MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosipho melanesiensis BI429 chromosome

Total Repeats: 49495

< Previous12...2425262728293031323334...9899Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_009616	T	8	8	544250	544257	0 %	100 %	0 %	0 %	150020407
14003	NC_009616	AG	3	6	544277	544282	50 %	0 %	50 %	0 %	150020407
14004	NC_009616	T	6	6	544304	544309	0 %	100 %	0 %	0 %	150020407
14005	NC_009616	AT	3	6	544368	544373	50 %	50 %	0 %	0 %	150020407
14006	NC_009616	AGA	2	6	544424	544429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150020407
14007	NC_009616	AT	3	6	544436	544441	50 %	50 %	0 %	0 %	150020407
14008	NC_009616	TAT	2	6	544448	544453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150020407
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14010	NC_009616	GAG	2	6	544479	544484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150020407
14011	NC_009616	CTT	2	6	544515	544520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150020407
14012	NC_009616	T	6	6	544533	544538	0 %	100 %	0 %	0 %	150020407
14013	NC_009616	AT	3	6	544539	544544	50 %	50 %	0 %	0 %	150020407
14014	NC_009616	T	6	6	544582	544587	0 %	100 %	0 %	0 %	150020407
14015	NC_009616	A	7	7	544588	544594	100 %	0 %	0 %	0 %	150020407
14016	NC_009616	TA	3	6	544619	544624	50 %	50 %	0 %	0 %	150020407
14017	NC_009616	A	6	6	544648	544653	100 %	0 %	0 %	0 %	150020407
14018	NC_009616	AAG	2	6	544664	544669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150020407
14019	NC_009616	A	6	6	544689	544694	100 %	0 %	0 %	0 %	150020407
14020	NC_009616	TAT	2	6	544751	544756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150020407
14021	NC_009616	T	6	6	544778	544783	0 %	100 %	0 %	0 %	150020407
14022	NC_009616	AGG	2	6	544793	544798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150020407
14023	NC_009616	GGA	2	6	544835	544840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150020408
14024	NC_009616	T	6	6	544850	544855	0 %	100 %	0 %	0 %	150020408
14025	NC_009616	A	9	9	544872	544880	100 %	0 %	0 %	0 %	150020408
14026	NC_009616	ATA	2	6	544884	544889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150020408
14027	NC_009616	ATTT	2	8	544893	544900	25 %	75 %	0 %	0 %	150020408
14028	NC_009616	ATTA	2	8	544963	544970	50 %	50 %	0 %	0 %	150020408
14029	NC_009616	AGTT	2	8	544995	545002	25 %	50 %	25 %	0 %	150020408
14030	NC_009616	ATTT	2	8	545076	545083	25 %	75 %	0 %	0 %	150020408
14031	NC_009616	CCT	2	6	545113	545118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150020408
14032	NC_009616	TAAAT	2	10	545170	545179	60 %	40 %	0 %	0 %	150020408
14033	NC_009616	TCG	2	6	545208	545213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150020408
14034	NC_009616	TC	3	6	545241	545246	0 %	50 %	0 %	50 %	150020408
14035	NC_009616	A	6	6	545263	545268	100 %	0 %	0 %	0 %	150020408
14036	NC_009616	ATAA	2	8	545273	545280	75 %	25 %	0 %	0 %	150020408
14037	NC_009616	AAT	2	6	545281	545286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150020408
14038	NC_009616	AGA	2	6	545300	545305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150020408
14039	NC_009616	A	7	7	545346	545352	100 %	0 %	0 %	0 %	150020408
14040	NC_009616	ATT	2	6	545357	545362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150020408
14041	NC_009616	TGA	2	6	545425	545430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150020408
14042	NC_009616	A	6	6	545441	545446	100 %	0 %	0 %	0 %	150020408
14043	NC_009616	CT	3	6	545447	545452	0 %	50 %	0 %	50 %	150020408
14044	NC_009616	GGT	2	6	545500	545505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150020409
14045	NC_009616	AT	3	6	545560	545565	50 %	50 %	0 %	0 %	150020409
14046	NC_009616	GCTG	2	8	545604	545611	0 %	25 %	50 %	25 %	150020409
14047	NC_009616	AT	3	6	545646	545651	50 %	50 %	0 %	0 %	150020409
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14055	NC_009616	TGA	2	6	545922	545927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150020409
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14064	NC_009616	TA	4	8	546215	546222	50 %	50 %	0 %	0 %	150020409
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14067	NC_009616	TTA	2	6	546274	546279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150020409
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14099	NC_009616	TAT	2	6	547500	547505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150020411
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14103	NC_009616	AT	3	6	547594	547599	50 %	50 %	0 %	0 %	150020411
14104	NC_009616	A	9	9	547607	547615	100 %	0 %	0 %	0 %	150020411
14105	NC_009616	A	7	7	547628	547634	100 %	0 %	0 %	0 %	150020411
14106	NC_009616	A	6	6	547653	547658	100 %	0 %	0 %	0 %	150020411
14107	NC_009616	TAG	2	6	547705	547710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150020411
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14110	NC_009616	GAAA	2	8	547787	547794	75 %	0 %	25 %	0 %	150020411
14111	NC_009616	A	6	6	547820	547825	100 %	0 %	0 %	0 %	150020411
14112	NC_009616	AAG	2	6	547836	547841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150020411
14113	NC_009616	CATT	2	8	547849	547856	25 %	50 %	0 %	25 %	150020411
14114	NC_009616	GAT	2	6	547884	547889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150020411
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14117	NC_009616	ATA	2	6	547980	547985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150020411
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14120	NC_009616	A	8	8	548096	548103	100 %	0 %	0 %	0 %	150020411
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14124	NC_009616	AT	3	6	548284	548289	50 %	50 %	0 %	0 %	150020411
14125	NC_009616	A	8	8	548295	548302	100 %	0 %	0 %	0 %	150020411
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14227	NC_009616	T	7	7	551428	551434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14244	NC_009616	T	6	6	551958	551963	0 %	100 %	0 %	0 %	150020413
14245	NC_009616	ATTA	2	8	551979	551986	50 %	50 %	0 %	0 %	150020413
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14247	NC_009616	AT	3	6	552011	552016	50 %	50 %	0 %	0 %	150020413
14248	NC_009616	TTGGA	2	10	552056	552065	20 %	40 %	40 %	0 %	150020413
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14251	NC_009616	TAA	2	6	552205	552210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150020413
14252	NC_009616	TCTT	2	8	552249	552256	0 %	75 %	0 %	25 %	150020413
14253	NC_009616	TGC	2	6	552282	552287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150020413
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14268	NC_009616	TCT	2	6	552784	552789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150020413
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14281	NC_009616	TTTA	2	8	553296	553303	25 %	75 %	0 %	0 %	150020413
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14285	NC_009616	T	7	7	553685	553691	0 %	100 %	0 %	0 %	150020413
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14338	NC_009616	GCTA	2	8	556104	556111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14339	NC_009616	ATT	2	6	556118	556123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14340	NC_009616	A	7	7	556156	556162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14354	NC_009616	T	6	6	556553	556558	0 %	100 %	0 %	0 %	150020416
14355	NC_009616	CCT	2	6	556559	556564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150020416
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14357	NC_009616	AT	3	6	556588	556593	50 %	50 %	0 %	0 %	150020416
14358	NC_009616	TA	3	6	556601	556606	50 %	50 %	0 %	0 %	150020416
14359	NC_009616	T	7	7	556699	556705	0 %	100 %	0 %	0 %	150020416
14360	NC_009616	A	6	6	556708	556713	100 %	0 %	0 %	0 %	150020416
14361	NC_009616	T	8	8	556767	556774	0 %	100 %	0 %	0 %	150020416
14362	NC_009616	ATC	2	6	556788	556793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020416
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