MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 40184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_009486	GGA	2	6	45935	45940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269195
1003	NC_009486	AG	3	6	45970	45975	50 %	0 %	50 %	0 %	148269195
1004	NC_009486	TCA	2	6	46072	46077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269195
1005	NC_009486	AGA	2	6	46132	46137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269195
1006	NC_009486	ACA	2	6	46138	46143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269195
1007	NC_009486	CAT	2	6	46151	46156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269195
1008	NC_009486	GA	3	6	46171	46176	50 %	0 %	50 %	0 %	148269195
1009	NC_009486	AACG	2	8	46211	46218	50 %	0 %	25 %	25 %	148269195
1010	NC_009486	TCA	2	6	46225	46230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269195
1011	NC_009486	GAA	2	6	46293	46298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269195
1012	NC_009486	TGG	2	6	46372	46377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_009486	TTG	2	6	46387	46392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_009486	A	7	7	46426	46432	100 %	0 %	0 %	0 %	148269196
1015	NC_009486	TGCT	2	8	46464	46471	0 %	50 %	25 %	25 %	148269196
1016	NC_009486	TGG	2	6	46485	46490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269196
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1018	NC_009486	ACC	2	6	46594	46599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269196
1019	NC_009486	CGA	2	6	46600	46605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269196
1020	NC_009486	CT	3	6	46684	46689	0 %	50 %	0 %	50 %	148269196
1021	NC_009486	TTG	2	6	46692	46697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269196
1022	NC_009486	ACTC	2	8	46738	46745	25 %	25 %	0 %	50 %	148269196
1023	NC_009486	TTG	3	9	46758	46766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269196
1024	NC_009486	CTTTT	2	10	46788	46797	0 %	80 %	0 %	20 %	148269196
1025	NC_009486	T	7	7	46794	46800	0 %	100 %	0 %	0 %	148269196
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1029	NC_009486	AT	3	6	47061	47066	50 %	50 %	0 %	0 %	148269196
1030	NC_009486	AAGG	2	8	47119	47126	50 %	0 %	50 %	0 %	148269196
1031	NC_009486	GAAA	2	8	47215	47222	75 %	0 %	25 %	0 %	148269196
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1056	NC_009486	GGA	2	6	48001	48006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269198
1057	NC_009486	CTC	2	6	48074	48079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269198
1058	NC_009486	AGA	2	6	48139	48144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269198
1059	NC_009486	ACT	2	6	48161	48166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269198
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1061	NC_009486	GAA	2	6	48229	48234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269198
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1063	NC_009486	TCTCA	2	10	48288	48297	20 %	40 %	0 %	40 %	148269198
1064	NC_009486	CTG	2	6	48299	48304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269198
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1066	NC_009486	ACT	2	6	48353	48358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269198
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1109	NC_009486	GTT	2	6	50236	50241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269199
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1113	NC_009486	TC	3	6	50468	50473	0 %	50 %	0 %	50 %	148269199
1114	NC_009486	GAAG	2	8	50484	50491	50 %	0 %	50 %	0 %	148269199
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1121	NC_009486	TCT	2	6	50901	50906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_009486	AC	3	6	50924	50929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_009486	TA	3	6	50933	50938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_009486	A	6	6	50938	50943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009486	GTTT	2	8	50991	50998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_009486	T	8	8	51003	51010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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