MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_008698	CAC	2	6	1519827	1519832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720473
32003	NC_008698	AGA	3	9	1519850	1519858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720473
32004	NC_008698	AAG	2	6	1519870	1519875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720473
32005	NC_008698	CGA	2	6	1519986	1519991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720473
32006	NC_008698	GAA	2	6	1520007	1520012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720473
32007	NC_008698	CTA	2	6	1520100	1520105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720473
32008	NC_008698	CTGC	2	8	1520188	1520195	0 %	25 %	25 %	50 %	119720473
32009	NC_008698	AAC	2	6	1520206	1520211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119720473
32010	NC_008698	GGC	2	6	1520221	1520226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720473
32011	NC_008698	CCGC	2	8	1520239	1520246	0 %	0 %	25 %	75 %	119720473
32012	NC_008698	CGA	2	6	1520250	1520255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720473
32013	NC_008698	GCC	2	6	1520284	1520289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720473
32014	NC_008698	AGGA	2	8	1520290	1520297	50 %	0 %	50 %	0 %	119720473
32015	NC_008698	TGG	2	6	1520314	1520319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720473
32016	NC_008698	AGT	2	6	1520342	1520347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720473
32017	NC_008698	T	6	6	1520355	1520360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32018	NC_008698	GAGG	2	8	1520498	1520505	25 %	0 %	75 %	0 %	119720474
32019	NC_008698	AGT	2	6	1520597	1520602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119720474
32020	NC_008698	GCG	3	9	1520625	1520633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720474
32021	NC_008698	GAG	2	6	1520675	1520680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720474
32022	NC_008698	ACG	2	6	1520730	1520735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720474
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32024	NC_008698	GGA	2	6	1520791	1520796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720474
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32026	NC_008698	GAGGG	2	10	1520870	1520879	20 %	0 %	80 %	0 %	119720474
32027	NC_008698	GC	3	6	1520943	1520948	0 %	0 %	50 %	50 %	119720474
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32032	NC_008698	CGA	2	6	1521171	1521176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720474
32033	NC_008698	GACA	2	8	1521274	1521281	50 %	0 %	25 %	25 %	119720474
32034	NC_008698	GACG	2	8	1521289	1521296	25 %	0 %	50 %	25 %	119720474
32035	NC_008698	GAG	2	6	1521356	1521361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720474
32036	NC_008698	CGA	2	6	1521364	1521369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720474
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32039	NC_008698	CGA	2	6	1521445	1521450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720474
32040	NC_008698	GCGG	2	8	1521470	1521477	0 %	0 %	75 %	25 %	119720474
32041	NC_008698	AGG	3	9	1521575	1521583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720474
32042	NC_008698	AGG	2	6	1521611	1521616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720474
32043	NC_008698	CAT	2	6	1521682	1521687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720474
32044	NC_008698	TTC	2	6	1521713	1521718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720474
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32046	NC_008698	ACG	2	6	1521777	1521782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720475
32047	NC_008698	ACC	2	6	1521790	1521795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119720475
32048	NC_008698	AGTACG	2	12	1521802	1521813	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119720475
32049	NC_008698	GAGG	2	8	1521827	1521834	25 %	0 %	75 %	0 %	119720475
32050	NC_008698	GAG	2	6	1521846	1521851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720475
32051	NC_008698	CAG	2	6	1521908	1521913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720475
32052	NC_008698	GAC	2	6	1521960	1521965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720475
32053	NC_008698	GCGCG	2	10	1521979	1521988	0 %	0 %	60 %	40 %	119720475
32054	NC_008698	GAG	2	6	1522008	1522013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720475
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32058	NC_008698	GAC	2	6	1522083	1522088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720475
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32064	NC_008698	TC	3	6	1522454	1522459	0 %	50 %	0 %	50 %	119720475
32065	NC_008698	GGA	2	6	1522463	1522468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720475
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32067	NC_008698	GGGA	2	8	1522548	1522555	25 %	0 %	75 %	0 %	119720475
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32082	NC_008698	ATA	2	6	1523133	1523138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720475
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32099	NC_008698	GAG	3	9	1524051	1524059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720476
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32102	NC_008698	CGG	2	6	1524191	1524196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720476
32103	NC_008698	CCG	2	6	1524232	1524237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720476
32104	NC_008698	CTC	2	6	1524247	1524252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720476
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32110	NC_008698	GGAGG	2	10	1524447	1524456	20 %	0 %	80 %	0 %	119720476
32111	NC_008698	AG	3	6	1524460	1524465	50 %	0 %	50 %	0 %	119720476
32112	NC_008698	GGA	2	6	1524471	1524476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720476
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32254	NC_008698	T	6	6	1529634	1529639	0 %	100 %	0 %	0 %	119720480
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32305	NC_008698	GCG	2	6	1532137	1532142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720482
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32330	NC_008698	GGA	2	6	1533078	1533083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720484
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32337	NC_008698	GCC	3	9	1533416	1533424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720484
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32340	NC_008698	TC	3	6	1533499	1533504	0 %	50 %	0 %	50 %	119720484
32341	NC_008698	TCG	2	6	1533590	1533595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720484
32342	NC_008698	C	6	6	1533714	1533719	0 %	0 %	0 %	100 %	119720484
32343	NC_008698	ACG	2	6	1533728	1533733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720484
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32347	NC_008698	CTC	2	6	1533859	1533864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720485
32348	NC_008698	ACG	2	6	1533874	1533879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720485
32349	NC_008698	CTC	3	9	1533900	1533908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720485
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32351	NC_008698	TCG	2	6	1533958	1533963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720485
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