MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_008698	CTG	2	6	1540784	1540789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720492
32502	NC_008698	CTCGG	2	10	1540799	1540808	0 %	20 %	40 %	40 %	119720492
32503	NC_008698	TCG	2	6	1540890	1540895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720492
32504	NC_008698	AAT	2	6	1540927	1540932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720492
32505	NC_008698	GTG	2	6	1540958	1540963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720492
32506	NC_008698	TGA	2	6	1540971	1540976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720492
32507	NC_008698	CGG	2	6	1541023	1541028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720492
32508	NC_008698	G	6	6	1541027	1541032	0 %	0 %	100 %	0 %	119720492
32509	NC_008698	CTC	2	6	1541041	1541046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720492
32510	NC_008698	GCC	2	6	1541105	1541110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720492
32511	NC_008698	CTC	2	6	1541132	1541137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720492
32512	NC_008698	GAT	2	6	1541167	1541172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720492
32513	NC_008698	GCG	2	6	1541227	1541232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720493
32514	NC_008698	AGG	2	6	1541306	1541311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720493
32515	NC_008698	TGG	2	6	1541326	1541331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720493
32516	NC_008698	ACT	2	6	1541345	1541350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720493
32517	NC_008698	TCGT	2	8	1541416	1541423	0 %	50 %	25 %	25 %	119720493
32518	NC_008698	CT	3	6	1541430	1541435	0 %	50 %	0 %	50 %	119720493
32519	NC_008698	GAT	2	6	1541466	1541471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720493
32520	NC_008698	TGG	2	6	1541558	1541563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720493
32521	NC_008698	ATA	2	6	1541620	1541625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720493
32522	NC_008698	CTC	2	6	1541626	1541631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720493
32523	NC_008698	TTC	2	6	1541662	1541667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720493
32524	NC_008698	TCG	2	6	1541702	1541707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720493
32525	NC_008698	TCT	2	6	1541744	1541749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720493
32526	NC_008698	TCC	2	6	1541756	1541761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720493
32527	NC_008698	GTC	2	6	1541782	1541787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720493
32528	NC_008698	CTT	2	6	1541826	1541831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720493
32529	NC_008698	TCC	2	6	1541846	1541851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720493
32530	NC_008698	CA	3	6	1541874	1541879	50 %	0 %	0 %	50 %	119720493
32531	NC_008698	AAG	2	6	1541983	1541988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720493
32532	NC_008698	TAC	2	6	1541989	1541994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720493
32533	NC_008698	TCC	2	6	1542089	1542094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720494
32534	NC_008698	CCG	2	6	1542110	1542115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720494
32535	NC_008698	TCC	2	6	1542222	1542227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720494
32536	NC_008698	CAC	2	6	1542352	1542357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720494
32537	NC_008698	GTA	2	6	1542382	1542387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720494
32538	NC_008698	TGA	2	6	1542405	1542410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720494
32539	NC_008698	TCC	3	9	1542413	1542421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720494
32540	NC_008698	CTC	2	6	1542500	1542505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720494
32541	NC_008698	CTC	2	6	1542541	1542546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720494
32542	NC_008698	GTA	2	6	1542556	1542561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720494
32543	NC_008698	GCCGC	2	10	1542584	1542593	0 %	0 %	40 %	60 %	119720494
32544	NC_008698	TC	3	6	1542615	1542620	0 %	50 %	0 %	50 %	119720494
32545	NC_008698	CCA	2	6	1542621	1542626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720494
32546	NC_008698	G	6	6	1542632	1542637	0 %	0 %	100 %	0 %	119720494
32547	NC_008698	TCC	2	6	1542740	1542745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720494
32548	NC_008698	CT	3	6	1542780	1542785	0 %	50 %	0 %	50 %	119720494
32549	NC_008698	TTG	2	6	1542788	1542793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119720494
32550	NC_008698	TCC	2	6	1542801	1542806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720494
32551	NC_008698	GCTTCG	2	12	1542864	1542875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720494
32552	NC_008698	CTGGG	2	10	1542932	1542941	0 %	20 %	60 %	20 %	119720494
32553	NC_008698	CTCC	2	8	1542979	1542986	0 %	25 %	0 %	75 %	119720494
32554	NC_008698	CCTCG	2	10	1543009	1543018	0 %	20 %	20 %	60 %	119720494
32555	NC_008698	ACG	2	6	1543079	1543084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32556	NC_008698	TAA	2	6	1543086	1543091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32557	NC_008698	A	7	7	1543100	1543106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32558	NC_008698	ACT	3	9	1543121	1543129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32559	NC_008698	GGT	2	6	1543134	1543139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720495
32560	NC_008698	CCG	2	6	1543190	1543195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720495
32561	NC_008698	GGA	2	6	1543203	1543208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720495
32562	NC_008698	GAG	2	6	1543213	1543218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720495
32563	NC_008698	GTA	2	6	1543255	1543260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720495
32564	NC_008698	CGG	2	6	1543281	1543286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720495
32565	NC_008698	TTC	2	6	1543301	1543306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720495
32566	NC_008698	TGA	2	6	1543322	1543327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720495
32567	NC_008698	TC	3	6	1543330	1543335	0 %	50 %	0 %	50 %	119720495
32568	NC_008698	TTC	2	6	1543378	1543383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720495
32569	NC_008698	GAA	2	6	1543392	1543397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720495
32570	NC_008698	ACCT	2	8	1543456	1543463	25 %	25 %	0 %	50 %	119720495
32571	NC_008698	CCTCGA	2	12	1543491	1543502	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119720495
32572	NC_008698	GTCTGG	2	12	1543573	1543584	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119720495
32573	NC_008698	TAC	2	6	1543651	1543656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720495
32574	NC_008698	G	6	6	1543658	1543663	0 %	0 %	100 %	0 %	119720495
32575	NC_008698	GAG	2	6	1543678	1543683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720495
32576	NC_008698	GAA	2	6	1543893	1543898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720495
32577	NC_008698	CTC	2	6	1543921	1543926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720495
32578	NC_008698	TCC	2	6	1543930	1543935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720495
32579	NC_008698	GAC	2	6	1543945	1543950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720495
32580	NC_008698	ACC	2	6	1544071	1544076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720495
32581	NC_008698	A	6	6	1544137	1544142	100 %	0 %	0 %	0 %	119720495
32582	NC_008698	GTG	2	6	1544149	1544154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720495
32583	NC_008698	AG	4	8	1544235	1544242	50 %	0 %	50 %	0 %	119720495
32584	NC_008698	GAG	2	6	1544307	1544312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720495
32585	NC_008698	TATC	2	8	1544344	1544351	25 %	50 %	0 %	25 %	119720495
32586	NC_008698	CTT	2	6	1544352	1544357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720495
32587	NC_008698	GCG	2	6	1544379	1544384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720495
32588	NC_008698	A	6	6	1544405	1544410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32589	NC_008698	CG	4	8	1544421	1544428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32590	NC_008698	T	6	6	1544461	1544466	0 %	100 %	0 %	0 %	119720496
32591	NC_008698	CGTA	2	8	1544584	1544591	25 %	25 %	25 %	25 %	119720496
32592	NC_008698	AGG	2	6	1544667	1544672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720496
32593	NC_008698	ATC	2	6	1544694	1544699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720496
32594	NC_008698	CCG	2	6	1544785	1544790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720496
32595	NC_008698	CCA	2	6	1544821	1544826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720496
32596	NC_008698	TAT	2	6	1544894	1544899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119720496
32597	NC_008698	CCA	2	6	1544923	1544928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720496
32598	NC_008698	AGT	2	6	1545037	1545042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720496
32599	NC_008698	GCC	2	6	1545047	1545052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720496
32600	NC_008698	TCGCCC	2	12	1545058	1545069	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	119720496
32601	NC_008698	GAA	2	6	1545104	1545109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720496
32602	NC_008698	CG	3	6	1545156	1545161	0 %	0 %	50 %	50 %	119720496
32603	NC_008698	TCG	2	6	1545193	1545198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720496
32604	NC_008698	ACC	2	6	1545217	1545222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720497
32605	NC_008698	GCG	2	6	1545229	1545234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720497
32606	NC_008698	CTC	2	6	1545245	1545250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720497
32607	NC_008698	GCC	2	6	1545307	1545312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720497
32608	NC_008698	TTC	2	6	1545387	1545392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720497
32609	NC_008698	GCC	2	6	1545410	1545415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720497
32610	NC_008698	TAT	2	6	1545539	1545544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119720497
32611	NC_008698	GCT	2	6	1545580	1545585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720497
32612	NC_008698	CTT	2	6	1545635	1545640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720497
32613	NC_008698	CCT	3	9	1545755	1545763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720497
32614	NC_008698	C	6	6	1545768	1545773	0 %	0 %	0 %	100 %	119720497
32615	NC_008698	TTC	2	6	1545804	1545809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720497
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32617	NC_008698	GCCC	2	8	1545856	1545863	0 %	0 %	25 %	75 %	119720497
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