MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_008698	GGA	2	6	1610142	1610147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720565
34002	NC_008698	CGC	2	6	1610322	1610327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720565
34003	NC_008698	GAG	3	9	1610361	1610369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720565
34004	NC_008698	CCTT	2	8	1610402	1610409	0 %	50 %	0 %	50 %	119720565
34005	NC_008698	CA	3	6	1610458	1610463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34006	NC_008698	TAC	2	6	1610599	1610604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720566
34007	NC_008698	CACC	2	8	1610675	1610682	25 %	0 %	0 %	75 %	119720566
34008	NC_008698	TCG	2	6	1610723	1610728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720566
34009	NC_008698	GGGT	2	8	1610812	1610819	0 %	25 %	75 %	0 %	119720566
34010	NC_008698	ACG	2	6	1610840	1610845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720566
34011	NC_008698	ACC	2	6	1610873	1610878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720566
34012	NC_008698	CGA	2	6	1610886	1610891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720566
34013	NC_008698	GGGCG	2	10	1610892	1610901	0 %	0 %	80 %	20 %	119720566
34014	NC_008698	GCCC	2	8	1611065	1611072	0 %	0 %	25 %	75 %	119720566
34015	NC_008698	AACG	2	8	1611081	1611088	50 %	0 %	25 %	25 %	119720566
34016	NC_008698	T	6	6	1611160	1611165	0 %	100 %	0 %	0 %	119720567
34017	NC_008698	AGG	2	6	1611313	1611318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720567
34018	NC_008698	CGC	2	6	1611349	1611354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720567
34019	NC_008698	GAG	2	6	1611375	1611380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720567
34020	NC_008698	GC	3	6	1611384	1611389	0 %	0 %	50 %	50 %	119720567
34021	NC_008698	CCT	2	6	1611479	1611484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720567
34022	NC_008698	GTC	2	6	1611504	1611509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720567
34023	NC_008698	GT	3	6	1611539	1611544	0 %	50 %	50 %	0 %	119720567
34024	NC_008698	GGC	2	6	1611558	1611563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720567
34025	NC_008698	GGA	2	6	1611587	1611592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720567
34026	NC_008698	GA	3	6	1611591	1611596	50 %	0 %	50 %	0 %	119720567
34027	NC_008698	CGG	2	6	1611610	1611615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720567
34028	NC_008698	TCG	2	6	1611661	1611666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720567
34029	NC_008698	GAG	2	6	1611702	1611707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720567
34030	NC_008698	AGG	2	6	1611738	1611743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720567
34031	NC_008698	CGA	2	6	1611764	1611769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720567
34032	NC_008698	TCC	2	6	1611811	1611816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720567
34033	NC_008698	CGT	2	6	1611839	1611844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720567
34034	NC_008698	CGT	2	6	1611899	1611904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720567
34035	NC_008698	AGA	2	6	1611911	1611916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720567
34036	NC_008698	CGA	2	6	1611943	1611948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720567
34037	NC_008698	CCGC	2	8	1611963	1611970	0 %	0 %	25 %	75 %	119720567
34038	NC_008698	CTA	2	6	1612029	1612034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720567
34039	NC_008698	GAG	2	6	1612035	1612040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720567
34040	NC_008698	AGG	3	9	1612047	1612055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720567
34041	NC_008698	CGC	2	6	1612058	1612063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720567
34042	NC_008698	AGG	2	6	1612141	1612146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720567
34043	NC_008698	GAG	2	6	1612166	1612171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720567
34044	NC_008698	GAA	2	6	1612334	1612339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720567
34045	NC_008698	GGGT	2	8	1612343	1612350	0 %	25 %	75 %	0 %	119720567
34046	NC_008698	GCT	2	6	1612403	1612408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720568
34047	NC_008698	CGTT	2	8	1612458	1612465	0 %	50 %	25 %	25 %	119720568
34048	NC_008698	CGC	2	6	1612530	1612535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720568
34049	NC_008698	GGCT	2	8	1612550	1612557	0 %	25 %	50 %	25 %	119720568
34050	NC_008698	TGT	2	6	1612561	1612566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119720568
34051	NC_008698	CAT	2	6	1612609	1612614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720568
34052	NC_008698	TCG	2	6	1612626	1612631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720568
34053	NC_008698	CGTACT	2	12	1612642	1612653	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119720568
34054	NC_008698	ATA	2	6	1612661	1612666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720568
34055	NC_008698	TAC	2	6	1612727	1612732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720568
34056	NC_008698	G	6	6	1612733	1612738	0 %	0 %	100 %	0 %	119720568
34057	NC_008698	CTC	2	6	1612760	1612765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720568
34058	NC_008698	CTG	2	6	1612808	1612813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720568
34059	NC_008698	TCA	2	6	1612907	1612912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720569
34060	NC_008698	GGA	2	6	1612923	1612928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720569
34061	NC_008698	GAGG	2	8	1613037	1613044	25 %	0 %	75 %	0 %	119720569
34062	NC_008698	CGG	2	6	1613082	1613087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720569
34063	NC_008698	CTC	2	6	1613189	1613194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720569
34064	NC_008698	CTT	2	6	1613199	1613204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720569
34065	NC_008698	ATA	2	6	1613269	1613274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720569
34066	NC_008698	ACA	2	6	1613279	1613284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119720569
34067	NC_008698	GGCG	2	8	1613355	1613362	0 %	0 %	75 %	25 %	119720569
34068	NC_008698	AGGA	2	8	1613425	1613432	50 %	0 %	50 %	0 %	119720569
34069	NC_008698	CGA	2	6	1613454	1613459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720569
34070	NC_008698	CCT	2	6	1613460	1613465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720569
34071	NC_008698	TGA	2	6	1613477	1613482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720569
34072	NC_008698	CGG	2	6	1613493	1613498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720569
34073	NC_008698	CGC	2	6	1613517	1613522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720569
34074	NC_008698	ACG	2	6	1613546	1613551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720569
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34076	NC_008698	GGA	2	6	1613730	1613735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720569
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34078	NC_008698	TCG	2	6	1613815	1613820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720570
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34082	NC_008698	ACG	2	6	1613938	1613943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720570
34083	NC_008698	CCCTGG	2	12	1613945	1613956	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119720570
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34085	NC_008698	GC	3	6	1614017	1614022	0 %	0 %	50 %	50 %	119720570
34086	NC_008698	CA	3	6	1614025	1614030	50 %	0 %	0 %	50 %	119720570
34087	NC_008698	TCC	2	6	1614040	1614045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720570
34088	NC_008698	TCC	2	6	1614061	1614066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720570
34089	NC_008698	CGA	3	9	1614068	1614076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720570
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34098	NC_008698	CGT	2	6	1614575	1614580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720570
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34100	NC_008698	AGC	2	6	1614678	1614683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720570
34101	NC_008698	CCT	2	6	1614726	1614731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720570
34102	NC_008698	GAG	2	6	1614741	1614746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720570
34103	NC_008698	CTC	2	6	1614747	1614752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720570
34104	NC_008698	CCT	2	6	1614811	1614816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720571
34105	NC_008698	GC	3	6	1614846	1614851	0 %	0 %	50 %	50 %	119720571
34106	NC_008698	ATC	2	6	1614941	1614946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720571
34107	NC_008698	GAG	2	6	1615003	1615008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720571
34108	NC_008698	GA	3	6	1615073	1615078	50 %	0 %	50 %	0 %	119720571
34109	NC_008698	CCGC	2	8	1615103	1615110	0 %	0 %	25 %	75 %	119720571
34110	NC_008698	GCC	2	6	1615121	1615126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720571
34111	NC_008698	GAC	2	6	1615153	1615158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720571
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34114	NC_008698	ACT	2	6	1615434	1615439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720572
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