MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga petrophila RKU-1 chromosome

Total Repeats: 40184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_009486	CAA	2	6	586692	586697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269726
13003	NC_009486	A	6	6	586696	586701	100 %	0 %	0 %	0 %	148269726
13004	NC_009486	GAA	2	6	586723	586728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269726
13005	NC_009486	CTT	2	6	586879	586884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269726
13006	NC_009486	CAA	2	6	586965	586970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269726
13007	NC_009486	ACG	3	9	587048	587056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269726
13008	NC_009486	AGA	2	6	587082	587087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269726
13009	NC_009486	GAA	2	6	587095	587100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269726
13010	NC_009486	CGA	2	6	587115	587120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269726
13011	NC_009486	ATC	2	6	587209	587214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269726
13012	NC_009486	TCT	2	6	587285	587290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269726
13013	NC_009486	GAA	2	6	587310	587315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269726
13014	NC_009486	TCTCTT	2	12	587375	587386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269726
13015	NC_009486	AT	3	6	587418	587423	50 %	50 %	0 %	0 %	148269726
13016	NC_009486	AGA	2	6	587457	587462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269726
13017	NC_009486	TGA	2	6	587474	587479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269726
13018	NC_009486	GA	3	6	587557	587562	50 %	0 %	50 %	0 %	148269726
13019	NC_009486	CTT	2	6	587569	587574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269726
13020	NC_009486	GAT	2	6	587581	587586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269726
13021	NC_009486	AG	3	6	587665	587670	50 %	0 %	50 %	0 %	148269727
13022	NC_009486	GAAG	2	8	587711	587718	50 %	0 %	50 %	0 %	148269727
13023	NC_009486	GAT	2	6	587761	587766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269727
13024	NC_009486	AAGAA	2	10	587767	587776	80 %	0 %	20 %	0 %	148269727
13025	NC_009486	AGAA	2	8	587818	587825	75 %	0 %	25 %	0 %	148269727
13026	NC_009486	GAC	2	6	587852	587857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269727
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13028	NC_009486	AAC	2	6	587881	587886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269727
13029	NC_009486	GGAT	2	8	587917	587924	25 %	25 %	50 %	0 %	148269727
13030	NC_009486	CCAA	2	8	587927	587934	50 %	0 %	0 %	50 %	148269727
13031	NC_009486	AT	3	6	587967	587972	50 %	50 %	0 %	0 %	148269727
13032	NC_009486	ATA	2	6	587999	588004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148269727
13033	NC_009486	GA	3	6	588031	588036	50 %	0 %	50 %	0 %	148269727
13034	NC_009486	AG	3	6	588042	588047	50 %	0 %	50 %	0 %	148269727
13035	NC_009486	A	7	7	588054	588060	100 %	0 %	0 %	0 %	148269727
13036	NC_009486	GGA	2	6	588073	588078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148269727
13037	NC_009486	TAC	2	6	588080	588085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269727
13038	NC_009486	AGC	2	6	588095	588100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269727
13039	NC_009486	A	7	7	588163	588169	100 %	0 %	0 %	0 %	148269727
13040	NC_009486	AGA	2	6	588232	588237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269727
13041	NC_009486	TTC	2	6	588337	588342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269728
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13043	NC_009486	CAA	2	6	588378	588383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148269728
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13047	NC_009486	TGG	2	6	588538	588543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148269728
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13049	NC_009486	TTC	2	6	588577	588582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269728
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13051	NC_009486	TTC	2	6	588621	588626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269728
13052	NC_009486	TA	3	6	588655	588660	50 %	50 %	0 %	0 %	148269728
13053	NC_009486	GAA	2	6	588719	588724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148269728
13054	NC_009486	TC	3	6	588756	588761	0 %	50 %	0 %	50 %	148269728
13055	NC_009486	CAAA	2	8	588786	588793	75 %	0 %	0 %	25 %	148269728
13056	NC_009486	TTC	2	6	588828	588833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269728
13057	NC_009486	CTT	2	6	588888	588893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269728
13058	NC_009486	TCT	2	6	588902	588907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269728
13059	NC_009486	TCA	2	6	588923	588928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269728
13060	NC_009486	T	7	7	589008	589014	0 %	100 %	0 %	0 %	148269728
13061	NC_009486	CTA	2	6	589130	589135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269728
13062	NC_009486	TTG	2	6	589191	589196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269728
13063	NC_009486	TCT	2	6	589201	589206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269728
13064	NC_009486	GGC	2	6	589291	589296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13066	NC_009486	CTT	2	6	589370	589375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269729
13067	NC_009486	CTT	2	6	589406	589411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269729
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13070	NC_009486	AGC	2	6	589464	589469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269729
13071	NC_009486	CAT	2	6	589470	589475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148269729
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13073	NC_009486	GGAT	2	8	589487	589494	25 %	25 %	50 %	0 %	148269729
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13079	NC_009486	TCC	2	6	589653	589658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269729
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13081	NC_009486	TGAG	2	8	589694	589701	25 %	25 %	50 %	0 %	148269729
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13086	NC_009486	TTTC	2	8	589969	589976	0 %	75 %	0 %	25 %	148269729
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13089	NC_009486	TGT	2	6	590120	590125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148269729
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13091	NC_009486	GT	3	6	590193	590198	0 %	50 %	50 %	0 %	148269729
13092	NC_009486	CTTC	2	8	590219	590226	0 %	50 %	0 %	50 %	148269729
13093	NC_009486	TTA	2	6	590255	590260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148269729
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13104	NC_009486	CAC	2	6	590624	590629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148269730
13105	NC_009486	CAG	2	6	590663	590668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269730
13106	NC_009486	ATG	2	6	590703	590708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148269730
13107	NC_009486	ACAG	2	8	590725	590732	50 %	0 %	25 %	25 %	148269730
13108	NC_009486	CATC	2	8	590857	590864	25 %	25 %	0 %	50 %	148269730
13109	NC_009486	TCT	2	6	590908	590913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269730
13110	NC_009486	T	6	6	591032	591037	0 %	100 %	0 %	0 %	148269730
13111	NC_009486	ACG	2	6	591048	591053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148269730
13112	NC_009486	CT	3	6	591102	591107	0 %	50 %	0 %	50 %	148269730
13113	NC_009486	T	7	7	591145	591151	0 %	100 %	0 %	0 %	148269730
13114	NC_009486	CCT	2	6	591213	591218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148269731
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13117	NC_009486	TTC	2	6	591368	591373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269731
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13120	NC_009486	TGC	2	6	591500	591505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148269731
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13122	NC_009486	CTT	2	6	591528	591533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148269731
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