MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_008698	CGT	2	6	302418	302423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719251
6003	NC_008698	GAA	2	6	302461	302466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719251
6004	NC_008698	GGA	2	6	302524	302529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719251
6005	NC_008698	AAGA	2	8	302572	302579	75 %	0 %	25 %	0 %	119719251
6006	NC_008698	CTA	2	6	302611	302616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719251
6007	NC_008698	GGA	2	6	302688	302693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719251
6008	NC_008698	CTC	2	6	302731	302736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719251
6009	NC_008698	AGG	2	6	302759	302764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719251
6010	NC_008698	TAC	2	6	302815	302820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719251
6011	NC_008698	GAA	2	6	302854	302859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719251
6012	NC_008698	AGA	2	6	302860	302865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719251
6013	NC_008698	TAG	2	6	302908	302913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719252
6014	NC_008698	T	6	6	302937	302942	0 %	100 %	0 %	0 %	119719252
6015	NC_008698	GTA	2	6	302970	302975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719252
6016	NC_008698	GGT	2	6	303042	303047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719252
6017	NC_008698	TCG	2	6	303077	303082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719252
6018	NC_008698	TAC	2	6	303099	303104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719252
6019	NC_008698	TCGGG	2	10	303149	303158	0 %	20 %	60 %	20 %	119719252
6020	NC_008698	CAT	2	6	303180	303185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719252
6021	NC_008698	CGC	2	6	303188	303193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719252
6022	NC_008698	CTG	2	6	303204	303209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719252
6023	NC_008698	GTA	2	6	303255	303260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719252
6024	NC_008698	CTC	2	6	303330	303335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719252
6025	NC_008698	CTC	2	6	303423	303428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719252
6026	NC_008698	CT	5	10	303440	303449	0 %	50 %	0 %	50 %	119719252
6027	NC_008698	TCT	3	9	303464	303472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719252
6028	NC_008698	CGC	2	6	303503	303508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719252
6029	NC_008698	CGG	2	6	303545	303550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719252
6030	NC_008698	GTG	2	6	303585	303590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719252
6031	NC_008698	TAGG	2	8	303603	303610	25 %	25 %	50 %	0 %	119719252
6032	NC_008698	GCC	2	6	303634	303639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719252
6033	NC_008698	TCC	2	6	303659	303664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719252
6034	NC_008698	TTC	2	6	303688	303693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719252
6035	NC_008698	GAC	2	6	303771	303776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719252
6036	NC_008698	CTG	2	6	303823	303828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719252
6037	NC_008698	TC	3	6	303830	303835	0 %	50 %	0 %	50 %	119719252
6038	NC_008698	TCC	2	6	303862	303867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719252
6039	NC_008698	GCA	2	6	303954	303959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719252
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6041	NC_008698	CAG	2	6	303999	304004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719252
6042	NC_008698	CCTT	2	8	304016	304023	0 %	50 %	0 %	50 %	119719252
6043	NC_008698	TTC	2	6	304084	304089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719252
6044	NC_008698	TGG	2	6	304100	304105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719252
6045	NC_008698	CTT	2	6	304215	304220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719252
6046	NC_008698	GAA	3	9	304455	304463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719252
6047	NC_008698	TGC	2	6	304807	304812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719252
6048	NC_008698	CG	3	6	304852	304857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_008698	AT	3	6	304968	304973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_008698	TAA	3	9	305059	305067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_008698	CTT	2	6	305127	305132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719253
6052	NC_008698	AGT	3	9	305145	305153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719253
6053	NC_008698	GAA	2	6	305170	305175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719253
6054	NC_008698	GAA	2	6	305220	305225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719253
6055	NC_008698	CCG	2	6	305348	305353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719253
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6057	NC_008698	GA	4	8	305452	305459	50 %	0 %	50 %	0 %	119719253
6058	NC_008698	GTG	2	6	305534	305539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719253
6059	NC_008698	GGAAG	2	10	305581	305590	40 %	0 %	60 %	0 %	119719253
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6061	NC_008698	CTC	2	6	305788	305793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719253
6062	NC_008698	AG	3	6	305818	305823	50 %	0 %	50 %	0 %	119719253
6063	NC_008698	GAA	2	6	305853	305858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719253
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6065	NC_008698	CA	3	6	305917	305922	50 %	0 %	0 %	50 %	119719253
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6069	NC_008698	ACC	2	6	306036	306041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119719253
6070	NC_008698	ACGG	2	8	306070	306077	25 %	0 %	50 %	25 %	119719253
6071	NC_008698	GA	3	6	306156	306161	50 %	0 %	50 %	0 %	119719253
6072	NC_008698	GAG	2	6	306166	306171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719253
6073	NC_008698	AG	4	8	306175	306182	50 %	0 %	50 %	0 %	119719253
6074	NC_008698	CGAG	2	8	306242	306249	25 %	0 %	50 %	25 %	119719253
6075	NC_008698	TCG	2	6	306254	306259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719253
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6080	NC_008698	GC	3	6	306509	306514	0 %	0 %	50 %	50 %	119719253
6081	NC_008698	TCT	2	6	306538	306543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719253
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6088	NC_008698	GGA	2	6	306874	306879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719254
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6090	NC_008698	TC	3	6	306925	306930	0 %	50 %	0 %	50 %	119719254
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6093	NC_008698	TTC	2	6	307247	307252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719254
6094	NC_008698	GAG	2	6	307273	307278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719254
6095	NC_008698	GAGGAA	2	12	307283	307294	50 %	0 %	50 %	0 %	119719254
6096	NC_008698	AGGA	2	8	307304	307311	50 %	0 %	50 %	0 %	119719254
6097	NC_008698	ATA	2	6	307313	307318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719254
6098	NC_008698	A	6	6	307446	307451	100 %	0 %	0 %	0 %	119719254
6099	NC_008698	GAAAA	2	10	307499	307508	80 %	0 %	20 %	0 %	119719254
6100	NC_008698	TTGC	2	8	307511	307518	0 %	50 %	25 %	25 %	119719254
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6103	NC_008698	GGC	3	9	307633	307641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719254
6104	NC_008698	ACT	2	6	307690	307695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719254
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6107	NC_008698	GGA	2	6	307762	307767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719254
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6109	NC_008698	CAAG	2	8	307932	307939	50 %	0 %	25 %	25 %	119719254
6110	NC_008698	GAA	2	6	307946	307951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719254
6111	NC_008698	TCT	2	6	307977	307982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719254
6112	NC_008698	GAA	2	6	307987	307992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719254
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6117	NC_008698	GAG	2	6	308113	308118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719254
6118	NC_008698	G	6	6	308118	308123	0 %	0 %	100 %	0 %	119719254
6119	NC_008698	CGA	2	6	308188	308193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719254
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6121	NC_008698	GAA	2	6	308222	308227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719254
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6499	NC_008698	TCT	2	6	329105	329110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719277
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