MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 45355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009828	CTT	2	6	251788	251793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363108
5502	NC_009828	TGA	2	6	251931	251936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363108
5503	NC_009828	T	7	7	251969	251975	0 %	100 %	0 %	0 %	157363108
5504	NC_009828	TAG	2	6	252007	252012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363108
5505	NC_009828	TTC	2	6	252068	252073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363108
5506	NC_009828	GAA	2	6	252134	252139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363108
5507	NC_009828	TTA	2	6	252145	252150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363108
5508	NC_009828	CTT	2	6	252225	252230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363108
5509	NC_009828	ATG	2	6	252279	252284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363108
5510	NC_009828	CTT	2	6	252569	252574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363108
5511	NC_009828	ATA	2	6	252584	252589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363108
5512	NC_009828	AGC	2	6	252671	252676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363108
5513	NC_009828	CTT	2	6	252712	252717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363108
5514	NC_009828	TAT	2	6	252728	252733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363108
5515	NC_009828	TTC	2	6	252758	252763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363108
5516	NC_009828	TCA	2	6	252840	252845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363108
5517	NC_009828	T	6	6	252848	252853	0 %	100 %	0 %	0 %	157363108
5518	NC_009828	TACA	2	8	252875	252882	50 %	25 %	0 %	25 %	157363108
5519	NC_009828	T	6	6	252938	252943	0 %	100 %	0 %	0 %	157363108
5520	NC_009828	TAT	2	6	252974	252979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363108
5521	NC_009828	GAA	2	6	253038	253043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363108
5522	NC_009828	ATT	2	6	253062	253067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363108
5523	NC_009828	CTG	2	6	253117	253122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363108
5524	NC_009828	TG	3	6	253157	253162	0 %	50 %	50 %	0 %	157363108
5525	NC_009828	TGC	2	6	253231	253236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363108
5526	NC_009828	AAT	2	6	253277	253282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363108
5527	NC_009828	TTCTTT	2	12	253295	253306	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	157363108
5528	NC_009828	CT	4	8	253353	253360	0 %	50 %	0 %	50 %	157363108
5529	NC_009828	AAT	2	6	253472	253477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363108
5530	NC_009828	CCT	2	6	253519	253524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363109
5531	NC_009828	A	6	6	253584	253589	100 %	0 %	0 %	0 %	157363109
5532	NC_009828	A	7	7	253645	253651	100 %	0 %	0 %	0 %	157363109
5533	NC_009828	TTG	2	6	253800	253805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363109
5534	NC_009828	TATAAT	2	12	253810	253821	50 %	50 %	0 %	0 %	157363109
5535	NC_009828	CAG	2	6	253866	253871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363109
5536	NC_009828	ATC	2	6	253894	253899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363109
5537	NC_009828	T	6	6	253945	253950	0 %	100 %	0 %	0 %	157363109
5538	NC_009828	TGA	2	6	253960	253965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363109
5539	NC_009828	GCC	2	6	253975	253980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157363109
5540	NC_009828	CGA	2	6	254127	254132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363109
5541	NC_009828	GCC	2	6	254303	254308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157363109
5542	NC_009828	TCT	2	6	254330	254335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363109
5543	NC_009828	ATT	2	6	254342	254347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363109
5544	NC_009828	TTG	2	6	254370	254375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363109
5545	NC_009828	T	6	6	254435	254440	0 %	100 %	0 %	0 %	157363109
5546	NC_009828	CAAGC	2	10	254467	254476	40 %	0 %	20 %	40 %	157363109
5547	NC_009828	ATT	2	6	254522	254527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_009828	AG	4	8	254599	254606	50 %	0 %	50 %	0 %	157363110
5549	NC_009828	AAAG	2	8	254697	254704	75 %	0 %	25 %	0 %	157363110
5550	NC_009828	A	8	8	254745	254752	100 %	0 %	0 %	0 %	157363110
5551	NC_009828	GTA	2	6	254894	254899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363110
5552	NC_009828	TGG	2	6	254914	254919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157363110
5553	NC_009828	G	6	6	254927	254932	0 %	0 %	100 %	0 %	157363110
5554	NC_009828	GAA	2	6	254941	254946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363110
5555	NC_009828	TGC	2	6	254949	254954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363110
5556	NC_009828	AG	3	6	254962	254967	50 %	0 %	50 %	0 %	157363110
5557	NC_009828	T	6	6	254992	254997	0 %	100 %	0 %	0 %	157363111
5558	NC_009828	GTTT	2	8	255002	255009	0 %	75 %	25 %	0 %	157363111
5559	NC_009828	TTG	2	6	255022	255027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363111
5560	NC_009828	AT	3	6	255034	255039	50 %	50 %	0 %	0 %	157363111
5561	NC_009828	A	6	6	255051	255056	100 %	0 %	0 %	0 %	157363111
5562	NC_009828	ATCTC	2	10	255072	255081	20 %	40 %	0 %	40 %	157363111
5563	NC_009828	GATT	2	8	255089	255096	25 %	50 %	25 %	0 %	157363111
5564	NC_009828	ATG	2	6	255107	255112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363111
5565	NC_009828	GTT	2	6	255134	255139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363111
5566	NC_009828	TAAT	2	8	255173	255180	50 %	50 %	0 %	0 %	157363111
5567	NC_009828	CT	3	6	255182	255187	0 %	50 %	0 %	50 %	157363111
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5569	NC_009828	AT	3	6	255263	255268	50 %	50 %	0 %	0 %	157363111
5570	NC_009828	CAG	2	6	255307	255312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363111
5571	NC_009828	TC	3	6	255330	255335	0 %	50 %	0 %	50 %	157363111
5572	NC_009828	GA	3	6	255340	255345	50 %	0 %	50 %	0 %	157363111
5573	NC_009828	ATT	2	6	255485	255490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363111
5574	NC_009828	GAA	2	6	255520	255525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363111
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5576	NC_009828	TGA	2	6	255720	255725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363111
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5578	NC_009828	A	7	7	255854	255860	100 %	0 %	0 %	0 %	157363111
5579	NC_009828	GAAG	2	8	255934	255941	50 %	0 %	50 %	0 %	157363111
5580	NC_009828	TTC	2	6	255954	255959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363111
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5582	NC_009828	A	7	7	256179	256185	100 %	0 %	0 %	0 %	157363111
5583	NC_009828	TTA	2	6	256203	256208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363111
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5590	NC_009828	CG	3	6	256391	256396	0 %	0 %	50 %	50 %	157363111
5591	NC_009828	AGG	2	6	256536	256541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363111
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5593	NC_009828	TCC	2	6	256630	256635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363111
5594	NC_009828	TAT	2	6	256728	256733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363111
5595	NC_009828	AGA	2	6	256761	256766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363111
5596	NC_009828	CGA	2	6	256797	256802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363111
5597	NC_009828	AT	3	6	256814	256819	50 %	50 %	0 %	0 %	157363111
5598	NC_009828	A	6	6	256868	256873	100 %	0 %	0 %	0 %	157363111
5599	NC_009828	ATCA	2	8	256896	256903	50 %	25 %	0 %	25 %	157363111
5600	NC_009828	T	6	6	256996	257001	0 %	100 %	0 %	0 %	157363112
5601	NC_009828	T	6	6	257185	257190	0 %	100 %	0 %	0 %	157363112
5602	NC_009828	TTC	2	6	257194	257199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363112
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5604	NC_009828	CAC	2	6	257245	257250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363112
5605	NC_009828	ATAA	2	8	257323	257330	75 %	25 %	0 %	0 %	157363112
5606	NC_009828	TTCT	2	8	257343	257350	0 %	75 %	0 %	25 %	157363112
5607	NC_009828	TGC	3	9	257374	257382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363112
5608	NC_009828	CTG	2	6	257394	257399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363112
5609	NC_009828	TTGA	2	8	257424	257431	25 %	50 %	25 %	0 %	157363112
5610	NC_009828	CAA	2	6	257484	257489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363112
5611	NC_009828	GAAA	2	8	257536	257543	75 %	0 %	25 %	0 %	157363112
5612	NC_009828	ATCA	2	8	257548	257555	50 %	25 %	0 %	25 %	157363112
5613	NC_009828	CAT	2	6	257580	257585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363112
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5615	NC_009828	TGT	2	6	257623	257628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363112
5616	NC_009828	TCTT	2	8	257656	257663	0 %	75 %	0 %	25 %	157363112
5617	NC_009828	TTC	2	6	257808	257813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363113
5618	NC_009828	AATT	2	8	257834	257841	50 %	50 %	0 %	0 %	157363113
5619	NC_009828	CCA	2	6	257897	257902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363113
5620	NC_009828	CTT	2	6	257906	257911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363113
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5622	NC_009828	CTGATC	2	12	258060	258071	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157363113
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5624	NC_009828	ATC	2	6	258228	258233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363113
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