MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 40184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_009486	TTCG	2	8	1250632	1250639	0 %	50 %	25 %	25 %	148270363
27502	NC_009486	CAA	2	6	1250655	1250660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270363
27503	NC_009486	GAC	2	6	1250665	1250670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270363
27504	NC_009486	TTC	2	6	1250692	1250697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270363
27505	NC_009486	CA	3	6	1250725	1250730	50 %	0 %	0 %	50 %	148270363
27506	NC_009486	T	7	7	1250770	1250776	0 %	100 %	0 %	0 %	148270363
27507	NC_009486	GTA	2	6	1250872	1250877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270363
27508	NC_009486	CT	3	6	1250878	1250883	0 %	50 %	0 %	50 %	148270363
27509	NC_009486	CCT	2	6	1250898	1250903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270363
27510	NC_009486	GA	3	6	1250973	1250978	50 %	0 %	50 %	0 %	148270364
27511	NC_009486	GCTC	2	8	1251039	1251046	0 %	25 %	25 %	50 %	148270364
27512	NC_009486	CAG	2	6	1251078	1251083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270364
27513	NC_009486	TCT	2	6	1251110	1251115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270364
27514	NC_009486	CTA	2	6	1251137	1251142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270364
27515	NC_009486	TTTTC	2	10	1251200	1251209	0 %	80 %	0 %	20 %	148270364
27516	NC_009486	GAA	2	6	1251329	1251334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270364
27517	NC_009486	TTC	2	6	1251354	1251359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270364
27518	NC_009486	CAA	2	6	1251450	1251455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270364
27519	NC_009486	CTG	2	6	1251472	1251477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27520	NC_009486	CTC	2	6	1251491	1251496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270365
27521	NC_009486	TCT	2	6	1251597	1251602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270365
27522	NC_009486	ACG	2	6	1251639	1251644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270365
27523	NC_009486	AGTG	2	8	1251725	1251732	25 %	25 %	50 %	0 %	148270365
27524	NC_009486	AGC	2	6	1251896	1251901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270365
27525	NC_009486	AAG	2	6	1252001	1252006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270365
27526	NC_009486	CTT	2	6	1252037	1252042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270365
27527	NC_009486	CGA	2	6	1252063	1252068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270365
27528	NC_009486	TTC	2	6	1252070	1252075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270365
27529	NC_009486	ATC	2	6	1252104	1252109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270365
27530	NC_009486	CT	4	8	1252110	1252117	0 %	50 %	0 %	50 %	148270365
27531	NC_009486	CCA	2	6	1252131	1252136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270365
27532	NC_009486	CAC	2	6	1252182	1252187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270366
27533	NC_009486	T	6	6	1252208	1252213	0 %	100 %	0 %	0 %	148270366
27534	NC_009486	GTA	2	6	1252284	1252289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270366
27535	NC_009486	CT	3	6	1252300	1252305	0 %	50 %	0 %	50 %	148270366
27536	NC_009486	GAA	2	6	1252333	1252338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270366
27537	NC_009486	CTT	2	6	1252410	1252415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270366
27538	NC_009486	CTT	2	6	1252430	1252435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270366
27539	NC_009486	ACC	3	9	1252474	1252482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270366
27540	NC_009486	CTTC	2	8	1252511	1252518	0 %	50 %	0 %	50 %	148270366
27541	NC_009486	CTT	2	6	1252651	1252656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270366
27542	NC_009486	GAA	3	9	1252663	1252671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270366
27543	NC_009486	AAT	2	6	1252677	1252682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148270366
27544	NC_009486	TCCC	2	8	1252695	1252702	0 %	25 %	0 %	75 %	148270367
27545	NC_009486	CTTG	2	8	1252705	1252712	0 %	50 %	25 %	25 %	148270367
27546	NC_009486	AAG	2	6	1252772	1252777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270367
27547	NC_009486	GTT	2	6	1252825	1252830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270367
27548	NC_009486	ACTCAA	2	12	1252849	1252860	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148270367
27549	NC_009486	CCA	2	6	1252893	1252898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270367
27550	NC_009486	GAA	2	6	1252918	1252923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270367
27551	NC_009486	GAAA	2	8	1252943	1252950	75 %	0 %	25 %	0 %	148270367
27552	NC_009486	AG	3	6	1252962	1252967	50 %	0 %	50 %	0 %	148270367
27553	NC_009486	CGA	2	6	1252992	1252997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270367
27554	NC_009486	AGA	2	6	1253113	1253118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270367
27555	NC_009486	AGAA	2	8	1253134	1253141	75 %	0 %	25 %	0 %	148270367
27556	NC_009486	TCC	2	6	1253148	1253153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270367
27557	NC_009486	GAA	2	6	1253190	1253195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270368
27558	NC_009486	TAT	2	6	1253196	1253201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270368
27559	NC_009486	CA	3	6	1253214	1253219	50 %	0 %	0 %	50 %	148270368
27560	NC_009486	GAT	2	6	1253220	1253225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270368
27561	NC_009486	CCT	2	6	1253230	1253235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270368
27562	NC_009486	CA	4	8	1253256	1253263	50 %	0 %	0 %	50 %	148270368
27563	NC_009486	TCT	2	6	1253417	1253422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270368
27564	NC_009486	CAC	2	6	1253472	1253477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270368
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27566	NC_009486	GAA	2	6	1253490	1253495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270368
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27569	NC_009486	TCC	2	6	1253555	1253560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270369
27570	NC_009486	CAC	2	6	1253606	1253611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270369
27571	NC_009486	TCC	2	6	1253614	1253619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270369
27572	NC_009486	TGG	2	6	1253668	1253673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270369
27573	NC_009486	CA	3	6	1253700	1253705	50 %	0 %	0 %	50 %	148270369
27574	NC_009486	ATG	2	6	1253741	1253746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270369
27575	NC_009486	AGAT	2	8	1253814	1253821	50 %	25 %	25 %	0 %	148270369
27576	NC_009486	GAT	2	6	1253894	1253899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270369
27577	NC_009486	AG	3	6	1253948	1253953	50 %	0 %	50 %	0 %	148270369
27578	NC_009486	ACC	2	6	1253996	1254001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270369
27579	NC_009486	GATC	2	8	1254004	1254011	25 %	25 %	25 %	25 %	148270369
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27583	NC_009486	GAT	2	6	1254265	1254270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270369
27584	NC_009486	CTT	2	6	1254291	1254296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270369
27585	NC_009486	GAAA	2	8	1254305	1254312	75 %	0 %	25 %	0 %	148270369
27586	NC_009486	TCT	2	6	1254373	1254378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270369
27587	NC_009486	ATA	2	6	1254431	1254436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148270369
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27589	NC_009486	AGA	2	6	1254489	1254494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270369
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27591	NC_009486	GAT	2	6	1254506	1254511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270369
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27593	NC_009486	GAT	2	6	1254532	1254537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270369
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27597	NC_009486	TC	3	6	1254833	1254838	0 %	50 %	0 %	50 %	148270370
27598	NC_009486	TCT	2	6	1254845	1254850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270370
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27602	NC_009486	TC	3	6	1255082	1255087	0 %	50 %	0 %	50 %	148270370
27603	NC_009486	GAAC	2	8	1255110	1255117	50 %	0 %	25 %	25 %	148270370
27604	NC_009486	TTGC	2	8	1255227	1255234	0 %	50 %	25 %	25 %	148270370
27605	NC_009486	TTTCT	2	10	1255330	1255339	0 %	80 %	0 %	20 %	148270370
27606	NC_009486	AG	3	6	1255388	1255393	50 %	0 %	50 %	0 %	148270370
27607	NC_009486	TTCT	2	8	1255403	1255410	0 %	75 %	0 %	25 %	148270370
27608	NC_009486	CA	3	6	1255444	1255449	50 %	0 %	0 %	50 %	148270370
27609	NC_009486	TCC	2	6	1255528	1255533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27610	NC_009486	TCG	2	6	1255574	1255579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270371
27611	NC_009486	TTC	2	6	1255624	1255629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270371
27612	NC_009486	GAA	2	6	1255656	1255661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270371
27613	NC_009486	CTC	2	6	1255670	1255675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270371
27614	NC_009486	ACT	2	6	1255685	1255690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270371
27615	NC_009486	T	6	6	1255702	1255707	0 %	100 %	0 %	0 %	148270371
27616	NC_009486	AGG	2	6	1255741	1255746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270371
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