MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 40184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_009486	GTTCT	2	10	1228982	1228991	0 %	60 %	20 %	20 %	148270339
27003	NC_009486	TC	3	6	1229039	1229044	0 %	50 %	0 %	50 %	148270339
27004	NC_009486	AGA	2	6	1229057	1229062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270339
27005	NC_009486	GTC	2	6	1229068	1229073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270339
27006	NC_009486	GT	3	6	1229240	1229245	0 %	50 %	50 %	0 %	148270340
27007	NC_009486	GGC	2	6	1229263	1229268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148270340
27008	NC_009486	CTC	2	6	1229401	1229406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270340
27009	NC_009486	CTT	2	6	1229439	1229444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270340
27010	NC_009486	AAGT	2	8	1229498	1229505	50 %	25 %	25 %	0 %	148270340
27011	NC_009486	ACA	2	6	1229528	1229533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270340
27012	NC_009486	GTCC	2	8	1229575	1229582	0 %	25 %	25 %	50 %	148270340
27013	NC_009486	CGA	2	6	1229583	1229588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270340
27014	NC_009486	T	6	6	1229618	1229623	0 %	100 %	0 %	0 %	148270340
27015	NC_009486	ACC	2	6	1229689	1229694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270341
27016	NC_009486	CAC	2	6	1229714	1229719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270341
27017	NC_009486	AAGA	2	8	1229731	1229738	75 %	0 %	25 %	0 %	148270341
27018	NC_009486	CT	3	6	1229760	1229765	0 %	50 %	0 %	50 %	148270341
27019	NC_009486	GAAA	2	8	1229789	1229796	75 %	0 %	25 %	0 %	148270341
27020	NC_009486	CTG	2	6	1229832	1229837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270341
27021	NC_009486	TTC	2	6	1229854	1229859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270341
27022	NC_009486	CT	3	6	1229944	1229949	0 %	50 %	0 %	50 %	148270341
27023	NC_009486	T	8	8	1229949	1229956	0 %	100 %	0 %	0 %	148270341
27024	NC_009486	CAT	2	6	1229969	1229974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270341
27025	NC_009486	G	6	6	1229990	1229995	0 %	0 %	100 %	0 %	148270341
27026	NC_009486	AGA	2	6	1230020	1230025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270341
27027	NC_009486	CCA	2	6	1230032	1230037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270341
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27029	NC_009486	CT	3	6	1230155	1230160	0 %	50 %	0 %	50 %	148270341
27030	NC_009486	CT	3	6	1230167	1230172	0 %	50 %	0 %	50 %	148270341
27031	NC_009486	ATT	2	6	1230318	1230323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270341
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27033	NC_009486	AAGA	2	8	1230359	1230366	75 %	0 %	25 %	0 %	148270341
27034	NC_009486	GTG	2	6	1230402	1230407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270341
27035	NC_009486	GGA	2	6	1230453	1230458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270341
27036	NC_009486	A	6	6	1230516	1230521	100 %	0 %	0 %	0 %	148270341
27037	NC_009486	AGC	3	9	1230563	1230571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270341
27038	NC_009486	GGT	3	9	1230572	1230580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270341
27039	NC_009486	TCA	2	6	1230618	1230623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270341
27040	NC_009486	TCG	2	6	1230738	1230743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270341
27041	NC_009486	AAC	2	6	1230744	1230749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270341
27042	NC_009486	T	6	6	1230818	1230823	0 %	100 %	0 %	0 %	148270341
27043	NC_009486	TCC	2	6	1230845	1230850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27044	NC_009486	TCA	2	6	1230916	1230921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27045	NC_009486	GATAT	2	10	1230948	1230957	40 %	40 %	20 %	0 %	148270342
27046	NC_009486	A	6	6	1231051	1231056	100 %	0 %	0 %	0 %	148270342
27047	NC_009486	TC	3	6	1231326	1231331	0 %	50 %	0 %	50 %	148270342
27048	NC_009486	CGA	2	6	1231382	1231387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270342
27049	NC_009486	CTG	2	6	1231408	1231413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270342
27050	NC_009486	TGG	2	6	1231418	1231423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270342
27051	NC_009486	ATA	2	6	1231431	1231436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148270342
27052	NC_009486	ACA	2	6	1231462	1231467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270342
27053	NC_009486	TCG	2	6	1231474	1231479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270342
27054	NC_009486	GA	3	6	1231493	1231498	50 %	0 %	50 %	0 %	148270342
27055	NC_009486	AAGA	2	8	1231499	1231506	75 %	0 %	25 %	0 %	148270342
27056	NC_009486	AC	3	6	1231621	1231626	50 %	0 %	0 %	50 %	148270342
27057	NC_009486	AAT	2	6	1231652	1231657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148270342
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27059	NC_009486	A	7	7	1231765	1231771	100 %	0 %	0 %	0 %	148270342
27060	NC_009486	AAAG	2	8	1231778	1231785	75 %	0 %	25 %	0 %	148270342
27061	NC_009486	GAAA	2	8	1231810	1231817	75 %	0 %	25 %	0 %	148270342
27062	NC_009486	GT	3	6	1231818	1231823	0 %	50 %	50 %	0 %	148270342
27063	NC_009486	GAA	2	6	1231865	1231870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270342
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27065	NC_009486	T	7	7	1232083	1232089	0 %	100 %	0 %	0 %	148270343
27066	NC_009486	GTTT	2	8	1232134	1232141	0 %	75 %	25 %	0 %	148270343
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27072	NC_009486	TC	3	6	1232517	1232522	0 %	50 %	0 %	50 %	148270343
27073	NC_009486	ACC	2	6	1232577	1232582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270343
27074	NC_009486	TGGA	2	8	1232589	1232596	25 %	25 %	50 %	0 %	148270343
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27080	NC_009486	TTC	2	6	1232791	1232796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270343
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27084	NC_009486	TTC	2	6	1232877	1232882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270343
27085	NC_009486	TTCATT	2	12	1232898	1232909	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148270343
27086	NC_009486	T	7	7	1232935	1232941	0 %	100 %	0 %	0 %	148270343
27087	NC_009486	TCC	2	6	1232947	1232952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270343
27088	NC_009486	T	6	6	1233029	1233034	0 %	100 %	0 %	0 %	148270344
27089	NC_009486	TTTTC	2	10	1233037	1233046	0 %	80 %	0 %	20 %	148270344
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27093	NC_009486	TATCG	2	10	1233176	1233185	20 %	40 %	20 %	20 %	148270344
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27104	NC_009486	ACA	2	6	1233564	1233569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270344
27105	NC_009486	TCG	2	6	1233594	1233599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270344
27106	NC_009486	CTT	2	6	1233645	1233650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
27107	NC_009486	CAT	2	6	1233664	1233669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270344
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27109	NC_009486	TCCT	2	8	1233770	1233777	0 %	50 %	0 %	50 %	148270344
27110	NC_009486	TCA	2	6	1233793	1233798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270344
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27112	NC_009486	GA	4	8	1233845	1233852	50 %	0 %	50 %	0 %	148270344
27113	NC_009486	GAA	2	6	1233854	1233859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270344
27114	NC_009486	TTC	2	6	1233916	1233921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
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27117	NC_009486	TGG	2	6	1234015	1234020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270344
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27119	NC_009486	CTT	2	6	1234066	1234071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270344
27120	NC_009486	CTTT	2	8	1234111	1234118	0 %	75 %	0 %	25 %	148270344
27121	NC_009486	GTT	2	6	1234158	1234163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270344
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27229	NC_009486	T	6	6	1239121	1239126	0 %	100 %	0 %	0 %	148270348
27230	NC_009486	ATTCTG	2	12	1239136	1239147	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148270348
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27232	NC_009486	TCGCA	2	10	1239234	1239243	20 %	20 %	20 %	40 %	148270348
27233	NC_009486	ACC	2	6	1239266	1239271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270348
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27471	NC_009486	GAA	2	6	1248897	1248902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270361
27472	NC_009486	TCTT	2	8	1248940	1248947	0 %	75 %	0 %	25 %	148270361
27473	NC_009486	TCC	2	6	1248961	1248966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270361
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27475	NC_009486	TCCC	2	8	1249035	1249042	0 %	25 %	0 %	75 %	148270361
27476	NC_009486	TC	3	6	1249114	1249119	0 %	50 %	0 %	50 %	148270361
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27484	NC_009486	AGC	2	6	1249869	1249874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270362
27485	NC_009486	TCTT	2	8	1249948	1249955	0 %	75 %	0 %	25 %	148270362
27486	NC_009486	CTT	2	6	1249982	1249987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270362
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27491	NC_009486	C	6	6	1250198	1250203	0 %	0 %	0 %	100 %	148270363
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27498	NC_009486	ACA	2	6	1250501	1250506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270363
27499	NC_009486	CTT	2	6	1250507	1250512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270363
27500	NC_009486	TGA	2	6	1250562	1250567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270363

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