MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 40184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_009486	CCT	2	6	1118358	1118363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24502	NC_009486	CAA	2	6	1118428	1118433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24503	NC_009486	A	6	6	1118458	1118463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24504	NC_009486	ACAA	2	8	1118468	1118475	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24505	NC_009486	ATC	2	6	1118505	1118510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24506	NC_009486	TTC	2	6	1118526	1118531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24507	NC_009486	AC	3	6	1118678	1118683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24508	NC_009486	T	6	6	1118699	1118704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24509	NC_009486	TCC	2	6	1118716	1118721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24510	NC_009486	AC	3	6	1118741	1118746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24511	NC_009486	AG	3	6	1118748	1118753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24512	NC_009486	AAT	2	6	1118782	1118787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24513	NC_009486	AAGAA	2	10	1118801	1118810	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24514	NC_009486	A	6	6	1118818	1118823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24515	NC_009486	AGA	2	6	1118825	1118830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24516	NC_009486	AAG	2	6	1118912	1118917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24517	NC_009486	GT	3	6	1118928	1118933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24518	NC_009486	ACT	2	6	1118943	1118948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24519	NC_009486	ATC	2	6	1119017	1119022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24520	NC_009486	ATT	2	6	1119024	1119029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24521	NC_009486	AC	3	6	1119125	1119130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24522	NC_009486	TAA	2	6	1119197	1119202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24523	NC_009486	AGA	2	6	1119326	1119331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270219
24524	NC_009486	AG	3	6	1119348	1119353	50 %	0 %	50 %	0 %	148270219
24525	NC_009486	ATC	2	6	1119388	1119393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270219
24526	NC_009486	GAA	2	6	1119411	1119416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270219
24527	NC_009486	A	6	6	1119415	1119420	100 %	0 %	0 %	0 %	148270219
24528	NC_009486	TGA	2	6	1119451	1119456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270219
24529	NC_009486	GTG	2	6	1119457	1119462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270219
24530	NC_009486	CAGG	2	8	1119479	1119486	25 %	0 %	50 %	25 %	148270219
24531	NC_009486	GATACA	2	12	1119517	1119528	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148270219
24532	NC_009486	ACG	2	6	1119535	1119540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148270219
24533	NC_009486	GTG	2	6	1119575	1119580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148270219
24534	NC_009486	CTG	2	6	1119590	1119595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270219
24535	NC_009486	G	7	7	1119606	1119612	0 %	0 %	100 %	0 %	148270219
24536	NC_009486	GAA	2	6	1119631	1119636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270219
24537	NC_009486	G	6	6	1119647	1119652	0 %	0 %	100 %	0 %	148270220
24538	NC_009486	GTT	2	6	1119668	1119673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270220
24539	NC_009486	TCTAC	2	10	1119676	1119685	20 %	40 %	0 %	40 %	148270220
24540	NC_009486	TCT	2	6	1119811	1119816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270220
24541	NC_009486	CTTT	2	8	1119854	1119861	0 %	75 %	0 %	25 %	148270220
24542	NC_009486	AGAA	2	8	1119875	1119882	75 %	0 %	25 %	0 %	148270220
24543	NC_009486	TCA	2	6	1119891	1119896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270220
24544	NC_009486	TTC	2	6	1119950	1119955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270220
24545	NC_009486	T	6	6	1119980	1119985	0 %	100 %	0 %	0 %	148270220
24546	NC_009486	TTC	2	6	1120022	1120027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270220
24547	NC_009486	ATC	2	6	1120073	1120078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270220
24548	NC_009486	AT	3	6	1120101	1120106	50 %	50 %	0 %	0 %	148270221
24549	NC_009486	GAA	2	6	1120144	1120149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270221
24550	NC_009486	TAC	2	6	1120159	1120164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270221
24551	NC_009486	TCC	2	6	1120211	1120216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270221
24552	NC_009486	CTT	3	9	1120243	1120251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270221
24553	NC_009486	AAC	2	6	1120261	1120266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270221
24554	NC_009486	GAAAA	2	10	1120275	1120284	80 %	0 %	20 %	0 %	148270221
24555	NC_009486	CTC	2	6	1120326	1120331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270221
24556	NC_009486	CTC	2	6	1120369	1120374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270221
24557	NC_009486	A	6	6	1120407	1120412	100 %	0 %	0 %	0 %	148270221
24558	NC_009486	T	6	6	1120437	1120442	0 %	100 %	0 %	0 %	148270221
24559	NC_009486	GAA	2	6	1120443	1120448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270221
24560	NC_009486	GAAA	2	8	1120492	1120499	75 %	0 %	25 %	0 %	148270221
24561	NC_009486	GAA	2	6	1120573	1120578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270221
24562	NC_009486	TAC	2	6	1120597	1120602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270221
24563	NC_009486	CAT	2	6	1120632	1120637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270221
24564	NC_009486	A	6	6	1120671	1120676	100 %	0 %	0 %	0 %	148270221
24565	NC_009486	GAA	2	6	1120749	1120754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270221
24566	NC_009486	TGA	2	6	1120761	1120766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270221
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24569	NC_009486	T	6	6	1121023	1121028	0 %	100 %	0 %	0 %	148270222
24570	NC_009486	TCT	2	6	1121092	1121097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270222
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24572	NC_009486	AAG	2	6	1121248	1121253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270222
24573	NC_009486	GAA	2	6	1121263	1121268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270222
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24575	NC_009486	CTC	2	6	1121299	1121304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148270222
24576	NC_009486	CTT	2	6	1121345	1121350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270222
24577	NC_009486	GAAG	2	8	1121355	1121362	50 %	0 %	50 %	0 %	148270222
24578	NC_009486	CTT	2	6	1121409	1121414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270222
24579	NC_009486	CTT	2	6	1121432	1121437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270222
24580	NC_009486	GC	3	6	1121467	1121472	0 %	0 %	50 %	50 %	148270223
24581	NC_009486	TGT	2	6	1121503	1121508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270223
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24584	NC_009486	GTAC	2	8	1121659	1121666	25 %	25 %	25 %	25 %	148270223
24585	NC_009486	TC	3	6	1121702	1121707	0 %	50 %	0 %	50 %	148270223
24586	NC_009486	GT	3	6	1121861	1121866	0 %	50 %	50 %	0 %	148270223
24587	NC_009486	TTC	2	6	1121882	1121887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270223
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24589	NC_009486	AGA	2	6	1121980	1121985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270223
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24591	NC_009486	AGT	2	6	1122052	1122057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270223
24592	NC_009486	T	8	8	1122135	1122142	0 %	100 %	0 %	0 %	148270223
24593	NC_009486	TTC	2	6	1122179	1122184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270223
24594	NC_009486	AAG	2	6	1122185	1122190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270223
24595	NC_009486	TGT	2	6	1122196	1122201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148270223
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24598	NC_009486	T	7	7	1122475	1122481	0 %	100 %	0 %	0 %	148270223
24599	NC_009486	TCT	3	9	1122486	1122494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270223
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24602	NC_009486	G	6	6	1122547	1122552	0 %	0 %	100 %	0 %	148270223
24603	NC_009486	CAC	2	6	1122585	1122590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148270224
24604	NC_009486	TTC	2	6	1122704	1122709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270224
24605	NC_009486	TCG	2	6	1122719	1122724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270224
24606	NC_009486	TAT	2	6	1122745	1122750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148270224
24607	NC_009486	GTA	2	6	1122754	1122759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148270224
24608	NC_009486	CT	4	8	1122777	1122784	0 %	50 %	0 %	50 %	148270224
24609	NC_009486	TCCGTA	2	12	1122874	1122885	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148270224
24610	NC_009486	GGA	2	6	1123027	1123032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148270224
24611	NC_009486	GCTT	2	8	1123105	1123112	0 %	50 %	25 %	25 %	148270224
24612	NC_009486	TTC	2	6	1123163	1123168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270224
24613	NC_009486	TCA	2	6	1123187	1123192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148270224
24614	NC_009486	TCT	2	6	1123193	1123198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148270224
24615	NC_009486	AAG	2	6	1123237	1123242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270224
24616	NC_009486	CGAA	2	8	1123253	1123260	50 %	0 %	25 %	25 %	148270224
24617	NC_009486	AGA	2	6	1123262	1123267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148270224
24618	NC_009486	ACA	2	6	1123331	1123336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148270224
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24854	NC_009486	GGGA	2	8	1134120	1134127	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24855	NC_009486	TCG	2	6	1134140	1134145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148270235
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