MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 40184

< Previous12...69707172737475767778798081Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_009486	GAA	2	6	1815841	1815846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270922
40002	NC_009486	AG	3	6	1815854	1815859	50 %	0 %	50 %	0 %	148270922
40003	NC_009486	TTG	2	6	1815860	1815865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270922
40004	NC_009486	CGC	2	6	1815868	1815873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148270922
40005	NC_009486	CTT	2	6	1816050	1816055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270922
40006	NC_009486	CT	3	6	1816220	1816225	0 %	50 %	0 %	50 %	148270922
40007	NC_009486	TTC	2	6	1816357	1816362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270922
40008	NC_009486	GTA	2	6	1816432	1816437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270922
40009	NC_009486	TCT	2	6	1816443	1816448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270922
40010	NC_009486	TCT	2	6	1816460	1816465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270922
40011	NC_009486	AGA	2	6	1816482	1816487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270922
40012	NC_009486	CTC	2	6	1816518	1816523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270922
40013	NC_009486	AGA	2	6	1816526	1816531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270922
40014	NC_009486	GA	3	6	1816586	1816591	50 %	0 %	50 %	0 %	148270922
40015	NC_009486	AGA	2	6	1816672	1816677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270922
40016	NC_009486	GAA	2	6	1816739	1816744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270923
40017	NC_009486	GA	3	6	1816749	1816754	50 %	0 %	50 %	0 %	148270923
40018	NC_009486	TC	3	6	1816772	1816777	0 %	50 %	0 %	50 %	148270923
40019	NC_009486	TTG	2	6	1816810	1816815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270923
40020	NC_009486	ATC	2	6	1816819	1816824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270923
40021	NC_009486	CTT	2	6	1816835	1816840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270923
40022	NC_009486	TGT	2	6	1816845	1816850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270923
40023	NC_009486	GAG	2	6	1816918	1816923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270923
40024	NC_009486	TGT	2	6	1817012	1817017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270923
40025	NC_009486	TCC	2	6	1817050	1817055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270923
40026	NC_009486	CGA	2	6	1817066	1817071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270923
40027	NC_009486	TCT	2	6	1817074	1817079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270923
40028	NC_009486	TCT	3	9	1817089	1817097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270923
40029	NC_009486	CTTTCA	2	12	1817135	1817146	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148270923
40030	NC_009486	CAA	2	6	1817169	1817174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270924
40031	NC_009486	AGA	2	6	1817191	1817196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270924
40032	NC_009486	TCTG	2	8	1817253	1817260	0 %	50 %	25 %	25 %	148270924
40033	NC_009486	GA	3	6	1817265	1817270	50 %	0 %	50 %	0 %	148270924
40034	NC_009486	TCC	2	6	1817313	1817318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270924
40035	NC_009486	CCA	2	6	1817343	1817348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270924
40036	NC_009486	TCAGA	2	10	1817357	1817366	40 %	20 %	20 %	20 %	148270924
40037	NC_009486	TGG	2	6	1817414	1817419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270924
40038	NC_009486	TGT	2	6	1817432	1817437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270924
40039	NC_009486	TGA	2	6	1817513	1817518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270924
40040	NC_009486	T	6	6	1817531	1817536	0 %	100 %	0 %	0 %	148270924
40041	NC_009486	GAA	2	6	1817586	1817591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270924
40042	NC_009486	T	6	6	1817637	1817642	0 %	100 %	0 %	0 %	148270924
40043	NC_009486	AAG	2	6	1817647	1817652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270924
40044	NC_009486	AAG	2	6	1817673	1817678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270924
40045	NC_009486	AGAACA	2	12	1817725	1817736	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148270924
40046	NC_009486	TAT	2	6	1817748	1817753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270924
40047	NC_009486	GA	3	6	1817755	1817760	50 %	0 %	50 %	0 %	148270924
40048	NC_009486	CAG	2	6	1817852	1817857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270924
40049	NC_009486	AG	3	6	1817856	1817861	50 %	0 %	50 %	0 %	148270924
40050	NC_009486	CAG	2	6	1817891	1817896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270924
40051	NC_009486	CGC	2	6	1817937	1817942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148270924
40052	NC_009486	ATG	2	6	1817953	1817958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270924
40053	NC_009486	ATC	2	6	1817974	1817979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270924
40054	NC_009486	GAAC	2	8	1818074	1818081	50 %	0 %	25 %	25 %	148270924
40055	NC_009486	GTT	2	6	1818091	1818096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270924
40056	NC_009486	GA	3	6	1818115	1818120	50 %	0 %	50 %	0 %	148270924
40057	NC_009486	AGA	2	6	1818149	1818154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270924
40058	NC_009486	AC	3	6	1818158	1818163	50 %	0 %	0 %	50 %	148270924
40059	NC_009486	A	6	6	1818196	1818201	100 %	0 %	0 %	0 %	148270924
40060	NC_009486	CTT	2	6	1818214	1818219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270924
40061	NC_009486	ATC	2	6	1818238	1818243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270924
40062	NC_009486	AAGA	2	8	1818315	1818322	75 %	0 %	25 %	0 %	148270924
40063	NC_009486	CTCC	2	8	1818331	1818338	0 %	25 %	0 %	75 %	148270924
40064	NC_009486	TGA	2	6	1818347	1818352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270924
40065	NC_009486	GTG	2	6	1818360	1818365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270924
40066	NC_009486	ATG	2	6	1818376	1818381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270924
40067	NC_009486	TAT	2	6	1818393	1818398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270924
40068	NC_009486	AAC	2	6	1818414	1818419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270924
40069	NC_009486	GAA	2	6	1818464	1818469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270925
40070	NC_009486	TAT	2	6	1818491	1818496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270925
40071	NC_009486	TTTC	2	8	1818505	1818512	0 %	75 %	0 %	25 %	148270925
40072	NC_009486	TGT	2	6	1818515	1818520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270925
40073	NC_009486	CTT	2	6	1818556	1818561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270925
40074	NC_009486	CTT	2	6	1818597	1818602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270925
40075	NC_009486	AAG	2	6	1818607	1818612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270925
40076	NC_009486	ACG	2	6	1818667	1818672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270925
40077	NC_009486	ATC	2	6	1818856	1818861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270925
40078	NC_009486	TCT	2	6	1818909	1818914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270925
40079	NC_009486	ACT	2	6	1818968	1818973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270925
40080	NC_009486	GCA	2	6	1818991	1818996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270925
40081	NC_009486	CTA	2	6	1819073	1819078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270925
40082	NC_009486	GAA	2	6	1819103	1819108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270925
40083	NC_009486	ACA	3	9	1819162	1819170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270925
40084	NC_009486	ACA	2	6	1819227	1819232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270925
40085	NC_009486	GAAA	2	8	1819235	1819242	75 %	0 %	25 %	0 %	148270925
40086	NC_009486	GCT	2	6	1819343	1819348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270925
40087	NC_009486	TTC	2	6	1819430	1819435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270925
40088	NC_009486	GTG	2	6	1819490	1819495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270925
40089	NC_009486	AT	3	6	1819594	1819599	50 %	50 %	0 %	0 %	148270925
40090	NC_009486	TCGT	2	8	1819603	1819610	0 %	50 %	25 %	25 %	148270925
40091	NC_009486	ACC	2	6	1819663	1819668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270926
40092	NC_009486	T	6	6	1819693	1819698	0 %	100 %	0 %	0 %	148270926
40093	NC_009486	GCC	2	6	1819760	1819765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148270926
40094	NC_009486	TCT	2	6	1819807	1819812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270926
40095	NC_009486	GTT	2	6	1819886	1819891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270926
40096	NC_009486	CT	3	6	1819924	1819929	0 %	50 %	0 %	50 %	148270926
40097	NC_009486	TTC	2	6	1819936	1819941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270926
40098	NC_009486	GTTTT	2	10	1819987	1819996	0 %	80 %	20 %	0 %	148270926
40099	NC_009486	CTC	2	6	1819997	1820002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270926
40100	NC_009486	TTC	2	6	1820003	1820008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270926
40101	NC_009486	AAG	2	6	1820029	1820034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270926
40102	NC_009486	ACA	2	6	1820043	1820048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270926
40103	NC_009486	ATG	2	6	1820057	1820062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270927
40104	NC_009486	TCT	2	6	1820105	1820110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270927
40105	NC_009486	GAA	2	6	1820148	1820153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270927
40106	NC_009486	TTTC	2	8	1820203	1820210	0 %	75 %	0 %	25 %	148270927
40107	NC_009486	CA	3	6	1820234	1820239	50 %	0 %	0 %	50 %	148270927
40108	NC_009486	GAT	3	9	1820240	1820248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270927
40109	NC_009486	T	7	7	1820261	1820267	0 %	100 %	0 %	0 %	148270927
40110	NC_009486	GA	3	6	1820302	1820307	50 %	0 %	50 %	0 %	148270927
40111	NC_009486	GTA	2	6	1820327	1820332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270927
40112	NC_009486	T	6	6	1820369	1820374	0 %	100 %	0 %	0 %	148270927
40113	NC_009486	CTG	2	6	1820419	1820424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270927
40114	NC_009486	ACC	2	6	1820453	1820458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40115	NC_009486	AAGG	2	8	1820496	1820503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40116	NC_009486	AGA	2	6	1820519	1820524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270928
40117	NC_009486	A	6	6	1820540	1820545	100 %	0 %	0 %	0 %	148270928
40118	NC_009486	ATG	2	6	1820550	1820555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270928
40119	NC_009486	ATC	2	6	1820646	1820651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270928
40120	NC_009486	TTCT	2	8	1820656	1820663	0 %	75 %	0 %	25 %	148270928
40121	NC_009486	CCCG	2	8	1820694	1820701	0 %	0 %	25 %	75 %	148270928
40122	NC_009486	AGA	2	6	1820705	1820710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270928
40123	NC_009486	TGG	2	6	1820736	1820741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270928
40124	NC_009486	CGA	2	6	1820750	1820755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270928
40125	NC_009486	AGA	2	6	1820832	1820837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270928
40126	NC_009486	GGAA	2	8	1820858	1820865	50 %	0 %	50 %	0 %	148270928
40127	NC_009486	C	6	6	1820888	1820893	0 %	0 %	0 %	100 %	148270928
40128	NC_009486	GGA	2	6	1820894	1820899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270928
40129	NC_009486	TCA	2	6	1820920	1820925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270928
40130	NC_009486	TTC	2	6	1820949	1820954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270928
40131	NC_009486	GAA	2	6	1821002	1821007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270928
40132	NC_009486	GA	3	6	1821026	1821031	50 %	0 %	50 %	0 %	148270928
40133	NC_009486	TC	4	8	1821074	1821081	0 %	50 %	0 %	50 %	148270928
40134	NC_009486	GAT	2	6	1821150	1821155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270928
40135	NC_009486	AAAAG	2	10	1821158	1821167	80 %	0 %	20 %	0 %	148270928
40136	NC_009486	AG	3	6	1821238	1821243	50 %	0 %	50 %	0 %	148270928
40137	NC_009486	TAG	2	6	1821334	1821339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270928
40138	NC_009486	GAC	2	6	1821384	1821389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270928
40139	NC_009486	GAA	2	6	1821395	1821400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270928
40140	NC_009486	AGGA	2	8	1821478	1821485	50 %	0 %	50 %	0 %	148270928
40141	NC_009486	AGA	2	6	1821533	1821538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270928
40142	NC_009486	AGGAA	2	10	1821604	1821613	60 %	0 %	40 %	0 %	148270929
40143	NC_009486	TAT	2	6	1821623	1821628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270929
40144	NC_009486	TTC	2	6	1821633	1821638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270929
40145	NC_009486	CT	3	6	1821683	1821688	0 %	50 %	0 %	50 %	148270929
40146	NC_009486	GATGT	2	10	1821704	1821713	20 %	40 %	40 %	0 %	148270929
40147	NC_009486	TGT	3	9	1821711	1821719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270929
40148	NC_009486	AGAA	2	8	1821736	1821743	75 %	0 %	25 %	0 %	148270929
40149	NC_009486	GAAG	2	8	1821925	1821932	50 %	0 %	50 %	0 %	148270929
40150	NC_009486	GAT	2	6	1821979	1821984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270929
40151	NC_009486	GTG	2	6	1822058	1822063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270929
40152	NC_009486	CGA	2	6	1822084	1822089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270929
40153	NC_009486	GAT	2	6	1822126	1822131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270929
40154	NC_009486	AAG	2	6	1822201	1822206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270929
40155	NC_009486	TCGCTC	2	12	1822214	1822225	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148270929
40156	NC_009486	ACTGG	2	10	1822237	1822246	20 %	20 %	40 %	20 %	148270929
40157	NC_009486	CTC	2	6	1822253	1822258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270929
40158	NC_009486	AGG	2	6	1822259	1822264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270929
40159	NC_009486	TTC	2	6	1822265	1822270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270929
40160	NC_009486	CTGG	2	8	1822338	1822345	0 %	25 %	50 %	25 %	148270929
40161	NC_009486	TGG	2	6	1822377	1822382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270929
40162	NC_009486	GAA	2	6	1822460	1822465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270929
40163	NC_009486	GAG	2	6	1822548	1822553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270929
40164	NC_009486	CAGC	2	8	1822568	1822575	25 %	0 %	25 %	50 %	148270929
40165	NC_009486	GAA	2	6	1822659	1822664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270929
40166	NC_009486	GAA	2	6	1822694	1822699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270929
40167	NC_009486	GGT	3	9	1822738	1822746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270929
40168	NC_009486	CTT	2	6	1822771	1822776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270930
40169	NC_009486	CGT	2	6	1822880	1822885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270930
40170	NC_009486	AGA	2	6	1822912	1822917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270930
40171	NC_009486	CTG	2	6	1822918	1822923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270930
40172	NC_009486	TC	3	6	1822926	1822931	0 %	50 %	0 %	50 %	148270930
40173	NC_009486	TGAAGG	2	12	1823066	1823077	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148270930
40174	NC_009486	CCG	2	6	1823087	1823092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148270930
40175	NC_009486	A	6	6	1823111	1823116	100 %	0 %	0 %	0 %	148270930
40176	NC_009486	TTCT	2	8	1823149	1823156	0 %	75 %	0 %	25 %	148270930
40177	NC_009486	TGA	2	6	1823175	1823180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270930
40178	NC_009486	GAT	2	6	1823193	1823198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270930
40179	NC_009486	GCT	2	6	1823295	1823300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270930
40180	NC_009486	GTT	2	6	1823314	1823319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270930
40181	NC_009486	GAAA	2	8	1823324	1823331	75 %	0 %	25 %	0 %	148270930
40182	NC_009486	TTC	2	6	1823401	1823406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270930
40183	NC_009486	GAA	2	6	1823407	1823412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270930
40184	NC_009486	TAA	2	6	1823491	1823496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148270930

< Previous12...69707172737475767778798081Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.