MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_008698	GAA	3	9	1564065	1564073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720521
33003	NC_008698	ACGA	2	8	1564222	1564229	50 %	0 %	25 %	25 %	119720521
33004	NC_008698	AGA	2	6	1564331	1564336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720521
33005	NC_008698	AGG	2	6	1564382	1564387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720521
33006	NC_008698	C	6	6	1564438	1564443	0 %	0 %	0 %	100 %	119720521
33007	NC_008698	A	6	6	1564588	1564593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33008	NC_008698	TCC	2	6	1564598	1564603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720522
33009	NC_008698	TC	3	6	1564742	1564747	0 %	50 %	0 %	50 %	119720522
33010	NC_008698	AGC	2	6	1564760	1564765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720522
33011	NC_008698	CTG	2	6	1564798	1564803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720522
33012	NC_008698	TCT	2	6	1564806	1564811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720522
33013	NC_008698	CTT	2	6	1564832	1564837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720522
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33015	NC_008698	CGA	2	6	1564903	1564908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720522
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33017	NC_008698	GTA	2	6	1564943	1564948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720522
33018	NC_008698	GGC	2	6	1565051	1565056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720522
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33022	NC_008698	CT	3	6	1565205	1565210	0 %	50 %	0 %	50 %	119720522
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33031	NC_008698	CTT	2	6	1565774	1565779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720522
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33033	NC_008698	AGGCTT	2	12	1565837	1565848	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119720522
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33036	NC_008698	T	6	6	1565936	1565941	0 %	100 %	0 %	0 %	119720522
33037	NC_008698	GAAA	2	8	1565951	1565958	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33038	NC_008698	ATT	2	6	1565971	1565976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33039	NC_008698	GAG	2	6	1566069	1566074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720523
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33052	NC_008698	GA	3	6	1566830	1566835	50 %	0 %	50 %	0 %	119720523
33053	NC_008698	TAA	2	6	1566858	1566863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720523
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33055	NC_008698	ATC	2	6	1566924	1566929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33056	NC_008698	TA	3	6	1566933	1566938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33057	NC_008698	ATA	2	6	1566957	1566962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33063	NC_008698	GGA	2	6	1567351	1567356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720524
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33071	NC_008698	GAAA	2	8	1567761	1567768	75 %	0 %	25 %	0 %	119720525
33072	NC_008698	CTGG	2	8	1567962	1567969	0 %	25 %	50 %	25 %	119720525
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33090	NC_008698	AG	3	6	1568863	1568868	50 %	0 %	50 %	0 %	119720525
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33101	NC_008698	TATC	2	8	1569503	1569510	25 %	50 %	0 %	25 %	119720526
33102	NC_008698	TAT	2	6	1569564	1569569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119720526
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33108	NC_008698	ATCTAC	2	12	1569924	1569935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720526
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33112	NC_008698	AG	3	6	1570007	1570012	50 %	0 %	50 %	0 %	119720526
33113	NC_008698	ATG	2	6	1570027	1570032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720526
33114	NC_008698	T	6	6	1570079	1570084	0 %	100 %	0 %	0 %	119720526
33115	NC_008698	AAC	2	6	1570167	1570172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119720526
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33118	NC_008698	TAA	2	6	1570214	1570219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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33352	NC_008698	CGA	2	6	1581114	1581119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720537
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33429	NC_008698	GCC	2	6	1584297	1584302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720540
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33432	NC_008698	GGA	2	6	1584523	1584528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720540
33433	NC_008698	GA	3	6	1584552	1584557	50 %	0 %	50 %	0 %	119720540
33434	NC_008698	CAA	2	6	1584581	1584586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119720540
33435	NC_008698	CGG	2	6	1584622	1584627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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33441	NC_008698	TCCTC	2	10	1584804	1584813	0 %	40 %	0 %	60 %	119720541
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33444	NC_008698	ACC	2	6	1584945	1584950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720541
33445	NC_008698	AGC	2	6	1584953	1584958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720541
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33448	NC_008698	ATC	2	6	1585031	1585036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720541
33449	NC_008698	TAT	2	6	1585060	1585065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119720541
33450	NC_008698	GGC	2	6	1585066	1585071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720541
33451	NC_008698	GCCT	2	8	1585151	1585158	0 %	25 %	25 %	50 %	119720541
33452	NC_008698	CGC	2	6	1585171	1585176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720541
33453	NC_008698	GCCT	2	8	1585325	1585332	0 %	25 %	25 %	50 %	119720541
33454	NC_008698	CTT	2	6	1585357	1585362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720541
33455	NC_008698	GCCCG	2	10	1585396	1585405	0 %	0 %	40 %	60 %	119720541
33456	NC_008698	GTA	2	6	1585567	1585572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720541
33457	NC_008698	ACC	2	6	1585664	1585669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720541
33458	NC_008698	TAGC	2	8	1585713	1585720	25 %	25 %	25 %	25 %	119720541
33459	NC_008698	GTT	2	6	1585749	1585754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119720541
33460	NC_008698	GTC	2	6	1585774	1585779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720541
33461	NC_008698	GACCA	2	10	1585859	1585868	40 %	0 %	20 %	40 %	119720541
33462	NC_008698	G	6	6	1585884	1585889	0 %	0 %	100 %	0 %	119720541
33463	NC_008698	CCT	2	6	1585912	1585917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720541
33464	NC_008698	CTATCA	2	12	1586103	1586114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720541
33465	NC_008698	GGC	2	6	1586155	1586160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720541
33466	NC_008698	GAC	2	6	1586161	1586166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720541
33467	NC_008698	CGA	2	6	1586178	1586183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720541
33468	NC_008698	CCGCTA	2	12	1586184	1586195	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119720541
33469	NC_008698	GCC	2	6	1586319	1586324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33470	NC_008698	TCG	2	6	1586374	1586379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33471	NC_008698	TCA	2	6	1586414	1586419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33472	NC_008698	CTAG	2	8	1586422	1586429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33473	NC_008698	TA	3	6	1586444	1586449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33474	NC_008698	TG	3	6	1586455	1586460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33475	NC_008698	AGG	2	6	1586495	1586500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720542
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33477	NC_008698	GAGGT	2	10	1586537	1586546	20 %	20 %	60 %	0 %	119720542
33478	NC_008698	GCC	2	6	1586581	1586586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720542
33479	NC_008698	CGA	2	6	1586664	1586669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720542
33480	NC_008698	GGC	2	6	1586701	1586706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720542
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33483	NC_008698	GGC	3	9	1586737	1586745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720542
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33487	NC_008698	CGG	2	6	1586865	1586870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720542
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33491	NC_008698	GCG	2	6	1586990	1586995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720542
33492	NC_008698	GAG	2	6	1587079	1587084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720542
33493	NC_008698	GAC	3	9	1587200	1587208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720542
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33495	NC_008698	CGA	2	6	1587276	1587281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720542
33496	NC_008698	GAC	2	6	1587295	1587300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720542
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33499	NC_008698	AGAGCG	2	12	1587386	1587397	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	119720542
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