MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008698	CATA	2	8	549958	549965	50 %	25 %	0 %	25 %	119719507
11002	NC_008698	ACG	2	6	549990	549995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719507
11003	NC_008698	AGT	2	6	550024	550029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719507
11004	NC_008698	A	7	7	550047	550053	100 %	0 %	0 %	0 %	119719507
11005	NC_008698	GCAG	2	8	550114	550121	25 %	0 %	50 %	25 %	119719508
11006	NC_008698	GTT	2	6	550178	550183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119719508
11007	NC_008698	GAA	2	6	550340	550345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719508
11008	NC_008698	GAA	2	6	550391	550396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719508
11009	NC_008698	TA	3	6	550421	550426	50 %	50 %	0 %	0 %	119719508
11010	NC_008698	GAT	2	6	550530	550535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719508
11011	NC_008698	GTA	2	6	550594	550599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719509
11012	NC_008698	CT	3	6	550661	550666	0 %	50 %	0 %	50 %	119719509
11013	NC_008698	GGGT	2	8	550682	550689	0 %	25 %	75 %	0 %	119719509
11014	NC_008698	CTAGAC	2	12	550693	550704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	119719509
11015	NC_008698	TGA	2	6	550802	550807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719509
11016	NC_008698	TTCT	2	8	550816	550823	0 %	75 %	0 %	25 %	119719509
11017	NC_008698	CCTCCC	2	12	550830	550841	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	119719509
11018	NC_008698	GCG	2	6	550850	550855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719509
11019	NC_008698	G	6	6	550898	550903	0 %	0 %	100 %	0 %	119719509
11020	NC_008698	GTG	2	6	550918	550923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719509
11021	NC_008698	GCC	2	6	550929	550934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719509
11022	NC_008698	GAGAC	2	10	550943	550952	40 %	0 %	40 %	20 %	119719509
11023	NC_008698	CA	3	6	550985	550990	50 %	0 %	0 %	50 %	119719509
11024	NC_008698	CGT	2	6	551031	551036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719509
11025	NC_008698	AGA	2	6	551061	551066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719509
11026	NC_008698	GTGG	2	8	551077	551084	0 %	25 %	75 %	0 %	119719509
11027	NC_008698	GAG	2	6	551116	551121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719509
11028	NC_008698	GGA	2	6	551139	551144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719509
11029	NC_008698	ATC	2	6	551155	551160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719509
11030	NC_008698	GCTG	2	8	551223	551230	0 %	25 %	50 %	25 %	119719509
11031	NC_008698	CTT	2	6	551235	551240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719509
11032	NC_008698	TC	3	6	551256	551261	0 %	50 %	0 %	50 %	119719509
11033	NC_008698	CG	3	6	551271	551276	0 %	0 %	50 %	50 %	119719509
11034	NC_008698	AG	3	6	551279	551284	50 %	0 %	50 %	0 %	119719509
11035	NC_008698	CGG	2	6	551295	551300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719510
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11039	NC_008698	CT	3	6	551393	551398	0 %	50 %	0 %	50 %	119719510
11040	NC_008698	CGT	2	6	551491	551496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719510
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11044	NC_008698	CGA	2	6	551944	551949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719510
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11049	NC_008698	ATT	2	6	552336	552341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_008698	AGG	2	6	552367	552372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_008698	AAAG	2	8	552429	552436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_008698	ACT	2	6	552463	552468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719511
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11054	NC_008698	CAT	2	6	552598	552603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719511
11055	NC_008698	GGA	2	6	552630	552635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719511
11056	NC_008698	GGGA	2	8	552647	552654	25 %	0 %	75 %	0 %	119719511
11057	NC_008698	CG	3	6	552697	552702	0 %	0 %	50 %	50 %	119719511
11058	NC_008698	GGA	3	9	552778	552786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719511
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11061	NC_008698	TGA	2	6	552951	552956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719511
11062	NC_008698	CGA	2	6	552979	552984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719511
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11064	NC_008698	CTG	2	6	553199	553204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719511
11065	NC_008698	AGT	2	6	553268	553273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719512
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11072	NC_008698	CTTC	2	8	553577	553584	0 %	50 %	0 %	50 %	119719512
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11245	NC_008698	AGA	2	6	562284	562289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719520
11246	NC_008698	GAA	2	6	562301	562306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719520
11247	NC_008698	CGT	2	6	562318	562323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719520
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11249	NC_008698	CGT	2	6	562510	562515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719521
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11261	NC_008698	GC	4	8	563079	563086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11262	NC_008698	GGT	2	6	563105	563110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11263	NC_008698	TC	3	6	563151	563156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11264	NC_008698	ACG	2	6	563173	563178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11266	NC_008698	GCGAAG	2	12	563207	563218	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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11268	NC_008698	CTC	2	6	563320	563325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11269	NC_008698	CTA	2	6	563369	563374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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