MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 40184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009486	AACG	2	8	137671	137678	50 %	0 %	25 %	25 %	148269287
3002	NC_009486	CAC	3	9	137737	137745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269287
3003	NC_009486	GTT	2	6	137791	137796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269287
3004	NC_009486	CCA	2	6	137859	137864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269287
3005	NC_009486	TCT	2	6	137873	137878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269287
3006	NC_009486	CCT	2	6	137901	137906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269287
3007	NC_009486	TTCT	2	8	137923	137930	0 %	75 %	0 %	25 %	148269287
3008	NC_009486	CAT	2	6	137950	137955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269287
3009	NC_009486	TCC	2	6	137956	137961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269287
3010	NC_009486	TC	3	6	137989	137994	0 %	50 %	0 %	50 %	148269287
3011	NC_009486	TC	3	6	138146	138151	0 %	50 %	0 %	50 %	148269287
3012	NC_009486	AC	3	6	138156	138161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_009486	TAAAAA	2	12	138170	138181	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_009486	CCG	2	6	138185	138190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_009486	T	6	6	138199	138204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_009486	TCC	2	6	138208	138213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_009486	CCG	2	6	138227	138232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_009486	TCC	2	6	138272	138277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_009486	T	6	6	138327	138332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_009486	TG	3	6	138356	138361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_009486	AGA	2	6	138497	138502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269288
3022	NC_009486	CAC	2	6	138539	138544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269288
3023	NC_009486	ACA	2	6	138577	138582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269288
3024	NC_009486	GAG	2	6	138588	138593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269288
3025	NC_009486	GCA	2	6	138603	138608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269288
3026	NC_009486	GAA	3	9	138699	138707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269288
3027	NC_009486	GTG	2	6	138767	138772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_009486	CTC	2	6	138801	138806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269289
3029	NC_009486	ACA	2	6	138834	138839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269289
3030	NC_009486	AG	3	6	138845	138850	50 %	0 %	50 %	0 %	148269289
3031	NC_009486	GGAA	2	8	138872	138879	50 %	0 %	50 %	0 %	148269289
3032	NC_009486	TCG	2	6	138882	138887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269289
3033	NC_009486	GTG	2	6	138965	138970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269289
3034	NC_009486	GA	3	6	139052	139057	50 %	0 %	50 %	0 %	148269289
3035	NC_009486	AGA	2	6	139087	139092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269289
3036	NC_009486	CTT	2	6	139166	139171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269289
3037	NC_009486	AG	3	6	139180	139185	50 %	0 %	50 %	0 %	148269289
3038	NC_009486	CCT	2	6	139216	139221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269289
3039	NC_009486	TCT	2	6	139248	139253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269289
3040	NC_009486	AC	3	6	139278	139283	50 %	0 %	0 %	50 %	148269289
3041	NC_009486	GAAG	2	8	139318	139325	50 %	0 %	50 %	0 %	148269289
3042	NC_009486	AG	3	6	139350	139355	50 %	0 %	50 %	0 %	148269289
3043	NC_009486	GAA	2	6	139358	139363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269289
3044	NC_009486	TCG	2	6	139413	139418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269289
3045	NC_009486	GGA	2	6	139430	139435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269289
3046	NC_009486	TC	3	6	139462	139467	0 %	50 %	0 %	50 %	148269289
3047	NC_009486	TTC	2	6	139557	139562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269289
3048	NC_009486	CTC	2	6	139583	139588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_009486	ACT	2	6	139642	139647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269290
3050	NC_009486	CTA	2	6	139751	139756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269290
3051	NC_009486	CCA	2	6	139804	139809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269290
3052	NC_009486	CA	3	6	139828	139833	50 %	0 %	0 %	50 %	148269290
3053	NC_009486	GAA	2	6	139911	139916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269290
3054	NC_009486	TTC	2	6	140010	140015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269290
3055	NC_009486	CAG	2	6	140024	140029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269290
3056	NC_009486	CCA	2	6	140036	140041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269290
3057	NC_009486	TTC	2	6	140056	140061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269290
3058	NC_009486	CT	3	6	140069	140074	0 %	50 %	0 %	50 %	148269290
3059	NC_009486	GCA	2	6	140107	140112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269290
3060	NC_009486	CCGG	2	8	140158	140165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_009486	GATAC	2	10	140307	140316	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3062	NC_009486	CTT	2	6	140341	140346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269291
3063	NC_009486	TC	3	6	140362	140367	0 %	50 %	0 %	50 %	148269291
3064	NC_009486	CTTC	2	8	140427	140434	0 %	50 %	0 %	50 %	148269291
3065	NC_009486	GAC	2	6	140438	140443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269291
3066	NC_009486	CTC	2	6	140483	140488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269291
3067	NC_009486	GA	3	6	140505	140510	50 %	0 %	50 %	0 %	148269291
3068	NC_009486	GAG	2	6	140528	140533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269291
3069	NC_009486	CCA	2	6	140602	140607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269291
3070	NC_009486	CCTT	2	8	140613	140620	0 %	50 %	0 %	50 %	148269291
3071	NC_009486	CTTC	2	8	140709	140716	0 %	50 %	0 %	50 %	148269291
3072	NC_009486	CAG	2	6	140730	140735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269291
3073	NC_009486	TCT	2	6	140851	140856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269291
3074	NC_009486	TCCT	2	8	140915	140922	0 %	50 %	0 %	50 %	148269291
3075	NC_009486	GAA	2	6	140978	140983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269291
3076	NC_009486	TC	3	6	141021	141026	0 %	50 %	0 %	50 %	148269291
3077	NC_009486	T	7	7	141056	141062	0 %	100 %	0 %	0 %	148269291
3078	NC_009486	TCG	2	6	141081	141086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269291
3079	NC_009486	GTA	2	6	141125	141130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269291
3080	NC_009486	TGA	2	6	141223	141228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269291
3081	NC_009486	AAGT	2	8	141246	141253	50 %	25 %	25 %	0 %	148269291
3082	NC_009486	ATCG	2	8	141269	141276	25 %	25 %	25 %	25 %	148269291
3083	NC_009486	GAG	2	6	141320	141325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269291
3084	NC_009486	CCA	2	6	141331	141336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269291
3085	NC_009486	C	6	6	141347	141352	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3086	NC_009486	CAT	2	6	141393	141398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269292
3087	NC_009486	GAA	2	6	141465	141470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269292
3088	NC_009486	GCT	2	6	141539	141544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269292
3089	NC_009486	ATC	2	6	141623	141628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_009486	CTT	2	6	141659	141664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269293
3091	NC_009486	TTC	2	6	141669	141674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269293
3092	NC_009486	GGT	2	6	141679	141684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269293
3093	NC_009486	ACC	2	6	141801	141806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269293
3094	NC_009486	CCG	2	6	141826	141831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148269293
3095	NC_009486	ACC	2	6	141916	141921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269293
3096	NC_009486	GA	4	8	141943	141950	50 %	0 %	50 %	0 %	148269293
3097	NC_009486	TTCT	2	8	141969	141976	0 %	75 %	0 %	25 %	148269293
3098	NC_009486	AGCA	2	8	142008	142015	50 %	0 %	25 %	25 %	148269293
3099	NC_009486	ATCG	2	8	142080	142087	25 %	25 %	25 %	25 %	148269293
3100	NC_009486	ACC	2	6	142114	142119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_009486	ATC	2	6	142166	142171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_009486	A	6	6	142183	142188	100 %	0 %	0 %	0 %	148269294
3103	NC_009486	TTC	2	6	142224	142229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269294
3104	NC_009486	TCA	2	6	142327	142332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269294
3105	NC_009486	TGG	2	6	142366	142371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269294
3106	NC_009486	CTT	2	6	142385	142390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269294
3107	NC_009486	GAA	2	6	142539	142544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269294
3108	NC_009486	CGA	2	6	142547	142552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269294
3109	NC_009486	CTG	2	6	142559	142564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269294
3110	NC_009486	AAAG	2	8	142577	142584	75 %	0 %	25 %	0 %	148269294
3111	NC_009486	GAAAA	2	10	142616	142625	80 %	0 %	20 %	0 %	148269294
3112	NC_009486	TAC	2	6	142641	142646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269294
3113	NC_009486	AAC	2	6	142669	142674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269294
3114	NC_009486	TGG	2	6	142675	142680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269294
3115	NC_009486	GGT	2	6	142682	142687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269294
3116	NC_009486	GAA	2	6	142703	142708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269294
3117	NC_009486	TGTGG	2	10	142740	142749	0 %	40 %	60 %	0 %	148269294
3118	NC_009486	GAA	2	6	142755	142760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269294
3119	NC_009486	AAG	2	6	142768	142773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269294
3120	NC_009486	TCC	2	6	142790	142795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269294
3121	NC_009486	TTC	2	6	142809	142814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269294
3122	NC_009486	TCGC	2	8	142822	142829	0 %	25 %	25 %	50 %	148269294
3123	NC_009486	GT	3	6	142836	142841	0 %	50 %	50 %	0 %	148269294
3124	NC_009486	GAA	2	6	142843	142848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269294
3125	NC_009486	TGG	2	6	142879	142884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269294
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3127	NC_009486	GAT	2	6	142912	142917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269294
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3131	NC_009486	AG	3	6	143286	143291	50 %	0 %	50 %	0 %	148269295
3132	NC_009486	GAAA	2	8	143337	143344	75 %	0 %	25 %	0 %	148269295
3133	NC_009486	AGT	2	6	143426	143431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269295
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3146	NC_009486	CAG	2	6	143992	143997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269297
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3235	NC_009486	ACGTTC	2	12	147936	147947	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148269301
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3242	NC_009486	CTTC	2	8	148287	148294	0 %	50 %	0 %	50 %	148269301
3243	NC_009486	GAA	2	6	148301	148306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269301
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3245	NC_009486	TCT	2	6	148413	148418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269301
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3499	NC_009486	TCC	2	6	158715	158720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3500	NC_009486	GCGT	2	8	158776	158783	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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