MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermosipho melanesiensis BI429 chromosome

Total Repeats: 49495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009616	AGA	3	9	212363	212371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150020109
5502	NC_009616	ACT	2	6	212384	212389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020109
5503	NC_009616	T	6	6	212456	212461	0 %	100 %	0 %	0 %	150020109
5504	NC_009616	TCC	2	6	212516	212521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150020110
5505	NC_009616	AAC	2	6	212541	212546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150020110
5506	NC_009616	TCT	2	6	212617	212622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150020110
5507	NC_009616	ATCT	2	8	212651	212658	25 %	50 %	0 %	25 %	150020110
5508	NC_009616	ACT	2	6	212701	212706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020110
5509	NC_009616	CAT	2	6	212729	212734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020110
5510	NC_009616	TCTCA	2	10	212802	212811	20 %	40 %	0 %	40 %	150020110
5511	NC_009616	ATC	2	6	212835	212840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020110
5512	NC_009616	TC	3	6	212878	212883	0 %	50 %	0 %	50 %	150020111
5513	NC_009616	AAG	2	6	212905	212910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150020111
5514	NC_009616	TCTCT	2	10	212934	212943	0 %	60 %	0 %	40 %	150020111
5515	NC_009616	AAT	2	6	212951	212956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150020111
5516	NC_009616	TGTT	2	8	212984	212991	0 %	75 %	25 %	0 %	150020111
5517	NC_009616	CTTTG	2	10	213001	213010	0 %	60 %	20 %	20 %	150020111
5518	NC_009616	TTTC	2	8	213093	213100	0 %	75 %	0 %	25 %	150020111
5519	NC_009616	CAAG	2	8	213131	213138	50 %	0 %	25 %	25 %	150020111
5520	NC_009616	CAC	2	6	213219	213224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150020111
5521	NC_009616	CAG	2	6	213252	213257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150020111
5522	NC_009616	TCC	2	6	213262	213267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150020111
5523	NC_009616	TAT	2	6	213282	213287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150020111
5524	NC_009616	ATTC	2	8	213294	213301	25 %	50 %	0 %	25 %	150020111
5525	NC_009616	CTA	2	6	213447	213452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020111
5526	NC_009616	CTAT	2	8	213509	213516	25 %	50 %	0 %	25 %	150020111
5527	NC_009616	TTC	2	6	213549	213554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150020111
5528	NC_009616	GCAA	2	8	213566	213573	50 %	0 %	25 %	25 %	150020111
5529	NC_009616	TACATC	2	12	213643	213654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020111
5530	NC_009616	TCT	2	6	213695	213700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150020111
5531	NC_009616	TGG	2	6	213715	213720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150020111
5532	NC_009616	CTA	2	6	213723	213728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020111
5533	NC_009616	TGC	2	6	213793	213798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150020111
5534	NC_009616	CTT	2	6	213813	213818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150020111
5535	NC_009616	CATC	2	8	213831	213838	25 %	25 %	0 %	50 %	150020111
5536	NC_009616	CT	3	6	213865	213870	0 %	50 %	0 %	50 %	150020111
5537	NC_009616	TCA	2	6	213872	213877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020111
5538	NC_009616	CCA	2	6	213884	213889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150020111
5539	NC_009616	CTC	2	6	213897	213902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150020111
5540	NC_009616	CCAACA	2	12	213995	214006	50 %	0 %	0 %	50 %	150020111
5541	NC_009616	CAA	2	6	214014	214019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150020111
5542	NC_009616	GCAA	2	8	214076	214083	50 %	0 %	25 %	25 %	150020111
5543	NC_009616	CAA	2	6	214111	214116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150020111
5544	NC_009616	TTC	2	6	214163	214168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150020111
5545	NC_009616	A	6	6	214169	214174	100 %	0 %	0 %	0 %	150020111
5546	NC_009616	CTA	2	6	214176	214181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020111
5547	NC_009616	TTC	2	6	214192	214197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150020111
5548	NC_009616	CT	3	6	214236	214241	0 %	50 %	0 %	50 %	150020111
5549	NC_009616	T	6	6	214241	214246	0 %	100 %	0 %	0 %	150020111
5550	NC_009616	TAC	2	6	214252	214257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020111
5551	NC_009616	AAAAG	2	10	214279	214288	80 %	0 %	20 %	0 %	150020111
5552	NC_009616	ATT	2	6	214294	214299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150020111
5553	NC_009616	CCA	2	6	214304	214309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150020111
5554	NC_009616	A	6	6	214322	214327	100 %	0 %	0 %	0 %	150020111
5555	NC_009616	ATAA	2	8	214334	214341	75 %	25 %	0 %	0 %	150020111
5556	NC_009616	AGA	2	6	214353	214358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150020111
5557	NC_009616	ACCA	2	8	214429	214436	50 %	0 %	0 %	50 %	150020111
5558	NC_009616	TTAA	2	8	214442	214449	50 %	50 %	0 %	0 %	150020111
5559	NC_009616	CAT	2	6	214524	214529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020111
5560	NC_009616	ACT	2	6	214538	214543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020111
5561	NC_009616	TAG	2	6	214605	214610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150020111
5562	NC_009616	A	6	6	214624	214629	100 %	0 %	0 %	0 %	150020111
5563	NC_009616	A	6	6	214647	214652	100 %	0 %	0 %	0 %	150020111
5564	NC_009616	ATT	2	6	214661	214666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150020111
5565	NC_009616	CAA	2	6	214674	214679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150020111
5566	NC_009616	CAAAA	2	10	214702	214711	80 %	0 %	0 %	20 %	150020111
5567	NC_009616	A	6	6	214708	214713	100 %	0 %	0 %	0 %	150020112
5568	NC_009616	CCT	2	6	214714	214719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150020112
5569	NC_009616	A	6	6	214782	214787	100 %	0 %	0 %	0 %	150020112
5570	NC_009616	ACA	2	6	214789	214794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150020112
5571	NC_009616	TTC	2	6	214820	214825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150020112
5572	NC_009616	CTTT	2	8	214841	214848	0 %	75 %	0 %	25 %	150020112
5573	NC_009616	T	7	7	214868	214874	0 %	100 %	0 %	0 %	150020112
5574	NC_009616	TTTAT	2	10	214882	214891	20 %	80 %	0 %	0 %	150020112
5575	NC_009616	TAA	2	6	214910	214915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150020112
5576	NC_009616	TTA	2	6	214927	214932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150020112
5577	NC_009616	T	6	6	214954	214959	0 %	100 %	0 %	0 %	150020112
5578	NC_009616	A	7	7	215015	215021	100 %	0 %	0 %	0 %	150020112
5579	NC_009616	A	6	6	215044	215049	100 %	0 %	0 %	0 %	150020112
5580	NC_009616	AACT	2	8	215090	215097	50 %	25 %	0 %	25 %	150020112
5581	NC_009616	TGT	2	6	215103	215108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150020112
5582	NC_009616	GTT	2	6	215165	215170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150020112
5583	NC_009616	TGTC	2	8	215175	215182	0 %	50 %	25 %	25 %	150020112
5584	NC_009616	CAA	2	6	215195	215200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150020112
5585	NC_009616	ATC	2	6	215283	215288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020112
5586	NC_009616	ATG	2	6	215333	215338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150020112
5587	NC_009616	AAT	2	6	215361	215366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150020112
5588	NC_009616	TTA	2	6	215434	215439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150020112
5589	NC_009616	TCT	2	6	215452	215457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150020112
5590	NC_009616	TCT	2	6	215461	215466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150020112
5591	NC_009616	A	6	6	215472	215477	100 %	0 %	0 %	0 %	150020112
5592	NC_009616	CAA	2	6	215478	215483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150020112
5593	NC_009616	TAA	2	6	215489	215494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150020112
5594	NC_009616	CCA	2	6	215570	215575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150020112
5595	NC_009616	TGC	2	6	215661	215666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150020112
5596	NC_009616	CTC	2	6	215667	215672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150020112
5597	NC_009616	CTT	2	6	215743	215748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150020112
5598	NC_009616	TCT	2	6	215773	215778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150020112
5599	NC_009616	TTCC	2	8	215784	215791	0 %	50 %	0 %	50 %	150020112
5600	NC_009616	CTC	2	6	215882	215887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150020112
5601	NC_009616	ATC	2	6	215910	215915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150020112
5602	NC_009616	T	6	6	215942	215947	0 %	100 %	0 %	0 %	150020112
5603	NC_009616	A	6	6	215950	215955	100 %	0 %	0 %	0 %	150020112
5604	NC_009616	ATA	2	6	216004	216009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_009616	TAA	2	6	216018	216023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_009616	AGG	2	6	216040	216045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_009616	AACT	2	8	216074	216081	50 %	25 %	0 %	25 %	150020113
5608	NC_009616	GAAGA	2	10	216101	216110	60 %	0 %	40 %	0 %	150020113
5609	NC_009616	GAA	2	6	216203	216208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150020113
5610	NC_009616	GAC	2	6	216271	216276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150020113
5611	NC_009616	T	6	6	216282	216287	0 %	100 %	0 %	0 %	150020113
5612	NC_009616	TGGT	2	8	216299	216306	0 %	50 %	50 %	0 %	150020113
5613	NC_009616	AGATT	2	10	216338	216347	40 %	40 %	20 %	0 %	150020113
5614	NC_009616	ATA	2	6	216355	216360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150020113
5615	NC_009616	TTG	2	6	216365	216370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150020113
5616	NC_009616	GAA	2	6	216463	216468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150020113
5617	NC_009616	TA	3	6	216538	216543	50 %	50 %	0 %	0 %	150020113
5618	NC_009616	A	6	6	216603	216608	100 %	0 %	0 %	0 %	150020113
5619	NC_009616	TTG	2	6	216659	216664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150020113
5620	NC_009616	TA	3	6	216970	216975	50 %	50 %	0 %	0 %	150020113
5621	NC_009616	AAATG	2	10	216984	216993	60 %	20 %	20 %	0 %	150020113
5622	NC_009616	ATG	2	6	217004	217009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150020113
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5624	NC_009616	AT	3	6	217038	217043	50 %	50 %	0 %	0 %	150020113
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5744	NC_009616	AAAAGC	2	12	221229	221240	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150020120
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5999	NC_009616	ATCT	2	8	230159	230166	25 %	50 %	0 %	25 %	150020128
6000	NC_009616	ACGG	2	8	230209	230216	25 %	0 %	50 %	25 %	150020128

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