MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 40184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_009486	GAAAT	2	10	1164231	1164240	60 %	20 %	20 %	0 %	148270270
25503	NC_009486	GAA	2	6	1164246	1164251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270270
25504	NC_009486	TTG	2	6	1164295	1164300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270270
25505	NC_009486	CAG	2	6	1164417	1164422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270270
25506	NC_009486	TCG	2	6	1164454	1164459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270270
25507	NC_009486	TTC	2	6	1164460	1164465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270270
25508	NC_009486	AAGG	2	8	1164474	1164481	50 %	0 %	50 %	0 %	148270270
25509	NC_009486	AGA	2	6	1164513	1164518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270270
25510	NC_009486	CCT	2	6	1164531	1164536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270270
25511	NC_009486	CGT	2	6	1164677	1164682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270270
25512	NC_009486	AG	3	6	1164719	1164724	50 %	0 %	50 %	0 %	148270270
25513	NC_009486	GAA	2	6	1164728	1164733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270270
25514	NC_009486	AG	3	6	1164780	1164785	50 %	0 %	50 %	0 %	148270270
25515	NC_009486	AAC	3	9	1164791	1164799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270270
25516	NC_009486	AAAC	2	8	1164825	1164832	75 %	0 %	0 %	25 %	148270270
25517	NC_009486	GGA	2	6	1164921	1164926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270270
25518	NC_009486	AG	3	6	1164969	1164974	50 %	0 %	50 %	0 %	148270270
25519	NC_009486	GAA	2	6	1164980	1164985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270270
25520	NC_009486	A	6	6	1165101	1165106	100 %	0 %	0 %	0 %	148270270
25521	NC_009486	AAT	2	6	1165142	1165147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148270270
25522	NC_009486	AGA	2	6	1165209	1165214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270270
25523	NC_009486	TGGAA	2	10	1165226	1165235	40 %	20 %	40 %	0 %	148270270
25524	NC_009486	GGTGAA	2	12	1165253	1165264	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148270270
25525	NC_009486	TTC	2	6	1165310	1165315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270270
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25527	NC_009486	AG	3	6	1165400	1165405	50 %	0 %	50 %	0 %	148270270
25528	NC_009486	AAG	2	6	1165406	1165411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270270
25529	NC_009486	AG	3	6	1165410	1165415	50 %	0 %	50 %	0 %	148270270
25530	NC_009486	ATA	2	6	1165456	1165461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148270271
25531	NC_009486	AAG	2	6	1165501	1165506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270271
25532	NC_009486	TGG	2	6	1165592	1165597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270271
25533	NC_009486	TAC	2	6	1165639	1165644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270271
25534	NC_009486	AG	3	6	1165694	1165699	50 %	0 %	50 %	0 %	148270271
25535	NC_009486	GGAC	2	8	1165835	1165842	25 %	0 %	50 %	25 %	148270271
25536	NC_009486	ATT	2	6	1165856	1165861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270271
25537	NC_009486	ATG	2	6	1165894	1165899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270271
25538	NC_009486	AC	3	6	1166029	1166034	50 %	0 %	0 %	50 %	148270271
25539	NC_009486	CTACGA	2	12	1166067	1166078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148270271
25540	NC_009486	CTA	2	6	1166082	1166087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270271
25541	NC_009486	GAA	2	6	1166233	1166238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270271
25542	NC_009486	AGG	2	6	1166321	1166326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270271
25543	NC_009486	TTC	2	6	1166387	1166392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270271
25544	NC_009486	GA	3	6	1166441	1166446	50 %	0 %	50 %	0 %	148270271
25545	NC_009486	CTT	2	6	1166536	1166541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270271
25546	NC_009486	GAA	2	6	1166601	1166606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270271
25547	NC_009486	CG	3	6	1166650	1166655	0 %	0 %	50 %	50 %	148270271
25548	NC_009486	CT	3	6	1166686	1166691	0 %	50 %	0 %	50 %	148270271
25549	NC_009486	GGT	2	6	1166712	1166717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25551	NC_009486	A	6	6	1166779	1166784	100 %	0 %	0 %	0 %	148270272
25552	NC_009486	TGA	2	6	1166803	1166808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270272
25553	NC_009486	ACA	2	6	1166827	1166832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270272
25554	NC_009486	GA	3	6	1166919	1166924	50 %	0 %	50 %	0 %	148270272
25555	NC_009486	TTCGA	2	10	1166928	1166937	20 %	40 %	20 %	20 %	148270272
25556	NC_009486	TGGAAG	2	12	1166968	1166979	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148270272
25557	NC_009486	AG	3	6	1166988	1166993	50 %	0 %	50 %	0 %	148270272
25558	NC_009486	GTG	2	6	1166996	1167001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270272
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25572	NC_009486	TGAA	2	8	1167424	1167431	50 %	25 %	25 %	0 %	148270273
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25578	NC_009486	CGC	2	6	1167636	1167641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148270274
25579	NC_009486	TAC	2	6	1167655	1167660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270274
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25582	NC_009486	TTTC	2	8	1167776	1167783	0 %	75 %	0 %	25 %	148270274
25583	NC_009486	AGAA	2	8	1167804	1167811	75 %	0 %	25 %	0 %	148270274
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25591	NC_009486	TC	4	8	1168070	1168077	0 %	50 %	0 %	50 %	148270274
25592	NC_009486	AAG	2	6	1168171	1168176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270274
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25601	NC_009486	AGAAA	2	10	1168499	1168508	80 %	0 %	20 %	0 %	148270275
25602	NC_009486	GTG	2	6	1168563	1168568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270275
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25605	NC_009486	GA	3	6	1168704	1168709	50 %	0 %	50 %	0 %	148270276
25606	NC_009486	CCT	2	6	1168720	1168725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270276
25607	NC_009486	AG	3	6	1168774	1168779	50 %	0 %	50 %	0 %	148270276
25608	NC_009486	TCT	2	6	1168788	1168793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270276
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25611	NC_009486	TAT	2	6	1168973	1168978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270276
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25980	NC_009486	GA	4	8	1183317	1183324	50 %	0 %	50 %	0 %	148270288
25981	NC_009486	CGA	2	6	1183350	1183355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270288
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25983	NC_009486	GAGCA	2	10	1183387	1183396	40 %	0 %	40 %	20 %	148270288
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