MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 40184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_009486	CTCGAT	2	12	1207289	1207300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148270315
26503	NC_009486	GATG	2	8	1207315	1207322	25 %	25 %	50 %	0 %	148270315
26504	NC_009486	ACC	2	6	1207329	1207334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270315
26505	NC_009486	AAAT	2	8	1207368	1207375	75 %	25 %	0 %	0 %	148270315
26506	NC_009486	T	6	6	1207526	1207531	0 %	100 %	0 %	0 %	148270316
26507	NC_009486	A	6	6	1207578	1207583	100 %	0 %	0 %	0 %	148270316
26508	NC_009486	AGA	2	6	1207710	1207715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270316
26509	NC_009486	A	6	6	1207729	1207734	100 %	0 %	0 %	0 %	148270316
26510	NC_009486	A	6	6	1207748	1207753	100 %	0 %	0 %	0 %	148270316
26511	NC_009486	AAC	2	6	1207765	1207770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270316
26512	NC_009486	A	6	6	1207814	1207819	100 %	0 %	0 %	0 %	148270316
26513	NC_009486	AAGA	2	8	1207834	1207841	75 %	0 %	25 %	0 %	148270316
26514	NC_009486	AGA	2	6	1207843	1207848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270316
26515	NC_009486	CGGTGT	2	12	1207903	1207914	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148270316
26516	NC_009486	CAG	3	9	1207926	1207934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270316
26517	NC_009486	GAA	2	6	1208042	1208047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270316
26518	NC_009486	ATC	2	6	1208063	1208068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270316
26519	NC_009486	ACA	2	6	1208106	1208111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270316
26520	NC_009486	A	6	6	1208158	1208163	100 %	0 %	0 %	0 %	148270316
26521	NC_009486	TTTG	2	8	1208191	1208198	0 %	75 %	25 %	0 %	148270316
26522	NC_009486	A	6	6	1208225	1208230	100 %	0 %	0 %	0 %	148270316
26523	NC_009486	AGG	2	6	1208343	1208348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270316
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26525	NC_009486	TCGT	2	8	1208388	1208395	0 %	50 %	25 %	25 %	148270316
26526	NC_009486	GGA	2	6	1208417	1208422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270316
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26528	NC_009486	CTT	2	6	1208594	1208599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270316
26529	NC_009486	GT	3	6	1208615	1208620	0 %	50 %	50 %	0 %	148270316
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26534	NC_009486	TGGC	2	8	1208803	1208810	0 %	25 %	50 %	25 %	148270316
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26537	NC_009486	A	6	6	1208931	1208936	100 %	0 %	0 %	0 %	148270317
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26539	NC_009486	CGG	2	6	1208951	1208956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148270317
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26541	NC_009486	TGC	2	6	1208996	1209001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270317
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26544	NC_009486	ATC	2	6	1209042	1209047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270317
26545	NC_009486	GAA	2	6	1209070	1209075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270317
26546	NC_009486	GA	3	6	1209194	1209199	50 %	0 %	50 %	0 %	148270317
26547	NC_009486	AGAGAA	2	12	1209221	1209232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270317
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26549	NC_009486	GT	3	6	1209321	1209326	0 %	50 %	50 %	0 %	148270317
26550	NC_009486	CGA	2	6	1209350	1209355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270317
26551	NC_009486	A	6	6	1209359	1209364	100 %	0 %	0 %	0 %	148270317
26552	NC_009486	CAA	2	6	1209466	1209471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26553	NC_009486	T	7	7	1209506	1209512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26554	NC_009486	AGG	2	6	1209570	1209575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270318
26555	NC_009486	TA	3	6	1209604	1209609	50 %	50 %	0 %	0 %	148270318
26556	NC_009486	CGT	2	6	1209627	1209632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270318
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26568	NC_009486	TAT	2	6	1210359	1210364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270319
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26590	NC_009486	CT	3	6	1211526	1211531	0 %	50 %	0 %	50 %	148270320
26591	NC_009486	TTC	2	6	1211550	1211555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270320
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26593	NC_009486	AG	4	8	1211592	1211599	50 %	0 %	50 %	0 %	148270320
26594	NC_009486	AG	3	6	1211603	1211608	50 %	0 %	50 %	0 %	148270320
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26603	NC_009486	TC	3	6	1211958	1211963	0 %	50 %	0 %	50 %	148270320
26604	NC_009486	CTG	2	6	1212038	1212043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270321
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26609	NC_009486	GAAG	2	8	1212206	1212213	50 %	0 %	50 %	0 %	148270321
26610	NC_009486	GGCAG	2	10	1212219	1212228	20 %	0 %	60 %	20 %	148270321
26611	NC_009486	CGA	2	6	1212295	1212300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270321
26612	NC_009486	T	6	6	1212366	1212371	0 %	100 %	0 %	0 %	148270321
26613	NC_009486	CT	3	6	1212394	1212399	0 %	50 %	0 %	50 %	148270321
26614	NC_009486	ATCT	2	8	1212413	1212420	25 %	50 %	0 %	25 %	148270321
26615	NC_009486	TTTTC	2	10	1212431	1212440	0 %	80 %	0 %	20 %	148270321
26616	NC_009486	TTC	2	6	1212480	1212485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270321
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