MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosipho melanesiensis BI429 chromosome

Total Repeats: 49495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_009616	CTTTT	2	10	1259965	1259974	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32502	NC_009616	CCA	2	6	1259982	1259987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32503	NC_009616	A	6	6	1260016	1260021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32504	NC_009616	ATA	2	6	1260025	1260030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32505	NC_009616	TAA	2	6	1260123	1260128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32506	NC_009616	ATA	2	6	1260133	1260138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32507	NC_009616	ATA	2	6	1260158	1260163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32508	NC_009616	TAG	2	6	1260173	1260178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32509	NC_009616	ATA	2	6	1260179	1260184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32510	NC_009616	AGG	2	6	1260222	1260227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32511	NC_009616	TACA	2	8	1260233	1260240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32512	NC_009616	AC	3	6	1260257	1260262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32513	NC_009616	AAT	2	6	1260297	1260302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32514	NC_009616	CAG	2	6	1260344	1260349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32515	NC_009616	T	6	6	1260354	1260359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32516	NC_009616	TCA	2	6	1260363	1260368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32517	NC_009616	AGA	2	6	1260376	1260381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32518	NC_009616	AT	3	6	1260382	1260387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32519	NC_009616	AAAG	2	8	1260401	1260408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32520	NC_009616	A	6	6	1260423	1260428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32521	NC_009616	T	8	8	1260480	1260487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32522	NC_009616	TTG	2	6	1260548	1260553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150021133
32523	NC_009616	TTATA	2	10	1260629	1260638	40 %	60 %	0 %	0 %	150021133
32524	NC_009616	AAAT	2	8	1260744	1260751	75 %	25 %	0 %	0 %	150021133
32525	NC_009616	CATT	2	8	1260867	1260874	25 %	50 %	0 %	25 %	150021133
32526	NC_009616	TAAT	2	8	1260956	1260963	50 %	50 %	0 %	0 %	150021134
32527	NC_009616	TTAAA	2	10	1261015	1261024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32528	NC_009616	GTTG	2	8	1261043	1261050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32529	NC_009616	TAA	2	6	1261056	1261061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32530	NC_009616	CAG	2	6	1261083	1261088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32531	NC_009616	CTTG	2	8	1261216	1261223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32532	NC_009616	TAG	2	6	1261241	1261246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32533	NC_009616	A	7	7	1261267	1261273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32534	NC_009616	TAAAG	2	10	1261494	1261503	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32535	NC_009616	GTT	2	6	1261537	1261542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32536	NC_009616	TAAG	2	8	1261556	1261563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32537	NC_009616	A	6	6	1261568	1261573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32538	NC_009616	T	7	7	1261590	1261596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32539	NC_009616	CCT	2	6	1261608	1261613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32540	NC_009616	ATT	2	6	1261636	1261641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32541	NC_009616	TAA	2	6	1261646	1261651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32542	NC_009616	A	6	6	1261659	1261664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32543	NC_009616	A	6	6	1261693	1261698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32544	NC_009616	GGT	2	6	1261750	1261755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32545	NC_009616	TA	3	6	1261763	1261768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32546	NC_009616	TGG	2	6	1261777	1261782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32547	NC_009616	ATTT	2	8	1261834	1261841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32548	NC_009616	TAA	2	6	1261848	1261853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32549	NC_009616	TAA	2	6	1261881	1261886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32550	NC_009616	TG	3	6	1261891	1261896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32551	NC_009616	A	7	7	1261921	1261927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32552	NC_009616	ATAA	2	8	1261952	1261959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32553	NC_009616	A	6	6	1261966	1261971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32554	NC_009616	TAGATA	2	12	1262025	1262036	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32555	NC_009616	TAA	2	6	1262059	1262064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32556	NC_009616	T	6	6	1262066	1262071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32557	NC_009616	TTA	2	6	1262090	1262095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32558	NC_009616	AT	3	6	1262111	1262116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32559	NC_009616	TTA	2	6	1262129	1262134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32560	NC_009616	T	7	7	1262184	1262190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32561	NC_009616	AAC	2	6	1262199	1262204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32562	NC_009616	A	7	7	1262219	1262225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32563	NC_009616	AT	3	6	1262243	1262248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32564	NC_009616	A	7	7	1262282	1262288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32565	NC_009616	A	7	7	1262311	1262317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32566	NC_009616	TA	3	6	1262328	1262333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32567	NC_009616	ATT	2	6	1262353	1262358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32568	NC_009616	T	6	6	1262362	1262367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32569	NC_009616	A	6	6	1262430	1262435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32570	NC_009616	GTT	3	9	1262438	1262446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32571	NC_009616	AATAAA	2	12	1262570	1262581	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32572	NC_009616	A	7	7	1262579	1262585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32573	NC_009616	TAA	2	6	1262593	1262598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32574	NC_009616	AG	3	6	1262719	1262724	50 %	0 %	50 %	0 %	150021135
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32576	NC_009616	GTAC	2	8	1262743	1262750	25 %	25 %	25 %	25 %	150021135
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32607	NC_009616	ATA	2	6	1263893	1263898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150021135
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32611	NC_009616	TAAA	2	8	1263986	1263993	75 %	25 %	0 %	0 %	150021136
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32615	NC_009616	TAT	2	6	1264085	1264090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150021136
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