MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 40184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009486	TG	3	6	181826	181831	0 %	50 %	50 %	0 %	148269332
4002	NC_009486	TTC	2	6	181859	181864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269332
4003	NC_009486	AAG	2	6	181873	181878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269332
4004	NC_009486	GGA	2	6	181895	181900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269332
4005	NC_009486	T	6	6	181927	181932	0 %	100 %	0 %	0 %	148269332
4006	NC_009486	TC	3	6	182003	182008	0 %	50 %	0 %	50 %	148269332
4007	NC_009486	AC	3	6	182098	182103	50 %	0 %	0 %	50 %	148269332
4008	NC_009486	GAA	2	6	182111	182116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269332
4009	NC_009486	GTTT	2	8	182119	182126	0 %	75 %	25 %	0 %	148269332
4010	NC_009486	TGG	2	6	182164	182169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269332
4011	NC_009486	CAT	2	6	182294	182299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269333
4012	NC_009486	A	6	6	182357	182362	100 %	0 %	0 %	0 %	148269333
4013	NC_009486	GGA	2	6	182378	182383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269333
4014	NC_009486	AGA	2	6	182399	182404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269333
4015	NC_009486	GAGTG	2	10	182420	182429	20 %	20 %	60 %	0 %	148269333
4016	NC_009486	TCA	2	6	182441	182446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269333
4017	NC_009486	ATT	2	6	182461	182466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148269333
4018	NC_009486	A	6	6	182469	182474	100 %	0 %	0 %	0 %	148269333
4019	NC_009486	TACGAG	2	12	182520	182531	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148269333
4020	NC_009486	CAAA	2	8	182548	182555	75 %	0 %	0 %	25 %	148269333
4021	NC_009486	A	6	6	182553	182558	100 %	0 %	0 %	0 %	148269333
4022	NC_009486	TCC	2	6	182616	182621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269333
4023	NC_009486	AAG	2	6	182632	182637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269333
4024	NC_009486	CGG	2	6	182648	182653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148269333
4025	NC_009486	AGG	2	6	182710	182715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269333
4026	NC_009486	GAAAA	2	10	182751	182760	80 %	0 %	20 %	0 %	148269334
4027	NC_009486	CGG	2	6	182784	182789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148269334
4028	NC_009486	A	6	6	182812	182817	100 %	0 %	0 %	0 %	148269334
4029	NC_009486	GTT	2	6	182831	182836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269334
4030	NC_009486	GGA	2	6	182902	182907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269334
4031	NC_009486	AC	3	6	182932	182937	50 %	0 %	0 %	50 %	148269334
4032	NC_009486	CA	3	6	182943	182948	50 %	0 %	0 %	50 %	148269334
4033	NC_009486	TGA	2	6	182964	182969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269334
4034	NC_009486	GAAAA	2	10	182979	182988	80 %	0 %	20 %	0 %	148269334
4035	NC_009486	CCA	2	6	183009	183014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269334
4036	NC_009486	TAC	2	6	183029	183034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269334
4037	NC_009486	AGG	2	6	183066	183071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269334
4038	NC_009486	GAA	2	6	183097	183102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269334
4039	NC_009486	ATA	2	6	183104	183109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148269334
4040	NC_009486	AGAA	2	8	183127	183134	75 %	0 %	25 %	0 %	148269334
4041	NC_009486	AGA	2	6	183148	183153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269334
4042	NC_009486	CAA	2	6	183169	183174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269334
4043	NC_009486	CTTC	2	8	183272	183279	0 %	50 %	0 %	50 %	148269334
4044	NC_009486	AGT	2	6	183286	183291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269334
4045	NC_009486	GAA	2	6	183343	183348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269334
4046	NC_009486	GAA	2	6	183422	183427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269334
4047	NC_009486	ACCTC	2	10	183457	183466	20 %	20 %	0 %	60 %	148269334
4048	NC_009486	TTC	2	6	183509	183514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269334
4049	NC_009486	GTC	2	6	183527	183532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269334
4050	NC_009486	TGA	2	6	183546	183551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269334
4051	NC_009486	AGC	2	6	183618	183623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269334
4052	NC_009486	TTC	2	6	183779	183784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269334
4053	NC_009486	GA	3	6	183809	183814	50 %	0 %	50 %	0 %	148269334
4054	NC_009486	CA	3	6	183853	183858	50 %	0 %	0 %	50 %	148269334
4055	NC_009486	AT	3	6	183870	183875	50 %	50 %	0 %	0 %	148269334
4056	NC_009486	CAA	2	6	184023	184028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269334
4057	NC_009486	GAA	2	6	184036	184041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269334
4058	NC_009486	ATG	2	6	184175	184180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269334
4059	NC_009486	ACA	2	6	184215	184220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269334
4060	NC_009486	TGA	2	6	184236	184241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269334
4061	NC_009486	CTGG	2	8	184318	184325	0 %	25 %	50 %	25 %	148269334
4062	NC_009486	ACG	2	6	184368	184373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269334
4063	NC_009486	TC	3	6	184398	184403	0 %	50 %	0 %	50 %	148269334
4064	NC_009486	TCT	2	6	184419	184424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269334
4065	NC_009486	CCG	2	6	184432	184437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148269334
4066	NC_009486	ATA	2	6	184493	184498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148269334
4067	NC_009486	TTG	2	6	184584	184589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269334
4068	NC_009486	GAA	2	6	184669	184674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269335
4069	NC_009486	A	6	6	184691	184696	100 %	0 %	0 %	0 %	148269335
4070	NC_009486	GGA	2	6	184728	184733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269335
4071	NC_009486	T	6	6	184746	184751	0 %	100 %	0 %	0 %	148269335
4072	NC_009486	GAAA	2	8	184752	184759	75 %	0 %	25 %	0 %	148269335
4073	NC_009486	A	7	7	184757	184763	100 %	0 %	0 %	0 %	148269335
4074	NC_009486	AGA	2	6	184791	184796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269335
4075	NC_009486	GAAA	2	8	184820	184827	75 %	0 %	25 %	0 %	148269335
4076	NC_009486	GA	3	6	184883	184888	50 %	0 %	50 %	0 %	148269335
4077	NC_009486	CT	3	6	184894	184899	0 %	50 %	0 %	50 %	148269335
4078	NC_009486	GAT	2	6	184941	184946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269335
4079	NC_009486	AGA	2	6	184962	184967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269335
4080	NC_009486	AG	3	6	184991	184996	50 %	0 %	50 %	0 %	148269335
4081	NC_009486	GAAA	2	8	185021	185028	75 %	0 %	25 %	0 %	148269335
4082	NC_009486	CT	4	8	185050	185057	0 %	50 %	0 %	50 %	148269335
4083	NC_009486	GA	3	6	185061	185066	50 %	0 %	50 %	0 %	148269335
4084	NC_009486	CAT	2	6	185169	185174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269335
4085	NC_009486	ACC	2	6	185234	185239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269335
4086	NC_009486	AAT	2	6	185307	185312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148269335
4087	NC_009486	GT	3	6	185317	185322	0 %	50 %	50 %	0 %	148269335
4088	NC_009486	TAC	2	6	185326	185331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269335
4089	NC_009486	TCG	2	6	185353	185358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269335
4090	NC_009486	AC	3	6	185380	185385	50 %	0 %	0 %	50 %	148269335
4091	NC_009486	AAAG	2	8	185406	185413	75 %	0 %	25 %	0 %	148269335
4092	NC_009486	A	6	6	185422	185427	100 %	0 %	0 %	0 %	148269335
4093	NC_009486	TCT	2	6	185462	185467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269335
4094	NC_009486	GAG	2	6	185497	185502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269336
4095	NC_009486	TCT	2	6	185561	185566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269336
4096	NC_009486	TCTTTC	2	12	185572	185583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269336
4097	NC_009486	TCTGTT	2	12	185591	185602	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148269336
4098	NC_009486	GTC	2	6	185607	185612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269336
4099	NC_009486	TTTC	2	8	185630	185637	0 %	75 %	0 %	25 %	148269336
4100	NC_009486	CTG	2	6	185644	185649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269336
4101	NC_009486	TCCGA	2	10	185663	185672	20 %	20 %	20 %	40 %	148269336
4102	NC_009486	GAGT	2	8	185675	185682	25 %	25 %	50 %	0 %	148269336
4103	NC_009486	GCT	2	6	185689	185694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269336
4104	NC_009486	TTC	2	6	185727	185732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269336
4105	NC_009486	CT	3	6	185757	185762	0 %	50 %	0 %	50 %	148269336
4106	NC_009486	CGCCC	2	10	185797	185806	0 %	0 %	20 %	80 %	148269336
4107	NC_009486	CTT	2	6	185817	185822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269336
4108	NC_009486	T	6	6	185821	185826	0 %	100 %	0 %	0 %	148269336
4109	NC_009486	C	6	6	185959	185964	0 %	0 %	0 %	100 %	148269337
4110	NC_009486	CTTCA	2	10	185997	186006	20 %	40 %	0 %	40 %	148269337
4111	NC_009486	CTT	2	6	186069	186074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269337
4112	NC_009486	TCT	2	6	186086	186091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269337
4113	NC_009486	ATG	2	6	186168	186173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269337
4114	NC_009486	GT	3	6	186320	186325	0 %	50 %	50 %	0 %	148269337
4115	NC_009486	ACC	2	6	186360	186365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269337
4116	NC_009486	GT	3	6	186396	186401	0 %	50 %	50 %	0 %	148269337
4117	NC_009486	TTC	2	6	186415	186420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269337
4118	NC_009486	T	6	6	186426	186431	0 %	100 %	0 %	0 %	148269337
4119	NC_009486	CTT	2	6	186434	186439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269337
4120	NC_009486	ATG	2	6	186571	186576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269337
4121	NC_009486	ACC	2	6	186595	186600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269337
4122	NC_009486	ATC	2	6	186616	186621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269337
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4249	NC_009486	AGA	2	6	192398	192403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269344
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4278	NC_009486	GAT	2	6	193757	193762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269345
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4355	NC_009486	ATCT	2	8	197464	197471	25 %	50 %	0 %	25 %	148269347
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4373	NC_009486	CGT	2	6	198033	198038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269348
4374	NC_009486	CTC	2	6	198156	198161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269348
4375	NC_009486	GCT	2	6	198227	198232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269348
4376	NC_009486	GCT	2	6	198239	198244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269348
4377	NC_009486	TTC	2	6	198245	198250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269348
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4393	NC_009486	ACCA	2	8	198896	198903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4394	NC_009486	TAC	2	6	198907	198912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4429	NC_009486	TGA	2	6	200427	200432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269350
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4462	NC_009486	AGA	2	6	202183	202188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269352
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4481	NC_009486	GA	3	6	203282	203287	50 %	0 %	50 %	0 %	148269352
4482	NC_009486	TCTT	2	8	203303	203310	0 %	75 %	0 %	25 %	148269352
4483	NC_009486	CTT	2	6	203334	203339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4491	NC_009486	GTA	2	6	203625	203630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269353
4492	NC_009486	ACC	2	6	203746	203751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269353
4493	NC_009486	TCCACT	2	12	203803	203814	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148269353
4494	NC_009486	GAG	3	9	203850	203858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269353
4495	NC_009486	TC	3	6	203864	203869	0 %	50 %	0 %	50 %	148269353
4496	NC_009486	TC	3	6	203908	203913	0 %	50 %	0 %	50 %	148269353
4497	NC_009486	GAT	2	6	203942	203947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269353
4498	NC_009486	TTC	2	6	203962	203967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269353
4499	NC_009486	CCGTT	2	10	204064	204073	0 %	40 %	20 %	40 %	148269354
4500	NC_009486	ATC	2	6	204105	204110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269354

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