MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_008698	GAG	2	6	1659575	1659580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720621
35003	NC_008698	CGC	2	6	1659626	1659631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720621
35004	NC_008698	CGA	2	6	1659634	1659639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720621
35005	NC_008698	TAG	2	6	1659659	1659664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720621
35006	NC_008698	CCG	2	6	1659679	1659684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720621
35007	NC_008698	GA	4	8	1659796	1659803	50 %	0 %	50 %	0 %	119720621
35008	NC_008698	AT	3	6	1659821	1659826	50 %	50 %	0 %	0 %	119720621
35009	NC_008698	T	6	6	1659850	1659855	0 %	100 %	0 %	0 %	119720621
35010	NC_008698	A	6	6	1659914	1659919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35011	NC_008698	GTA	2	6	1659997	1660002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720622
35012	NC_008698	TAT	2	6	1660036	1660041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119720622
35013	NC_008698	ACG	2	6	1660058	1660063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720622
35014	NC_008698	TC	3	6	1660077	1660082	0 %	50 %	0 %	50 %	119720622
35015	NC_008698	CAGT	2	8	1660118	1660125	25 %	25 %	25 %	25 %	119720622
35016	NC_008698	GCATC	2	10	1660139	1660148	20 %	20 %	20 %	40 %	119720622
35017	NC_008698	GAA	2	6	1660174	1660179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720622
35018	NC_008698	GGA	2	6	1660200	1660205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720622
35019	NC_008698	CTCC	2	8	1660254	1660261	0 %	25 %	0 %	75 %	119720622
35020	NC_008698	GAG	2	6	1660381	1660386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720622
35021	NC_008698	TTA	2	6	1660473	1660478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119720622
35022	NC_008698	TCAGC	2	10	1660677	1660686	20 %	20 %	20 %	40 %	119720622
35023	NC_008698	CGG	2	6	1660711	1660716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720622
35024	NC_008698	TCT	2	6	1660719	1660724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720622
35025	NC_008698	CAC	2	6	1660761	1660766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720622
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35027	NC_008698	TC	3	6	1660891	1660896	0 %	50 %	0 %	50 %	119720622
35028	NC_008698	AAC	2	6	1660951	1660956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119720622
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35032	NC_008698	TTAT	2	8	1661192	1661199	25 %	75 %	0 %	0 %	119720622
35033	NC_008698	TCA	2	6	1661216	1661221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720622
35034	NC_008698	TCA	2	6	1661320	1661325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720623
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35040	NC_008698	TCG	2	6	1661775	1661780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720623
35041	NC_008698	A	6	6	1661870	1661875	100 %	0 %	0 %	0 %	119720623
35042	NC_008698	TCA	2	6	1661908	1661913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720623
35043	NC_008698	AGT	2	6	1661980	1661985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720623
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35045	NC_008698	AC	3	6	1662020	1662025	50 %	0 %	0 %	50 %	119720623
35046	NC_008698	AGT	2	6	1662150	1662155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720623
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35049	NC_008698	CGT	2	6	1662250	1662255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35050	NC_008698	CTT	2	6	1662278	1662283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35051	NC_008698	TCA	2	6	1662292	1662297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35052	NC_008698	GTT	2	6	1662328	1662333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35053	NC_008698	CG	3	6	1662334	1662339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35054	NC_008698	CCA	2	6	1662393	1662398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35055	NC_008698	GTA	2	6	1662492	1662497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35056	NC_008698	TAT	2	6	1662531	1662536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35057	NC_008698	ACG	2	6	1662553	1662558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35058	NC_008698	TC	3	6	1662572	1662577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35059	NC_008698	CG	4	8	1662583	1662590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35060	NC_008698	AT	3	6	1662609	1662614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35061	NC_008698	ATT	2	6	1662626	1662631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35062	NC_008698	TAA	2	6	1662667	1662672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35063	NC_008698	CAA	2	6	1662726	1662731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35091	NC_008698	AAG	2	6	1664072	1664077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35093	NC_008698	ATTCC	2	10	1664266	1664275	20 %	40 %	0 %	40 %	119720625
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35095	NC_008698	TTC	2	6	1664330	1664335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720625
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35100	NC_008698	TTGC	2	8	1664568	1664575	0 %	50 %	25 %	25 %	119720625
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35102	NC_008698	CGA	2	6	1664614	1664619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720625
35103	NC_008698	ATTT	2	8	1664654	1664661	25 %	75 %	0 %	0 %	119720625
35104	NC_008698	TAC	2	6	1664723	1664728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720625
35105	NC_008698	TCT	2	6	1664753	1664758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720625
35106	NC_008698	CCTTC	2	10	1664828	1664837	0 %	40 %	0 %	60 %	119720625
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35111	NC_008698	TTTA	2	8	1665131	1665138	25 %	75 %	0 %	0 %	119720625
35112	NC_008698	TTC	2	6	1665165	1665170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720625
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35116	NC_008698	TA	3	6	1665412	1665417	50 %	50 %	0 %	0 %	119720626
35117	NC_008698	T	7	7	1665426	1665432	0 %	100 %	0 %	0 %	119720626
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35119	NC_008698	GTA	2	6	1665648	1665653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720626
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35475	NC_008698	C	6	6	1682060	1682065	0 %	0 %	0 %	100 %	119720641
35476	NC_008698	CGC	2	6	1682084	1682089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720641
35477	NC_008698	GGC	2	6	1682119	1682124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720641
35478	NC_008698	CGG	2	6	1682146	1682151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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35482	NC_008698	CGG	2	6	1682452	1682457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720642
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35487	NC_008698	G	6	6	1682764	1682769	0 %	0 %	100 %	0 %	119720642
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