MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 40184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_009486	TCT	2	6	1410588	1410593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270551
31003	NC_009486	TCT	2	6	1410614	1410619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270551
31004	NC_009486	GAG	2	6	1410628	1410633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270551
31005	NC_009486	CT	3	6	1410655	1410660	0 %	50 %	0 %	50 %	148270551
31006	NC_009486	CTT	2	6	1410672	1410677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270551
31007	NC_009486	ATG	2	6	1410767	1410772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270551
31008	NC_009486	TCA	2	6	1410786	1410791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270551
31009	NC_009486	TCT	2	6	1410829	1410834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270551
31010	NC_009486	ACG	2	6	1410875	1410880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270551
31011	NC_009486	TGT	2	6	1410904	1410909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270551
31012	NC_009486	CAC	2	6	1410919	1410924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270551
31013	NC_009486	GTC	2	6	1410993	1410998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270551
31014	NC_009486	AGG	2	6	1411079	1411084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270551
31015	NC_009486	TGT	2	6	1411124	1411129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270551
31016	NC_009486	CGA	2	6	1411131	1411136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270551
31017	NC_009486	AGT	2	6	1411164	1411169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270551
31018	NC_009486	GCT	2	6	1411171	1411176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270551
31019	NC_009486	CCA	2	6	1411215	1411220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270551
31020	NC_009486	TCTT	2	8	1411260	1411267	0 %	75 %	0 %	25 %	148270551
31021	NC_009486	GT	3	6	1411291	1411296	0 %	50 %	50 %	0 %	148270551
31022	NC_009486	CTT	2	6	1411302	1411307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270551
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31025	NC_009486	CT	3	6	1411419	1411424	0 %	50 %	0 %	50 %	148270551
31026	NC_009486	AGG	2	6	1411443	1411448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270551
31027	NC_009486	T	6	6	1411485	1411490	0 %	100 %	0 %	0 %	148270551
31028	NC_009486	AC	3	6	1411516	1411521	50 %	0 %	0 %	50 %	148270551
31029	NC_009486	TTC	2	6	1411540	1411545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270551
31030	NC_009486	CTT	2	6	1411575	1411580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270551
31031	NC_009486	TCC	2	6	1411709	1411714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270551
31032	NC_009486	TTC	2	6	1411771	1411776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270551
31033	NC_009486	GTT	2	6	1411795	1411800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270551
31034	NC_009486	CAG	2	6	1411862	1411867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270551
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31036	NC_009486	T	6	6	1411912	1411917	0 %	100 %	0 %	0 %	148270551
31037	NC_009486	TCT	2	6	1411949	1411954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270551
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31039	NC_009486	CTC	2	6	1411999	1412004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270551
31040	NC_009486	GA	3	6	1412013	1412018	50 %	0 %	50 %	0 %	148270551
31041	NC_009486	TCT	2	6	1412057	1412062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270551
31042	NC_009486	GA	3	6	1412107	1412112	50 %	0 %	50 %	0 %	148270551
31043	NC_009486	GAAC	2	8	1412163	1412170	50 %	0 %	25 %	25 %	148270551
31044	NC_009486	TCCTT	2	10	1412186	1412195	0 %	60 %	0 %	40 %	148270551
31045	NC_009486	CGA	2	6	1412205	1412210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270551
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31050	NC_009486	CTC	2	6	1412521	1412526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270551
31051	NC_009486	TTC	2	6	1412626	1412631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270551
31052	NC_009486	TC	3	6	1412630	1412635	0 %	50 %	0 %	50 %	148270551
31053	NC_009486	CTT	2	6	1412671	1412676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270551
31054	NC_009486	CCAG	2	8	1412761	1412768	25 %	0 %	25 %	50 %	148270551
31055	NC_009486	GAC	2	6	1412809	1412814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270551
31056	NC_009486	GATGTG	2	12	1412848	1412859	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148270551
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31058	NC_009486	CCT	2	6	1413055	1413060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31059	NC_009486	CTT	2	6	1413076	1413081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270552
31060	NC_009486	TCG	2	6	1413098	1413103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270552
31061	NC_009486	TCTT	2	8	1413197	1413204	0 %	75 %	0 %	25 %	148270552
31062	NC_009486	TTTC	2	8	1413205	1413212	0 %	75 %	0 %	25 %	148270552
31063	NC_009486	AGA	2	6	1413288	1413293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270552
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31066	NC_009486	TCA	2	6	1413386	1413391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270552
31067	NC_009486	TC	3	6	1413415	1413420	0 %	50 %	0 %	50 %	148270553
31068	NC_009486	AAC	2	6	1413458	1413463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270553
31069	NC_009486	TCC	2	6	1413494	1413499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270553
31070	NC_009486	GAA	2	6	1413566	1413571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270553
31071	NC_009486	TCTTT	2	10	1413583	1413592	0 %	80 %	0 %	20 %	148270553
31072	NC_009486	CTC	2	6	1413596	1413601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270553
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31077	NC_009486	TCGT	2	8	1413939	1413946	0 %	50 %	25 %	25 %	148270553
31078	NC_009486	TAT	2	6	1413947	1413952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270553
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31080	NC_009486	T	6	6	1413992	1413997	0 %	100 %	0 %	0 %	148270553
31081	NC_009486	GCC	2	6	1414013	1414018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148270553
31082	NC_009486	TAT	2	6	1414019	1414024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270553
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31084	NC_009486	TCT	2	6	1414091	1414096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270553
31085	NC_009486	TTTC	2	8	1414098	1414105	0 %	75 %	0 %	25 %	148270553
31086	NC_009486	TCG	2	6	1414134	1414139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270553
31087	NC_009486	TGA	2	6	1414144	1414149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270553
31088	NC_009486	AGC	2	6	1414161	1414166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270553
31089	NC_009486	TTTC	2	8	1414330	1414337	0 %	75 %	0 %	25 %	148270553
31090	NC_009486	GTT	2	6	1414351	1414356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270553
31091	NC_009486	ATG	2	6	1414404	1414409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270553
31092	NC_009486	TC	4	8	1414495	1414502	0 %	50 %	0 %	50 %	148270553
31093	NC_009486	TCCAGA	2	12	1414569	1414580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148270553
31094	NC_009486	CTT	2	6	1414588	1414593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270553
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31097	NC_009486	TCG	2	6	1414668	1414673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270553
31098	NC_009486	T	6	6	1414714	1414719	0 %	100 %	0 %	0 %	148270553
31099	NC_009486	TC	3	6	1414728	1414733	0 %	50 %	0 %	50 %	148270553
31100	NC_009486	ACC	2	6	1414761	1414766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270553
31101	NC_009486	GTA	2	6	1414790	1414795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270553
31102	NC_009486	T	6	6	1414813	1414818	0 %	100 %	0 %	0 %	148270553
31103	NC_009486	TTC	2	6	1414919	1414924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270553
31104	NC_009486	GAG	2	6	1414933	1414938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270553
31105	NC_009486	CAC	2	6	1414942	1414947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270553
31106	NC_009486	AAC	2	6	1414958	1414963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270553
31107	NC_009486	TCTT	2	8	1414986	1414993	0 %	75 %	0 %	25 %	148270553
31108	NC_009486	GAA	2	6	1414996	1415001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270553
31109	NC_009486	GTT	2	6	1415063	1415068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270553
31110	NC_009486	ATT	2	6	1415109	1415114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270553
31111	NC_009486	TTCT	2	8	1415132	1415139	0 %	75 %	0 %	25 %	148270553
31112	NC_009486	TTC	2	6	1415162	1415167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270553
31113	NC_009486	CTT	3	9	1415191	1415199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270553
31114	NC_009486	CGA	2	6	1415230	1415235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270553
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31118	NC_009486	CT	3	6	1415321	1415326	0 %	50 %	0 %	50 %	148270553
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31237	NC_009486	GCTC	2	8	1420967	1420974	0 %	25 %	25 %	50 %	148270561
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31337	NC_009486	CAA	2	6	1425621	1425626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270565
31338	NC_009486	CTT	2	6	1425690	1425695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270565
31339	NC_009486	ATG	2	6	1425734	1425739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270565
31340	NC_009486	TCT	2	6	1425750	1425755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270565
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31342	NC_009486	GC	3	6	1425772	1425777	0 %	0 %	50 %	50 %	148270565
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31351	NC_009486	TC	3	6	1426095	1426100	0 %	50 %	0 %	50 %	148270566
31352	NC_009486	TCT	2	6	1426117	1426122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270566
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