MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosipho melanesiensis BI429 chromosome

Total Repeats: 49495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43502	NC_009616	GTTT	2	8	1684443	1684450	0 %	75 %	25 %	0 %	150021569
43503	NC_009616	AAAT	2	8	1684451	1684458	75 %	25 %	0 %	0 %	150021569
43504	NC_009616	AT	3	6	1684457	1684462	50 %	50 %	0 %	0 %	150021569
43505	NC_009616	TAAA	2	8	1684465	1684472	75 %	25 %	0 %	0 %	150021569
43506	NC_009616	ATC	2	6	1684504	1684509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150021569
43507	NC_009616	GTG	2	6	1684595	1684600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150021569
43508	NC_009616	CCA	2	6	1684638	1684643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150021569
43509	NC_009616	TTA	2	6	1684679	1684684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150021569
43510	NC_009616	GCC	2	6	1684702	1684707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150021569
43511	NC_009616	ATT	2	6	1684713	1684718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150021569
43512	NC_009616	ATC	2	6	1684756	1684761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150021569
43513	NC_009616	TAA	2	6	1684791	1684796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150021569
43514	NC_009616	TTC	2	6	1684827	1684832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150021569
43515	NC_009616	TA	4	8	1684848	1684855	50 %	50 %	0 %	0 %	150021569
43516	NC_009616	ACA	2	6	1684871	1684876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150021569
43517	NC_009616	ATT	2	6	1684927	1684932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150021569
43518	NC_009616	TCC	2	6	1684941	1684946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150021569
43519	NC_009616	TAC	2	6	1685019	1685024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150021569
43520	NC_009616	CAT	2	6	1685037	1685042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150021569
43521	NC_009616	T	8	8	1685061	1685068	0 %	100 %	0 %	0 %	150021569
43522	NC_009616	CTC	2	6	1685261	1685266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150021569
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43527	NC_009616	A	7	7	1685478	1685484	100 %	0 %	0 %	0 %	150021569
43528	NC_009616	ATC	2	6	1685512	1685517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150021569
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43532	NC_009616	CCAAA	2	10	1685615	1685624	60 %	0 %	0 %	40 %	150021569
43533	NC_009616	TGC	2	6	1685631	1685636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150021569
43534	NC_009616	TTCC	2	8	1685644	1685651	0 %	50 %	0 %	50 %	150021569
43535	NC_009616	CAA	2	6	1685678	1685683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150021569
43536	NC_009616	CAT	2	6	1685717	1685722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43537	NC_009616	GTT	2	6	1685744	1685749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43538	NC_009616	GT	3	6	1685763	1685768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43539	NC_009616	TA	3	6	1685771	1685776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43540	NC_009616	TA	3	6	1685778	1685783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43541	NC_009616	ACAA	3	12	1685859	1685870	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43542	NC_009616	ATA	2	6	1685921	1685926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43543	NC_009616	A	6	6	1685939	1685944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43544	NC_009616	AGG	2	6	1685951	1685956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43545	NC_009616	ATG	2	6	1686046	1686051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150021570
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43547	NC_009616	TAG	2	6	1686238	1686243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43548	NC_009616	TATTT	2	10	1686276	1686285	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43549	NC_009616	T	6	6	1686283	1686288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43550	NC_009616	GTT	2	6	1686303	1686308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43552	NC_009616	T	6	6	1686331	1686336	0 %	100 %	0 %	0 %	150021571
43553	NC_009616	TTTA	2	8	1686380	1686387	25 %	75 %	0 %	0 %	150021571
43554	NC_009616	ATA	2	6	1686415	1686420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150021571
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43556	NC_009616	TCT	3	9	1686456	1686464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150021571
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43560	NC_009616	T	7	7	1686852	1686858	0 %	100 %	0 %	0 %	150021571
43561	NC_009616	TTTC	2	8	1686897	1686904	0 %	75 %	0 %	25 %	150021571
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43566	NC_009616	TTTCC	2	10	1687172	1687181	0 %	60 %	0 %	40 %	150021571
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43575	NC_009616	GTTT	2	8	1687519	1687526	0 %	75 %	25 %	0 %	150021571
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43577	NC_009616	CCAT	2	8	1687563	1687570	25 %	25 %	0 %	50 %	150021571
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43600	NC_009616	TCCT	2	8	1688523	1688530	0 %	50 %	0 %	50 %	150021572
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43604	NC_009616	T	6	6	1688656	1688661	0 %	100 %	0 %	0 %	150021572
43605	NC_009616	ATT	2	6	1688724	1688729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43606	NC_009616	T	6	6	1688728	1688733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43607	NC_009616	ATT	2	6	1688737	1688742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43608	NC_009616	GAA	2	6	1688774	1688779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150021573
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43611	NC_009616	TAACGC	2	12	1688817	1688828	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150021573
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43613	NC_009616	TTAA	2	8	1688851	1688858	50 %	50 %	0 %	0 %	150021573
43614	NC_009616	CAA	2	6	1688870	1688875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150021573
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