MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga lettingae TMO chromosome

Total Repeats: 45355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009828	GAG	2	6	205981	205986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_009828	TGG	2	6	206028	206033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_009828	AAG	2	6	206098	206103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_009828	TGC	2	6	206120	206125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_009828	AAC	2	6	206290	206295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_009828	CTT	2	6	206364	206369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_009828	CCA	2	6	206519	206524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_009828	GTT	2	6	206593	206598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_009828	AGA	2	6	206758	206763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_009828	CTT	3	9	206893	206901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_009828	CAA	2	6	206914	206919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_009828	ATC	2	6	206964	206969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_009828	ACTT	2	8	207026	207033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_009828	GTA	2	6	207112	207117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_009828	TG	3	6	207185	207190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_009828	GAT	2	6	207238	207243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_009828	CTG	2	6	207357	207362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_009828	GAACA	2	10	207442	207451	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4519	NC_009828	GTT	2	6	207454	207459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_009828	ATTC	2	8	207504	207511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_009828	ATC	2	6	207514	207519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_009828	TGAA	2	8	207695	207702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_009828	GTT	2	6	207850	207855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_009828	CGATAC	2	12	208161	208172	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_009828	TCA	2	6	208226	208231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_009828	GTT	2	6	208250	208255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_009828	TTG	2	6	208377	208382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_009828	ATA	2	6	208434	208439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_009828	AATA	2	8	208461	208468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_009828	AT	3	6	208491	208496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_009828	A	6	6	208541	208546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_009828	A	6	6	208581	208586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_009828	TAA	2	6	208662	208667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_009828	ATT	2	6	208670	208675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_009828	TA	3	6	208696	208701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_009828	ATT	2	6	208720	208725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_009828	ATCA	2	8	208740	208747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4538	NC_009828	TAT	2	6	208770	208775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_009828	TTC	2	6	208798	208803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_009828	ATG	2	6	208815	208820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_009828	TAA	2	6	208824	208829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_009828	A	6	6	208845	208850	100 %	0 %	0 %	0 %	157363070
4543	NC_009828	TCA	2	6	208851	208856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363070
4544	NC_009828	CTT	2	6	208865	208870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363070
4545	NC_009828	AAT	2	6	208896	208901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363070
4546	NC_009828	A	6	6	208925	208930	100 %	0 %	0 %	0 %	157363070
4547	NC_009828	CTC	2	6	208950	208955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363070
4548	NC_009828	AG	3	6	208992	208997	50 %	0 %	50 %	0 %	157363070
4549	NC_009828	TTA	2	6	209007	209012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363070
4550	NC_009828	T	7	7	209074	209080	0 %	100 %	0 %	0 %	157363070
4551	NC_009828	TCA	2	6	209099	209104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363070
4552	NC_009828	T	6	6	209136	209141	0 %	100 %	0 %	0 %	157363070
4553	NC_009828	TTC	2	6	209167	209172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363070
4554	NC_009828	GTT	2	6	209190	209195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363070
4555	NC_009828	CTTT	2	8	209225	209232	0 %	75 %	0 %	25 %	157363070
4556	NC_009828	T	7	7	209287	209293	0 %	100 %	0 %	0 %	157363070
4557	NC_009828	GAA	2	6	209345	209350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363070
4558	NC_009828	TTTC	2	8	209360	209367	0 %	75 %	0 %	25 %	157363070
4559	NC_009828	TG	3	6	209388	209393	0 %	50 %	50 %	0 %	157363070
4560	NC_009828	GAAA	2	8	209485	209492	75 %	0 %	25 %	0 %	157363070
4561	NC_009828	ATT	2	6	209531	209536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363070
4562	NC_009828	AGAT	2	8	209602	209609	50 %	25 %	25 %	0 %	157363070
4563	NC_009828	GAT	2	6	209643	209648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363070
4564	NC_009828	CAA	3	9	209682	209690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363070
4565	NC_009828	T	7	7	209702	209708	0 %	100 %	0 %	0 %	157363070
4566	NC_009828	CTT	3	9	209724	209732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363070
4567	NC_009828	AAT	2	6	209772	209777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157363070
4568	NC_009828	TTTA	2	8	209812	209819	25 %	75 %	0 %	0 %	157363070
4569	NC_009828	CT	3	6	209824	209829	0 %	50 %	0 %	50 %	157363070
4570	NC_009828	ATT	2	6	209870	209875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363070
4571	NC_009828	TAT	2	6	209959	209964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363070
4572	NC_009828	ACT	2	6	210044	210049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363070
4573	NC_009828	TCT	2	6	210107	210112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363070
4574	NC_009828	GAT	3	9	210132	210140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363070
4575	NC_009828	GTA	2	6	210144	210149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363070
4576	NC_009828	ATT	2	6	210179	210184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363070
4577	NC_009828	TAT	2	6	210211	210216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157363070
4578	NC_009828	GATAAA	2	12	210257	210268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157363070
4579	NC_009828	ATC	2	6	210334	210339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363070
4580	NC_009828	TCT	2	6	210404	210409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363070
4581	NC_009828	ATGCA	2	10	210478	210487	40 %	20 %	20 %	20 %	157363070
4582	NC_009828	GAA	2	6	210503	210508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363070
4583	NC_009828	AGC	2	6	210521	210526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363070
4584	NC_009828	A	6	6	210566	210571	100 %	0 %	0 %	0 %	157363070
4585	NC_009828	ATG	2	6	210745	210750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363070
4586	NC_009828	ACG	2	6	210758	210763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157363070
4587	NC_009828	ATG	2	6	210774	210779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363070
4588	NC_009828	T	6	6	210803	210808	0 %	100 %	0 %	0 %	157363070
4589	NC_009828	GGTA	2	8	210816	210823	25 %	25 %	50 %	0 %	157363070
4590	NC_009828	GAA	2	6	210830	210835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157363070
4591	NC_009828	G	6	6	210837	210842	0 %	0 %	100 %	0 %	157363070
4592	NC_009828	T	6	6	210862	210867	0 %	100 %	0 %	0 %	157363070
4593	NC_009828	TA	3	6	210877	210882	50 %	50 %	0 %	0 %	157363070
4594	NC_009828	TTGA	2	8	210983	210990	25 %	50 %	25 %	0 %	157363070
4595	NC_009828	T	7	7	211011	211017	0 %	100 %	0 %	0 %	157363070
4596	NC_009828	CAA	2	6	211039	211044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363070
4597	NC_009828	ATCC	2	8	211065	211072	25 %	25 %	0 %	50 %	157363070
4598	NC_009828	TCA	2	6	211084	211089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363071
4599	NC_009828	CTC	2	6	211092	211097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157363071
4600	NC_009828	ATG	2	6	211160	211165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363071
4601	NC_009828	CAC	3	9	211281	211289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157363071
4602	NC_009828	GGA	2	6	211291	211296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363071
4603	NC_009828	GTT	2	6	211528	211533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363071
4604	NC_009828	GGA	2	6	211663	211668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157363071
4605	NC_009828	ACT	2	6	211686	211691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363071
4606	NC_009828	TGT	2	6	211692	211697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157363071
4607	NC_009828	TCT	2	6	211842	211847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363072
4608	NC_009828	T	6	6	211867	211872	0 %	100 %	0 %	0 %	157363072
4609	NC_009828	AT	3	6	211906	211911	50 %	50 %	0 %	0 %	157363072
4610	NC_009828	TTTGA	2	10	211916	211925	20 %	60 %	20 %	0 %	157363072
4611	NC_009828	TTC	2	6	211946	211951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363072
4612	NC_009828	CAA	2	6	211961	211966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363072
4613	NC_009828	CTT	2	6	212008	212013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363072
4614	NC_009828	AAC	2	6	212018	212023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157363072
4615	NC_009828	TTCCA	2	10	212080	212089	20 %	40 %	0 %	40 %	157363072
4616	NC_009828	TCT	2	6	212115	212120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363072
4617	NC_009828	TTC	2	6	212198	212203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363072
4618	NC_009828	CTG	2	6	212216	212221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363072
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4621	NC_009828	ATG	2	6	212284	212289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157363072
4622	NC_009828	TCG	2	6	212562	212567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363072
4623	NC_009828	CAT	2	6	212599	212604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157363072
4624	NC_009828	CTG	2	6	212625	212630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157363072
4625	NC_009828	TTC	2	6	212637	212642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157363073
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