MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 40184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_009486	AGGG	2	8	726155	726162	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_009486	CCCT	2	8	726167	726174	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16003	NC_009486	TTC	2	6	726196	726201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269859
16004	NC_009486	GTA	2	6	726216	726221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269859
16005	NC_009486	GAA	2	6	726227	726232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269859
16006	NC_009486	CTT	2	6	726282	726287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269859
16007	NC_009486	TCG	2	6	726328	726333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269859
16008	NC_009486	CTG	2	6	726379	726384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269859
16009	NC_009486	GCCTCC	2	12	726393	726404	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148269859
16010	NC_009486	ACTTC	2	10	726446	726455	20 %	40 %	0 %	40 %	148269859
16011	NC_009486	TCT	2	6	726456	726461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269859
16012	NC_009486	CCA	2	6	726473	726478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269859
16013	NC_009486	CAC	2	6	726650	726655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269859
16014	NC_009486	CCG	2	6	726674	726679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148269859
16015	NC_009486	CGT	2	6	726704	726709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269859
16016	NC_009486	TTC	2	6	726711	726716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269859
16017	NC_009486	TCT	2	6	726740	726745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269859
16018	NC_009486	TC	3	6	726769	726774	0 %	50 %	0 %	50 %	148269859
16019	NC_009486	GTG	2	6	726775	726780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269859
16020	NC_009486	AAC	2	6	726783	726788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269859
16021	NC_009486	CTT	2	6	726840	726845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269859
16022	NC_009486	ATG	2	6	726859	726864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269859
16023	NC_009486	ACA	2	6	727017	727022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269859
16024	NC_009486	CTTC	2	8	727081	727088	0 %	50 %	0 %	50 %	148269859
16025	NC_009486	TCT	2	6	727146	727151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269859
16026	NC_009486	AGC	2	6	727155	727160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269859
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16028	NC_009486	AAC	2	6	727242	727247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269859
16029	NC_009486	TCTTT	2	10	727253	727262	0 %	80 %	0 %	20 %	148269859
16030	NC_009486	TTC	2	6	727272	727277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269859
16031	NC_009486	GCA	2	6	727330	727335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269859
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16033	NC_009486	AC	3	6	727480	727485	50 %	0 %	0 %	50 %	148269859
16034	NC_009486	CTT	2	6	727532	727537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269859
16035	NC_009486	CGT	2	6	727565	727570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269859
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16041	NC_009486	CA	3	6	727728	727733	50 %	0 %	0 %	50 %	148269859
16042	NC_009486	GTG	2	6	727812	727817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269859
16043	NC_009486	CCT	2	6	727935	727940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16044	NC_009486	ATT	2	6	727980	727985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_009486	CCT	2	6	727996	728001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16046	NC_009486	AT	3	6	728009	728014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_009486	ACT	2	6	728022	728027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577664
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16049	NC_009486	TTC	2	6	728105	728110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577664
16050	NC_009486	CTGAT	2	10	728132	728141	20 %	40 %	20 %	20 %	229577664
16051	NC_009486	GAG	2	6	728206	728211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229577664
16052	NC_009486	CAT	2	6	728238	728243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577664
16053	NC_009486	CTG	2	6	728257	728262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229577664
16054	NC_009486	ATG	2	6	728330	728335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229577664
16055	NC_009486	GCC	2	6	728342	728347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229577664
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16057	NC_009486	GAA	2	6	728385	728390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577664
16058	NC_009486	AGA	2	6	728393	728398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577664
16059	NC_009486	TCT	2	6	728408	728413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577664
16060	NC_009486	CT	3	6	728419	728424	0 %	50 %	0 %	50 %	229577664
16061	NC_009486	CTTC	2	8	728444	728451	0 %	50 %	0 %	50 %	229577664
16062	NC_009486	CTA	2	6	728463	728468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577664
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16065	NC_009486	AAG	2	6	728581	728586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577664
16066	NC_009486	TTG	2	6	728588	728593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229577664
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16070	NC_009486	GTTT	2	8	728741	728748	0 %	75 %	25 %	0 %	229577664
16071	NC_009486	CGGT	2	8	728790	728797	0 %	25 %	50 %	25 %	229577664
16072	NC_009486	GTA	2	6	728830	728835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229577664
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16074	NC_009486	CCAT	2	8	728870	728877	25 %	25 %	0 %	50 %	229577664
16075	NC_009486	CCAG	2	8	728919	728926	25 %	0 %	25 %	50 %	229577664
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16085	NC_009486	GCC	2	6	729258	729263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148269861
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16091	NC_009486	AC	3	6	729534	729539	50 %	0 %	0 %	50 %	148269861
16092	NC_009486	AGGA	2	8	729580	729587	50 %	0 %	50 %	0 %	148269861
16093	NC_009486	TCG	2	6	729636	729641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269861
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16097	NC_009486	GCT	2	6	729863	729868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269861
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16100	NC_009486	ACTC	2	8	729917	729924	25 %	25 %	0 %	50 %	148269861
16101	NC_009486	AG	3	6	729936	729941	50 %	0 %	50 %	0 %	148269861
16102	NC_009486	ATT	2	6	729945	729950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148269861
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16104	NC_009486	CAA	2	6	729998	730003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269861
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16106	NC_009486	G	6	6	730033	730038	0 %	0 %	100 %	0 %	148269861
16107	NC_009486	TTC	2	6	730040	730045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269861
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16109	NC_009486	TCC	2	6	730163	730168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269861
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16111	NC_009486	AGGG	2	8	730251	730258	25 %	0 %	75 %	0 %	148269861
16112	NC_009486	TCCC	2	8	730262	730269	0 %	25 %	0 %	75 %	148269861
16113	NC_009486	CTT	2	6	730278	730283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269861
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16117	NC_009486	CTT	2	6	730399	730404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269862
16118	NC_009486	AG	4	8	730495	730502	50 %	0 %	50 %	0 %	148269862
16119	NC_009486	CT	3	6	730527	730532	0 %	50 %	0 %	50 %	148269862
16120	NC_009486	TTC	2	6	730616	730621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269862
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16122	NC_009486	GAT	2	6	730660	730665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269862
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16496	NC_009486	AGA	2	6	747956	747961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269878
16497	NC_009486	GCAAA	2	10	747995	748004	60 %	0 %	20 %	20 %	148269878
16498	NC_009486	ATC	2	6	748006	748011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269878
16499	NC_009486	TCGT	2	8	748121	748128	0 %	50 %	25 %	25 %	148269878
16500	NC_009486	T	6	6	748269	748274	0 %	100 %	0 %	0 %	148269878

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