MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_008698	CGA	2	6	1159021	1159026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720127
24002	NC_008698	GC	3	6	1159114	1159119	0 %	0 %	50 %	50 %	119720127
24003	NC_008698	CT	3	6	1159171	1159176	0 %	50 %	0 %	50 %	119720127
24004	NC_008698	TTC	2	6	1159349	1159354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24005	NC_008698	AAG	2	6	1159414	1159419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720128
24006	NC_008698	CCT	2	6	1159518	1159523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720128
24007	NC_008698	CT	3	6	1159643	1159648	0 %	50 %	0 %	50 %	119720128
24008	NC_008698	CTG	2	6	1159672	1159677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720128
24009	NC_008698	GTC	2	6	1159690	1159695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720128
24010	NC_008698	AGG	2	6	1159730	1159735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720128
24011	NC_008698	AGC	2	6	1159742	1159747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720128
24012	NC_008698	GAA	2	6	1159767	1159772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720128
24013	NC_008698	GAA	2	6	1159803	1159808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720128
24014	NC_008698	CGA	2	6	1159857	1159862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720128
24015	NC_008698	ACGA	2	8	1159954	1159961	50 %	0 %	25 %	25 %	119720128
24016	NC_008698	ATA	2	6	1159999	1160004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720128
24017	NC_008698	CG	3	6	1160020	1160025	0 %	0 %	50 %	50 %	119720128
24018	NC_008698	GAGC	2	8	1160037	1160044	25 %	0 %	50 %	25 %	119720128
24019	NC_008698	CGGC	2	8	1160060	1160067	0 %	0 %	50 %	50 %	119720128
24020	NC_008698	CTC	2	6	1160116	1160121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720128
24021	NC_008698	TGAC	2	8	1160153	1160160	25 %	25 %	25 %	25 %	119720128
24022	NC_008698	G	6	6	1160186	1160191	0 %	0 %	100 %	0 %	119720128
24023	NC_008698	GGC	2	6	1160199	1160204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720128
24024	NC_008698	TCC	2	6	1160227	1160232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720128
24025	NC_008698	CGA	2	6	1160274	1160279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720128
24026	NC_008698	TTC	2	6	1160284	1160289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720128
24027	NC_008698	GAGG	2	8	1160310	1160317	25 %	0 %	75 %	0 %	119720128
24028	NC_008698	GGA	2	6	1160388	1160393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720129
24029	NC_008698	GTG	2	6	1160483	1160488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720129
24030	NC_008698	ACT	2	6	1160502	1160507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720129
24031	NC_008698	ACG	2	6	1160571	1160576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720129
24032	NC_008698	GGA	2	6	1160581	1160586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720129
24033	NC_008698	GAG	2	6	1160591	1160596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720129
24034	NC_008698	CTG	2	6	1160612	1160617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720129
24035	NC_008698	GTG	3	9	1160708	1160716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720129
24036	NC_008698	CTC	2	6	1160720	1160725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720129
24037	NC_008698	CTA	2	6	1160750	1160755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720129
24038	NC_008698	GTG	2	6	1160810	1160815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720129
24039	NC_008698	TTC	2	6	1160849	1160854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720129
24040	NC_008698	ATA	2	6	1160873	1160878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119720129
24041	NC_008698	TCT	2	6	1160892	1160897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720129
24042	NC_008698	GTC	2	6	1160906	1160911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720129
24043	NC_008698	TAC	3	9	1160930	1160938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720129
24044	NC_008698	GCG	2	6	1160939	1160944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720129
24045	NC_008698	CTG	2	6	1160975	1160980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720129
24046	NC_008698	TCT	3	9	1160988	1160996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720129
24047	NC_008698	GAG	2	6	1160999	1161004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720129
24048	NC_008698	GTC	2	6	1161022	1161027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720129
24049	NC_008698	CGC	2	6	1161061	1161066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720129
24050	NC_008698	TCG	2	6	1161093	1161098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720129
24051	NC_008698	AGA	2	6	1161099	1161104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720129
24052	NC_008698	G	6	6	1161112	1161117	0 %	0 %	100 %	0 %	119720129
24053	NC_008698	CTGG	2	8	1161201	1161208	0 %	25 %	50 %	25 %	119720130
24054	NC_008698	CAA	2	6	1161261	1161266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119720130
24055	NC_008698	GA	3	6	1161360	1161365	50 %	0 %	50 %	0 %	119720130
24056	NC_008698	AGG	2	6	1161382	1161387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720130
24057	NC_008698	CCT	2	6	1161402	1161407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720130
24058	NC_008698	CTTC	2	8	1161485	1161492	0 %	50 %	0 %	50 %	119720130
24059	NC_008698	TCG	2	6	1161512	1161517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720130
24060	NC_008698	CTA	2	6	1161654	1161659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720130
24061	NC_008698	CTT	3	9	1161666	1161674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720130
24062	NC_008698	TCT	2	6	1161683	1161688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720130
24063	NC_008698	GGA	2	6	1161693	1161698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720130
24064	NC_008698	ACA	2	6	1161794	1161799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119720130
24065	NC_008698	CTC	2	6	1161832	1161837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720130
24066	NC_008698	GGT	2	6	1161948	1161953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24067	NC_008698	C	6	6	1162015	1162020	0 %	0 %	0 %	100 %	119720131
24068	NC_008698	GTCGAC	2	12	1162057	1162068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119720131
24069	NC_008698	TCGAG	2	10	1162070	1162079	20 %	20 %	40 %	20 %	119720131
24070	NC_008698	AG	3	6	1162128	1162133	50 %	0 %	50 %	0 %	119720131
24071	NC_008698	GCC	2	6	1162192	1162197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720131
24072	NC_008698	ACG	2	6	1162205	1162210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720131
24073	NC_008698	GCGG	2	8	1162246	1162253	0 %	0 %	75 %	25 %	119720131
24074	NC_008698	GTC	3	9	1162450	1162458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720131
24075	NC_008698	TGG	2	6	1162472	1162477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720131
24076	NC_008698	GAG	2	6	1162483	1162488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720131
24077	NC_008698	ACCT	2	8	1162537	1162544	25 %	25 %	0 %	50 %	119720131
24078	NC_008698	GGT	2	6	1162572	1162577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720131
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24081	NC_008698	CGT	2	6	1162611	1162616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720131
24082	NC_008698	GAGG	2	8	1162626	1162633	25 %	0 %	75 %	0 %	119720131
24083	NC_008698	GAG	2	6	1162644	1162649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720131
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24086	NC_008698	TACCCC	2	12	1162705	1162716	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	119720131
24087	NC_008698	CGA	2	6	1162737	1162742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720131
24088	NC_008698	TCG	2	6	1162745	1162750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720131
24089	NC_008698	GGGA	2	8	1162752	1162759	25 %	0 %	75 %	0 %	119720131
24090	NC_008698	ACG	2	6	1162802	1162807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720131
24091	NC_008698	GAGC	2	8	1162830	1162837	25 %	0 %	50 %	25 %	119720131
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24098	NC_008698	G	6	6	1163159	1163164	0 %	0 %	100 %	0 %	119720131
24099	NC_008698	AAG	2	6	1163167	1163172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720131
24100	NC_008698	TCGAG	2	10	1163177	1163186	20 %	20 %	40 %	20 %	119720131
24101	NC_008698	GAGG	2	8	1163187	1163194	25 %	0 %	75 %	0 %	119720131
24102	NC_008698	GAC	2	6	1163209	1163214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720131
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24104	NC_008698	TTC	2	6	1163260	1163265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720131
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24106	NC_008698	GAC	2	6	1163368	1163373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720131
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24112	NC_008698	CTA	2	6	1163566	1163571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720131
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24115	NC_008698	GGC	2	6	1163745	1163750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720131
24116	NC_008698	AGG	2	6	1163800	1163805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720131
24117	NC_008698	CTA	2	6	1163889	1163894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720131
24118	NC_008698	GCC	2	6	1163908	1163913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720131
24119	NC_008698	AGG	2	6	1163960	1163965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720131
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24121	NC_008698	CGA	2	6	1164036	1164041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720131
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24123	NC_008698	AGG	2	6	1164094	1164099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720131
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24132	NC_008698	GAGC	2	8	1164396	1164403	25 %	0 %	50 %	25 %	119720131
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24135	NC_008698	TTA	2	6	1164443	1164448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24136	NC_008698	GGC	2	6	1164456	1164461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24137	NC_008698	GGT	2	6	1164534	1164539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119720132
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24139	NC_008698	TCT	2	6	1164566	1164571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119720132
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24142	NC_008698	CCT	3	9	1164673	1164681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720132
24143	NC_008698	AGG	2	6	1164713	1164718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720132
24144	NC_008698	CGA	2	6	1164836	1164841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24145	NC_008698	CGAG	2	8	1164940	1164947	25 %	0 %	50 %	25 %	119720133
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24152	NC_008698	GAG	2	6	1165353	1165358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720133
24153	NC_008698	GAC	2	6	1165410	1165415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720133
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24192	NC_008698	CCT	2	6	1167341	1167346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720134
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24212	NC_008698	CCA	2	6	1168018	1168023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24213	NC_008698	AAGAA	2	10	1168056	1168065	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24214	NC_008698	TA	3	6	1168071	1168076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24215	NC_008698	TTCC	2	8	1168079	1168086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24216	NC_008698	TA	3	6	1168106	1168111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24217	NC_008698	AGG	2	6	1168145	1168150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720136
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24222	NC_008698	AG	3	6	1168320	1168325	50 %	0 %	50 %	0 %	119720136
24223	NC_008698	CTA	2	6	1168377	1168382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119720136
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24230	NC_008698	GAG	2	6	1168584	1168589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720136
24231	NC_008698	GGCT	2	8	1168591	1168598	0 %	25 %	50 %	25 %	119720136
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24233	NC_008698	TCC	2	6	1168798	1168803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720137
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24350	NC_008698	CCT	2	6	1173994	1173999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119720143
24351	NC_008698	GAG	2	6	1174006	1174011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119720143
24352	NC_008698	GGC	2	6	1174153	1174158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119720143
24353	NC_008698	GA	3	6	1174199	1174204	50 %	0 %	50 %	0 %	119720143
24354	NC_008698	GCT	2	6	1174244	1174249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720144
24355	NC_008698	CGC	2	6	1174419	1174424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119720144
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24362	NC_008698	TCG	2	6	1174804	1174809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119720144
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24464	NC_008698	CCGC	2	8	1178928	1178935	0 %	0 %	25 %	75 %	119720150
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24468	NC_008698	AGA	2	6	1178997	1179002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119720150
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24498	NC_008698	GC	3	6	1180236	1180241	0 %	0 %	50 %	50 %	119720151
24499	NC_008698	CAG	2	6	1180242	1180247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119720151
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