MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 45355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009828	ATTG	2	8	23673	23680	25 %	50 %	25 %	0 %	157362890
502	NC_009828	GCT	2	6	23686	23691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_009828	GTT	2	6	23748	23753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157362891
504	NC_009828	GAA	2	6	23782	23787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362891
505	NC_009828	TTA	2	6	23874	23879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362891
506	NC_009828	CA	3	6	23949	23954	50 %	0 %	0 %	50 %	157362891
507	NC_009828	ATTC	2	8	23963	23970	25 %	50 %	0 %	25 %	157362891
508	NC_009828	ATT	2	6	24039	24044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362891
509	NC_009828	GAA	2	6	24059	24064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362891
510	NC_009828	CGG	2	6	24158	24163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157362891
511	NC_009828	ATG	2	6	24216	24221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157362891
512	NC_009828	GAT	2	6	24254	24259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157362891
513	NC_009828	TGG	2	6	24280	24285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157362891
514	NC_009828	GGA	2	6	24297	24302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157362891
515	NC_009828	TAG	2	6	24313	24318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157362891
516	NC_009828	AAGT	2	8	24346	24353	50 %	25 %	25 %	0 %	157362891
517	NC_009828	GA	3	6	24379	24384	50 %	0 %	50 %	0 %	157362891
518	NC_009828	TCTT	2	8	24408	24415	0 %	75 %	0 %	25 %	157362891
519	NC_009828	CAA	2	6	24424	24429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362891
520	NC_009828	AG	3	6	24433	24438	50 %	0 %	50 %	0 %	157362891
521	NC_009828	GGA	2	6	24472	24477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009828	A	6	6	24485	24490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009828	CT	3	6	24545	24550	0 %	50 %	0 %	50 %	157362892
524	NC_009828	GTT	2	6	24578	24583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157362892
525	NC_009828	T	6	6	24582	24587	0 %	100 %	0 %	0 %	157362892
526	NC_009828	AAG	2	6	24630	24635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362892
527	NC_009828	ACT	2	6	24639	24644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362892
528	NC_009828	AGG	2	6	24816	24821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157362892
529	NC_009828	AATA	2	8	24831	24838	75 %	25 %	0 %	0 %	157362892
530	NC_009828	TAA	2	6	24896	24901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157362892
531	NC_009828	GCT	2	6	24979	24984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157362892
532	NC_009828	CCA	2	6	25063	25068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157362892
533	NC_009828	AT	3	6	25087	25092	50 %	50 %	0 %	0 %	157362892
534	NC_009828	A	7	7	25136	25142	100 %	0 %	0 %	0 %	157362892
535	NC_009828	GAT	2	6	25152	25157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157362892
536	NC_009828	CAA	2	6	25182	25187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362893
537	NC_009828	T	6	6	25314	25319	0 %	100 %	0 %	0 %	157362893
538	NC_009828	TTC	2	6	25576	25581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362893
539	NC_009828	CTTC	2	8	25590	25597	0 %	50 %	0 %	50 %	157362893
540	NC_009828	TTG	2	6	25726	25731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157362893
541	NC_009828	AGG	2	6	25802	25807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157362893
542	NC_009828	A	6	6	25808	25813	100 %	0 %	0 %	0 %	157362893
543	NC_009828	A	7	7	25890	25896	100 %	0 %	0 %	0 %	157362894
544	NC_009828	C	6	6	25951	25956	0 %	0 %	0 %	100 %	157362894
545	NC_009828	GAA	2	6	25974	25979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362894
546	NC_009828	TGAA	2	8	25985	25992	50 %	25 %	25 %	0 %	157362894
547	NC_009828	TCATA	2	10	25996	26005	40 %	40 %	0 %	20 %	157362894
548	NC_009828	A	7	7	26093	26099	100 %	0 %	0 %	0 %	157362894
549	NC_009828	TAT	2	6	26203	26208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362894
550	NC_009828	AAGC	2	8	26255	26262	50 %	0 %	25 %	25 %	157362894
551	NC_009828	A	6	6	26267	26272	100 %	0 %	0 %	0 %	157362894
552	NC_009828	GAA	2	6	26298	26303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362894
553	NC_009828	AAT	2	6	26319	26324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157362894
554	NC_009828	CTA	2	6	26387	26392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362894
555	NC_009828	TTGTA	2	10	26409	26418	20 %	60 %	20 %	0 %	157362894
556	NC_009828	TTAC	2	8	26472	26479	25 %	50 %	0 %	25 %	157362894
557	NC_009828	ATCC	2	8	26486	26493	25 %	25 %	0 %	50 %	157362894
558	NC_009828	ACA	2	6	26534	26539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362894
559	NC_009828	TGGA	2	8	26544	26551	25 %	25 %	50 %	0 %	157362894
560	NC_009828	TGA	2	6	26571	26576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157362894
561	NC_009828	TCT	2	6	26589	26594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362894
562	NC_009828	AGA	2	6	26716	26721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362894
563	NC_009828	TGGT	2	8	26729	26736	0 %	50 %	50 %	0 %	157362894
564	NC_009828	TCTGG	2	10	26749	26758	0 %	40 %	40 %	20 %	157362894
565	NC_009828	TA	3	6	26785	26790	50 %	50 %	0 %	0 %	157362894
566	NC_009828	GAA	2	6	26806	26811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362894
567	NC_009828	AAG	2	6	26924	26929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362894
568	NC_009828	AAG	2	6	26942	26947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362894
569	NC_009828	TCAAA	2	10	26974	26983	60 %	20 %	0 %	20 %	157362894
570	NC_009828	A	6	6	26999	27004	100 %	0 %	0 %	0 %	157362894
571	NC_009828	AGG	2	6	27041	27046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009828	GAT	2	6	27101	27106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157362895
573	NC_009828	AAC	2	6	27190	27195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362895
574	NC_009828	GCTT	2	8	27204	27211	0 %	50 %	25 %	25 %	157362895
575	NC_009828	GAAA	2	8	27224	27231	75 %	0 %	25 %	0 %	157362895
576	NC_009828	A	7	7	27229	27235	100 %	0 %	0 %	0 %	157362895
577	NC_009828	GAA	2	6	27308	27313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362895
578	NC_009828	ATC	2	6	27340	27345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157362895
579	NC_009828	TTA	2	6	27379	27384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157362895
580	NC_009828	TTC	2	6	27413	27418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362895
581	NC_009828	GGA	2	6	27439	27444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157362895
582	NC_009828	AT	3	6	27452	27457	50 %	50 %	0 %	0 %	157362895
583	NC_009828	ACA	2	6	27462	27467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157362895
584	NC_009828	CAAAT	2	10	27507	27516	60 %	20 %	0 %	20 %	157362895
585	NC_009828	TTG	2	6	27537	27542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157362895
586	NC_009828	CAG	2	6	27553	27558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157362895
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592	NC_009828	A	6	6	27731	27736	100 %	0 %	0 %	0 %	157362895
593	NC_009828	GAG	2	6	27935	27940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157362895
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597	NC_009828	AT	3	6	28129	28134	50 %	50 %	0 %	0 %	157362896
598	NC_009828	AG	3	6	28219	28224	50 %	0 %	50 %	0 %	157362896
599	NC_009828	TTC	3	9	28226	28234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362896
600	NC_009828	AT	3	6	28258	28263	50 %	50 %	0 %	0 %	157362896
601	NC_009828	GGAA	2	8	28277	28284	50 %	0 %	50 %	0 %	157362896
602	NC_009828	TCCT	2	8	28303	28310	0 %	50 %	0 %	50 %	157362896
603	NC_009828	AT	3	6	28324	28329	50 %	50 %	0 %	0 %	157362896
604	NC_009828	GATCT	2	10	28365	28374	20 %	40 %	20 %	20 %	157362896
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608	NC_009828	CT	3	6	28475	28480	0 %	50 %	0 %	50 %	157362896
609	NC_009828	TAG	2	6	28501	28506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157362896
610	NC_009828	GTTT	2	8	28528	28535	0 %	75 %	25 %	0 %	157362896
611	NC_009828	TCT	2	6	28577	28582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362896
612	NC_009828	GTT	2	6	28632	28637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157362896
613	NC_009828	TCT	2	6	28656	28661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157362896
614	NC_009828	GAA	2	6	28747	28752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157362896
615	NC_009828	CCT	2	6	28801	28806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_009828	AG	3	6	28830	28835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_009828	TCA	2	6	28842	28847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_009828	TCAA	2	8	28864	28871	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
619	NC_009828	ATA	2	6	28880	28885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009828	ATG	2	6	28944	28949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_009828	ATT	2	6	28950	28955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_009828	TTTTTC	2	12	28976	28987	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
623	NC_009828	T	6	6	29004	29009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009828	TAT	2	6	29011	29016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_009828	TCG	2	6	29073	29078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_009828	TTC	2	6	29096	29101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_009828	AAT	2	6	29113	29118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_009828	CAT	2	6	29119	29124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_009828	TA	3	6	29147	29152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_009828	AGG	2	6	29159	29164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_009828	GCA	2	6	29174	29179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157362897
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