009828	GTT	2	6	519700	519705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363352
11028	NC_009828	AT	4	8	519741	519748	50 %	50 %	0 %	0 %	157363352
11029	NC_009828	T	6	6	519789	519794	0 %	100 %	0 %	0 %	157363352
11030	NC_009828	GAT	2	6	519911	519916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363352
11031	NC_009828	TG	3	6	519922	519927	0 %	50 %	50 %	0 %	157363352
11032	NC_009828	TTC	2	6	519969	519974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363352
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11034	NC_009828	GA	3	6	520105	520110	50 %	0 %	50 %	0 %	157363352
11035	NC_009828	GTTT	2	8	520127	520134	0 %	75 %	25 %	0 %	157363352
11036	NC_009828	TCT	2	6	520203	520208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363352
11037	NC_009828	AGT	2	6	520252	520257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363352
11038	NC_009828	ATCA	2	8	520323	520330	50 %	25 %	0 %	25 %	157363352
11039	NC_009828	TAG	2	6	520423	520428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363352
11040	NC_009828	CTT	2	6	520502	520507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363352
11041	NC_009828	GAA	2	6	520508	520513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363352
11042	NC_009828	TTC	2	6	520579	520584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363352
11043	NC_009828	TC	3	6	520606	520611	0 %	50 %	0 %	50 %	157363352
11044	NC_009828	TAC	2	6	520615	520620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_009828	T	6	6	520668	520673	0 %	100 %	0 %	0 %	157363353
11046	NC_009828	CAAT	2	8	520675	520682	50 %	25 %	0 %	25 %	157363353
11047	NC_009828	T	6	6	520688	520693	0 %	100 %	0 %	0 %	157363353
11048	NC_009828	T	7	7	520702	520708	0 %	100 %	0 %	0 %	157363353
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11050	NC_009828	TAC	2	6	520760	520765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363353
11051	NC_009828	TCTA	2	8	520772	520779	25 %	50 %	0 %	25 %	157363353
11052	NC_009828	AAT	2	6	520840	520845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363353
11053	NC_009828	T	7	7	520876	520882	0 %	100 %	0 %	0 %	157363353
11054	NC_009828	ATT	2	6	520884	520889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363353
11055	NC_009828	CCCA	2	8	520978	520985	25 %	0 %	0 %	75 %	157363353
11056	NC_009828	TTTC	2	8	521008	521015	0 %	75 %	0 %	25 %	157363353
11057	NC_009828	T	7	7	521027	521033	0 %	100 %	0 %	0 %	157363353
11058	NC_009828	CTT	2	6	521034	521039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363353
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11062	NC_009828	TTA	2	6	521208	521213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363354
11063	NC_009828	AG	3	6	521229	521234	50 %	0 %	50 %	0 %	157363354
11064	NC_009828	ACA	2	6	521240	521245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363354
11065	NC_009828	T	6	6	521248	521253	0 %	100 %	0 %	0 %	157363354
11066	NC_009828	T	7	7	521297	521303	0 %	100 %	0 %	0 %	157363354
11067	NC_009828	CCAG	2	8	521365	521372	25 %	0 %	25 %	50 %	157363354
11068	NC_009828	T	7	7	521396	521402	0 %	100 %	0 %	0 %	157363354
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11071	NC_009828	AAG	2	6	521434	521439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363354
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11073	NC_009828	AACC	2	8	521555	521562	50 %	0 %	0 %	50 %	157363355
11074	NC_009828	TGAGCT	2	12	521591	521602	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157363355
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11080	NC_009828	ATG	2	6	521918	521923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363355
11081	NC_009828	TTGC	2	8	522055	522062	0 %	50 %	25 %	25 %	157363355
11082	NC_009828	AT	3	6	522095	522100	50 %	50 %	0 %	0 %	157363355
11083	NC_009828	AG	3	6	522108	522113	50 %	0 %	50 %	0 %	157363355
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11089	NC_009828	ATT	2	6	522358	522363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363355
11090	NC_009828	CAA	2	6	522419	522424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363355
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11094	NC_009828	GTT	2	6	522580	522585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363355
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11096	NC_009828	A	7	7	522667	522673	100 %	0 %	0 %	0 %	157363355
11097	NC_009828	TGG	3	9	522719	522727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363355
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11100	NC_009828	A	7	7	522821	522827	100 %	0 %	0 %	0 %	157363356
11101	NC_009828	AGA	2	6	522866	522871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363356
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11103	NC_009828	TTG	2	6	522919	522924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363356
11104	NC_009828	ATTTC	2	10	522948	522957	20 %	60 %	0 %	20 %	157363356
11105	NC_009828	AT	3	6	522959	522964	50 %	50 %	0 %	0 %	157363356
11106	NC_009828	TGCT	2	8	522973	522980	0 %	50 %	25 %	25 %	157363356
11107	NC_009828	GTT	2	6	523103	523108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363356
11108	NC_009828	ACG	2	6	523201	523206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363356
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11110	NC_009828	AAC	2	6	523242	523247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363356
11111	NC_009828	AAC	2	6	523375	523380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363356
11112	NC_009828	AGG	2	6	523408	523413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363356
11113	NC_009828	T	6	6	523453	523458	0 %	100 %	0 %	0 %	157363357
11114	NC_009828	A	7	7	523474	523480	100 %	0 %	0 %	0 %	157363357
11115	NC_009828	CTG	2	6	523585	523590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363357
11116	NC_009828	TAT	2	6	523596	523601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363357
11117	NC_009828	GAA	2	6	523620	523625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363357
11118	NC_009828	CT	3	6	523637	523642	0 %	50 %	0 %	50 %	157363357
11119	NC_009828	ATA	2	6	523689	523694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363357
11120	NC_009828	TGG	3	9	523700	523708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363357
11121	NC_009828	A	6	6	523748	523753	100 %	0 %	0 %	0 %	157363357
11122	NC_009828	CTA	2	6	523825	523830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363357
11123	NC_009828	GAT	2	6	523875	523880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363357
11124	NC_009828	A	6	6	523890	523895	100 %	0 %	0 %	0 %	157363357
11125	NC_009828	GATC	2	8	523934	523941	25 %	25 %	25 %	25 %	157363357
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11131	NC_009828	CCAT	2	8	524547	524554	25 %	25 %	0 %	50 %	157363358
11132	NC_009828	TA	3	6	524653	524658	50 %	50 %	0 %	0 %	157363358
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11245	NC_009828	CTT	2	6	529539	529544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363362
11246	NC_009828	ACT	2	6	529549	529554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363362
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11251	NC_009828	ACC	2	6	529889	529894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363362
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11253	NC_009828	GTC	2	6	530000	530005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363362
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11260	NC_009828	CTG	2	6	530598	530603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363362
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11263	NC_009828	GTC	2	6	530839	530844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363362
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11275	NC_009828	GA	3	6	531578	531583	50 %	0 %	50 %	0 %	157363362
11276	NC_009828	AAC	2	6	531607	531612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363362
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11281	NC_009828	T	6	6	531988	531993	0 %	100 %	0 %	0 %	157363362
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11325	NC_009828	CTTC	2	8	533929	533936	0 %	50 %	0 %	50 %	157363365
11326	NC_009828	ATC	2	6	533971	533976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363365
11327	NC_009828	TGA	2	6	534032	534037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363365
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11330	NC_009828	GAT	2	6	534140	534145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11332	NC_009828	T	6	6	534183	534188	0 %	100 %	0 %	0 %	157363366
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11336	NC_009828	TAT	2	6	534455	534460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363366
11337	NC_009828	ATT	2	6	534497	534502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363366
11338	NC_009828	AAT	2	6	534606	534611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363366
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11344	NC_009828	T	7	7	534986	534992	0 %	100 %	0 %	0 %	157363366
11345	NC_009828	GTT	2	6	534997	535002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363366
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11348	NC_009828	TATC	2	8	535108	535115	25 %	50 %	0 %	25 %	157363366
11349	NC_009828	CT	3	6	535153	535158	0 %	50 %	0 %	50 %	157363367
11350	NC_009828	TTCACT	2	12	535168	535179	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	157363367
11351	NC_009828	TAT	2	6	535350	535355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363367
11352	NC_009828	T	6	6	535359	535364	0 %	100 %	0 %	0 %	157363367
11353	NC_009828	TAT	2	6	535376	535381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363367
11354	NC_009828	TGA	2	6	535382	535387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363367
11355	NC_009828	ATT	2	6	535492	535497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363367
11356	NC_009828	CAA	2	6	535523	535528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363367
11357	NC_009828	AGA	2	6	535531	535536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363367
11358	NC_009828	CAG	2	6	535551	535556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363367
11359	NC_009828	TTC	2	6	535702	535707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363368
11360	NC_009828	CTT	2	6	535734	535739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363368
11361	NC_009828	TGCC	2	8	535813	535820	0 %	25 %	25 %	50 %	157363368
11362	NC_009828	CTT	2	6	535833	535838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363368
11363	NC_009828	CT	3	6	535842	535847	0 %	50 %	0 %	50 %	157363368
11364	NC_009828	ACTA	2	8	535849	535856	50 %	25 %	0 %	25 %	157363368
11365	NC_009828	T	7	7	535863	535869	0 %	100 %	0 %	0 %	157363368
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