MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosipho melanesiensis BI429 chromosome

Total Repeats: 49495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_009616	GGATG	2	10	642641	642650	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16502	NC_009616	CGA	2	6	642741	642746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16503	NC_009616	GC	3	6	642877	642882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16504	NC_009616	AGG	2	6	642897	642902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16505	NC_009616	GGT	2	6	642986	642991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16506	NC_009616	TTC	2	6	643029	643034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16507	NC_009616	GCC	2	6	643256	643261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16508	NC_009616	TTCGG	2	10	643274	643283	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16509	NC_009616	CCCCT	2	10	643292	643301	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
16510	NC_009616	TCCCCT	2	12	643434	643445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16511	NC_009616	TCC	2	6	643639	643644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16512	NC_009616	GCTCA	2	10	643653	643662	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16513	NC_009616	CCT	2	6	643735	643740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16514	NC_009616	C	6	6	643745	643750	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16515	NC_009616	GGT	2	6	643769	643774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16516	NC_009616	GAC	2	6	643847	643852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16517	NC_009616	G	6	6	643879	643884	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16518	NC_009616	CTCTC	2	10	643896	643905	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
16519	NC_009616	CAG	2	6	643942	643947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16520	NC_009616	ACC	2	6	643990	643995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16521	NC_009616	ATG	2	6	644092	644097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16522	NC_009616	GCT	2	6	644098	644103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16523	NC_009616	TC	3	6	644159	644164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16524	NC_009616	GTT	2	6	644188	644193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_009616	C	6	6	644282	644287	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16526	NC_009616	ACC	2	6	644319	644324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16527	NC_009616	TCGCTT	2	12	644529	644540	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16528	NC_009616	CTT	2	6	644632	644637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16529	NC_009616	TCGG	2	8	644717	644724	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16530	NC_009616	C	6	6	644753	644758	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16531	NC_009616	T	6	6	644887	644892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16532	NC_009616	CGC	2	6	644939	644944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16533	NC_009616	CTC	2	6	644954	644959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16534	NC_009616	CTT	2	6	645061	645066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16535	NC_009616	CGCT	2	8	645107	645114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16536	NC_009616	CTT	2	6	645151	645156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16537	NC_009616	CCT	2	6	645159	645164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16538	NC_009616	GCC	2	6	645165	645170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16539	NC_009616	ATT	2	6	645238	645243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16540	NC_009616	TGG	3	9	645320	645328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16541	NC_009616	GAG	2	6	645335	645340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16542	NC_009616	AGC	2	6	645423	645428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16543	NC_009616	CTT	2	6	645433	645438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16544	NC_009616	AGG	2	6	645450	645455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16545	NC_009616	ACCT	2	8	645480	645487	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16546	NC_009616	C	6	6	645501	645506	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16547	NC_009616	C	6	6	645533	645538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16548	NC_009616	GT	3	6	645595	645600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16549	NC_009616	CCCA	2	8	645748	645755	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16550	NC_009616	GT	3	6	645765	645770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16551	NC_009616	TCCT	2	8	645812	645819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16552	NC_009616	TCG	2	6	645825	645830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16553	NC_009616	GAC	3	9	645929	645937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16554	NC_009616	CAC	2	6	645942	645947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16555	NC_009616	TCCC	2	8	645977	645984	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16556	NC_009616	ACC	2	6	645998	646003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16557	NC_009616	GGC	2	6	646121	646126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16558	NC_009616	GGA	2	6	646152	646157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16559	NC_009616	CTG	2	6	646289	646294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16560	NC_009616	CAG	2	6	646320	646325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16561	NC_009616	GCC	2	6	646413	646418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16562	NC_009616	GCT	2	6	646477	646482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16564	NC_009616	TCA	2	6	646520	646525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16565	NC_009616	CTG	2	6	646646	646651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16566	NC_009616	GGCC	2	8	646691	646698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16567	NC_009616	CAG	2	6	646780	646785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16569	NC_009616	GGTA	2	8	646865	646872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16570	NC_009616	CCG	2	6	646894	646899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16571	NC_009616	TCC	2	6	646915	646920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16572	NC_009616	AG	3	6	646925	646930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16573	NC_009616	CGC	2	6	646969	646974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16581	NC_009616	AT	3	6	647296	647301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16582	NC_009616	AT	3	6	647314	647319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16593	NC_009616	AAAT	2	8	647681	647688	75 %	25 %	0 %	0 %	150020502
16594	NC_009616	TATT	2	8	647694	647701	25 %	75 %	0 %	0 %	150020502
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16599	NC_009616	A	7	7	647925	647931	100 %	0 %	0 %	0 %	150020502
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16602	NC_009616	AATC	2	8	648031	648038	50 %	25 %	0 %	25 %	150020502
16603	NC_009616	AGA	2	6	648135	648140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150020502
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16605	NC_009616	TA	3	6	648233	648238	50 %	50 %	0 %	0 %	150020502
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16611	NC_009616	AAAG	2	8	648553	648560	75 %	0 %	25 %	0 %	150020502
16612	NC_009616	ATT	2	6	648582	648587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150020502
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16615	NC_009616	GACA	2	8	648664	648671	50 %	0 %	25 %	25 %	150020502
16616	NC_009616	GT	3	6	648695	648700	0 %	50 %	50 %	0 %	150020502
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16622	NC_009616	ATG	2	6	648979	648984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150020502
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16625	NC_009616	A	7	7	649179	649185	100 %	0 %	0 %	0 %	150020502
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16993	NC_009616	T	6	6	662937	662942	0 %	100 %	0 %	0 %	150020515
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