MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008698	AGGCCT	2	12	329208	329219	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119719277
6502	NC_008698	GGA	2	6	329263	329268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719277
6503	NC_008698	CT	3	6	329291	329296	0 %	50 %	0 %	50 %	119719277
6504	NC_008698	GCC	2	6	329302	329307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719277
6505	NC_008698	TCG	2	6	329335	329340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719277
6506	NC_008698	CCT	3	9	329399	329407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719277
6507	NC_008698	GGC	2	6	329498	329503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719277
6508	NC_008698	TC	3	6	329518	329523	0 %	50 %	0 %	50 %	119719277
6509	NC_008698	AAG	2	6	329526	329531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719277
6510	NC_008698	GTC	2	6	329652	329657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719277
6511	NC_008698	CTC	2	6	329671	329676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719277
6512	NC_008698	CAG	2	6	329697	329702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719277
6513	NC_008698	GTACT	2	10	329754	329763	20 %	40 %	20 %	20 %	119719277
6514	NC_008698	CTC	2	6	329783	329788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719277
6515	NC_008698	CCTG	2	8	329810	329817	0 %	25 %	25 %	50 %	119719277
6516	NC_008698	CCT	2	6	329891	329896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719277
6517	NC_008698	TCC	2	6	330010	330015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719277
6518	NC_008698	GCC	2	6	330066	330071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719277
6519	NC_008698	CCA	2	6	330167	330172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719277
6520	NC_008698	CCA	2	6	330242	330247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719277
6521	NC_008698	AGA	2	6	330410	330415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719277
6522	NC_008698	CTT	2	6	330417	330422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719277
6523	NC_008698	ACC	2	6	330481	330486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719278
6524	NC_008698	CGG	2	6	330634	330639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719278
6525	NC_008698	AAC	2	6	330641	330646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719278
6526	NC_008698	CCT	2	6	330749	330754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719278
6527	NC_008698	AG	3	6	330947	330952	50 %	0 %	50 %	0 %	119719278
6528	NC_008698	CTG	2	6	331023	331028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719278
6529	NC_008698	GC	3	6	331044	331049	0 %	0 %	50 %	50 %	119719278
6530	NC_008698	AGTAT	2	10	331065	331074	40 %	40 %	20 %	0 %	119719278
6531	NC_008698	AGA	2	6	331184	331189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719278
6532	NC_008698	AGT	2	6	331258	331263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719278
6533	NC_008698	TCCGT	2	10	331272	331281	0 %	40 %	20 %	40 %	119719278
6534	NC_008698	CGA	2	6	331285	331290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719278
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6537	NC_008698	ATC	2	6	331434	331439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719278
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6539	NC_008698	CG	3	6	331495	331500	0 %	0 %	50 %	50 %	119719278
6540	NC_008698	TCC	2	6	331557	331562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719278
6541	NC_008698	CTC	3	9	331571	331579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719278
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6544	NC_008698	CGC	2	6	331778	331783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719278
6545	NC_008698	GAG	2	6	331796	331801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719278
6546	NC_008698	TAAA	2	8	331861	331868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_008698	GGA	2	6	331880	331885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_008698	TTCT	2	8	331897	331904	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6549	NC_008698	T	6	6	331908	331913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_008698	GC	3	6	331928	331933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_008698	CG	3	6	331962	331967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6552	NC_008698	CT	3	6	331992	331997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6553	NC_008698	AAG	2	6	332086	332091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719279
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6558	NC_008698	GAA	2	6	332369	332374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719280
6559	NC_008698	CGGT	2	8	332415	332422	0 %	25 %	50 %	25 %	119719280
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6563	NC_008698	CTA	2	6	332578	332583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719281
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6565	NC_008698	GAG	2	6	332741	332746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719281
6566	NC_008698	CCCCT	2	10	332762	332771	0 %	20 %	0 %	80 %	119719281
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6571	NC_008698	CTC	2	6	332979	332984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719282
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6581	NC_008698	CATT	2	8	333587	333594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6593	NC_008698	CTGGG	2	10	334315	334324	0 %	20 %	60 %	20 %	119719284
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6608	NC_008698	AGA	2	6	335481	335486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719285
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