MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 40184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_009486	ATT	2	6	1433186	1433191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270573
31503	NC_009486	TGG	2	6	1433206	1433211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270573
31504	NC_009486	TGA	2	6	1433218	1433223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270573
31505	NC_009486	CAA	2	6	1433240	1433245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270573
31506	NC_009486	TGG	2	6	1433254	1433259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270573
31507	NC_009486	TA	3	6	1433261	1433266	50 %	50 %	0 %	0 %	148270573
31508	NC_009486	ATTGGG	2	12	1433391	1433402	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148270573
31509	NC_009486	CAA	2	6	1433414	1433419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270573
31510	NC_009486	TGG	2	6	1433428	1433433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270573
31511	NC_009486	TA	3	6	1433435	1433440	50 %	50 %	0 %	0 %	148270573
31512	NC_009486	ATG	2	6	1433463	1433468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270573
31513	NC_009486	CAA	2	6	1433588	1433593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270573
31514	NC_009486	GGA	2	6	1433621	1433626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270573
31515	NC_009486	GTA	2	6	1433681	1433686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270573
31516	NC_009486	CAG	2	6	1433762	1433767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270573
31517	NC_009486	ACA	2	6	1433768	1433773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270573
31518	NC_009486	GGA	2	6	1433777	1433782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270573
31519	NC_009486	TTGG	2	8	1433865	1433872	0 %	50 %	50 %	0 %	148270573
31520	NC_009486	GTGAG	2	10	1433875	1433884	20 %	20 %	60 %	0 %	148270573
31521	NC_009486	TGG	2	6	1433917	1433922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31522	NC_009486	GAT	2	6	1433925	1433930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31523	NC_009486	ATT	2	6	1433950	1433955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31524	NC_009486	TCAC	2	8	1434000	1434007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31525	NC_009486	AGT	2	6	1434022	1434027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31526	NC_009486	TTATT	2	10	1434042	1434051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31527	NC_009486	TCT	2	6	1434110	1434115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31528	NC_009486	CCT	2	6	1434165	1434170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270574
31529	NC_009486	GA	3	6	1434225	1434230	50 %	0 %	50 %	0 %	148270574
31530	NC_009486	TCC	2	6	1434309	1434314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270574
31531	NC_009486	CAGC	2	8	1434433	1434440	25 %	0 %	25 %	50 %	148270574
31532	NC_009486	CCA	2	6	1434448	1434453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270574
31533	NC_009486	TCA	2	6	1434541	1434546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270574
31534	NC_009486	GAA	2	6	1434620	1434625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270574
31535	NC_009486	ATG	2	6	1434630	1434635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270574
31536	NC_009486	TTTC	2	8	1434714	1434721	0 %	75 %	0 %	25 %	148270574
31537	NC_009486	TTC	2	6	1434732	1434737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270574
31538	NC_009486	TTC	2	6	1434746	1434751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270574
31539	NC_009486	AGG	2	6	1434840	1434845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270574
31540	NC_009486	TTC	2	6	1434879	1434884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270574
31541	NC_009486	TTTTC	2	10	1434918	1434927	0 %	80 %	0 %	20 %	148270574
31542	NC_009486	CTG	2	6	1434955	1434960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270574
31543	NC_009486	GAA	2	6	1434965	1434970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270574
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31545	NC_009486	CAT	2	6	1435091	1435096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270574
31546	NC_009486	TCT	2	6	1435100	1435105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270574
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31549	NC_009486	GAA	2	6	1435156	1435161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270574
31550	NC_009486	CCA	2	6	1435217	1435222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270574
31551	NC_009486	ACGA	2	8	1435263	1435270	50 %	0 %	25 %	25 %	148270574
31552	NC_009486	AGG	2	6	1435287	1435292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270574
31553	NC_009486	CCT	2	6	1435313	1435318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31554	NC_009486	TTC	2	6	1435326	1435331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270575
31555	NC_009486	TTG	2	6	1435401	1435406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270575
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31557	NC_009486	CCA	2	6	1435458	1435463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270575
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31559	NC_009486	CAC	2	6	1435530	1435535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270575
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31569	NC_009486	CTG	2	6	1435900	1435905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270575
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31574	NC_009486	TCG	2	6	1436220	1436225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270575
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31582	NC_009486	CTG	2	6	1436942	1436947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270575
31583	NC_009486	TC	3	6	1436988	1436993	0 %	50 %	0 %	50 %	148270575
31584	NC_009486	GCCT	2	8	1437060	1437067	0 %	25 %	25 %	50 %	148270575
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31588	NC_009486	GTC	2	6	1437271	1437276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270576
31589	NC_009486	AT	3	6	1437278	1437283	50 %	50 %	0 %	0 %	148270576
31590	NC_009486	TCT	2	6	1437379	1437384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270576
31591	NC_009486	AT	3	6	1437427	1437432	50 %	50 %	0 %	0 %	148270576
31592	NC_009486	TCC	2	6	1437546	1437551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270576
31593	NC_009486	TTGG	2	8	1437563	1437570	0 %	50 %	50 %	0 %	148270576
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31600	NC_009486	T	6	6	1437699	1437704	0 %	100 %	0 %	0 %	148270576
31601	NC_009486	TATCT	2	10	1437879	1437888	20 %	60 %	0 %	20 %	148270576
31602	NC_009486	TAAAG	2	10	1437923	1437932	60 %	20 %	20 %	0 %	148270576
31603	NC_009486	TCTT	2	8	1438055	1438062	0 %	75 %	0 %	25 %	148270576
31604	NC_009486	GCA	2	6	1438075	1438080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270576
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31607	NC_009486	T	6	6	1438143	1438148	0 %	100 %	0 %	0 %	148270576
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31613	NC_009486	GTTT	2	8	1438432	1438439	0 %	75 %	25 %	0 %	148270576
31614	NC_009486	A	6	6	1438456	1438461	100 %	0 %	0 %	0 %	148270576
31615	NC_009486	GA	3	6	1438496	1438501	50 %	0 %	50 %	0 %	148270576
31616	NC_009486	CTTT	2	8	1438524	1438531	0 %	75 %	0 %	25 %	148270576
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31618	NC_009486	TAT	2	6	1438659	1438664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270576
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