MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 chromosome

Total Repeats: 37539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008698	GCC	2	6	253754	253759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719204
5002	NC_008698	TTC	2	6	253789	253794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719204
5003	NC_008698	TCT	2	6	253802	253807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719204
5004	NC_008698	ACT	2	6	253816	253821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719204
5005	NC_008698	GCCT	2	8	253826	253833	0 %	25 %	25 %	50 %	119719204
5006	NC_008698	CAG	2	6	253836	253841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719204
5007	NC_008698	CGTC	2	8	253859	253866	0 %	25 %	25 %	50 %	119719204
5008	NC_008698	GA	3	6	253873	253878	50 %	0 %	50 %	0 %	119719204
5009	NC_008698	GCG	2	6	254006	254011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719204
5010	NC_008698	CTC	2	6	254020	254025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719204
5011	NC_008698	GCC	2	6	254085	254090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719204
5012	NC_008698	ATC	2	6	254301	254306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719204
5013	NC_008698	GAA	2	6	254361	254366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719204
5014	NC_008698	AGC	2	6	254382	254387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719204
5015	NC_008698	CAA	2	6	254409	254414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719204
5016	NC_008698	CT	3	6	254440	254445	0 %	50 %	0 %	50 %	119719204
5017	NC_008698	CCT	2	6	254501	254506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719204
5018	NC_008698	GCG	2	6	254515	254520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719204
5019	NC_008698	CTG	2	6	254556	254561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719204
5020	NC_008698	GC	4	8	254618	254625	0 %	0 %	50 %	50 %	119719204
5021	NC_008698	ACT	3	9	254632	254640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719204
5022	NC_008698	AGG	2	6	254666	254671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719204
5023	NC_008698	ATC	2	6	254677	254682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719204
5024	NC_008698	TC	3	6	254694	254699	0 %	50 %	0 %	50 %	119719204
5025	NC_008698	GCG	2	6	254708	254713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719204
5026	NC_008698	GCC	2	6	254772	254777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719204
5027	NC_008698	TCC	2	6	254809	254814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719204
5028	NC_008698	CT	3	6	254828	254833	0 %	50 %	0 %	50 %	119719204
5029	NC_008698	CTT	2	6	254928	254933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719204
5030	NC_008698	TCCG	2	8	254974	254981	0 %	25 %	25 %	50 %	119719204
5031	NC_008698	CTC	2	6	254985	254990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719204
5032	NC_008698	CCG	2	6	255166	255171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119719204
5033	NC_008698	TCC	2	6	255283	255288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719204
5034	NC_008698	GC	3	6	255310	255315	0 %	0 %	50 %	50 %	119719204
5035	NC_008698	GTCG	2	8	255428	255435	0 %	25 %	50 %	25 %	119719205
5036	NC_008698	CTT	2	6	255458	255463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719205
5037	NC_008698	CCT	2	6	255493	255498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719205
5038	NC_008698	AG	3	6	255503	255508	50 %	0 %	50 %	0 %	119719205
5039	NC_008698	ATA	2	6	255561	255566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719205
5040	NC_008698	ACT	2	6	255664	255669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_008698	AG	3	6	255717	255722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_008698	GAA	2	6	255773	255778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719206
5043	NC_008698	CGA	2	6	255799	255804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719206
5044	NC_008698	GGA	2	6	255849	255854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719206
5045	NC_008698	CGG	2	6	255859	255864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719206
5046	NC_008698	TGG	2	6	255929	255934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719206
5047	NC_008698	ATA	2	6	255983	255988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119719206
5048	NC_008698	ACCC	2	8	255989	255996	25 %	0 %	0 %	75 %	119719206
5049	NC_008698	ACA	2	6	256155	256160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119719206
5050	NC_008698	ACGT	2	8	256161	256168	25 %	25 %	25 %	25 %	119719206
5051	NC_008698	CCTT	2	8	256330	256337	0 %	50 %	0 %	50 %	119719206
5052	NC_008698	GAG	2	6	256484	256489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719206
5053	NC_008698	GAG	2	6	256514	256519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719206
5054	NC_008698	GA	3	6	256523	256528	50 %	0 %	50 %	0 %	119719206
5055	NC_008698	CTT	2	6	256729	256734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719206
5056	NC_008698	GAGG	2	8	256924	256931	25 %	0 %	75 %	0 %	119719206
5057	NC_008698	AGG	2	6	256934	256939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719206
5058	NC_008698	GAA	2	6	257047	257052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119719206
5059	NC_008698	TAC	2	6	257066	257071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719206
5060	NC_008698	GCG	2	6	257092	257097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719206
5061	NC_008698	TGG	2	6	257293	257298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_008698	CCG	2	6	257301	257306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_008698	CCG	2	6	257326	257331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5064	NC_008698	CTC	2	6	257351	257356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_008698	GAC	2	6	257406	257411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_008698	TAA	2	6	257447	257452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_008698	ACAA	2	8	257481	257488	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_008698	ATT	2	6	257493	257498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_008698	GCCG	2	8	257504	257511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_008698	CCG	2	6	257606	257611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_008698	A	6	6	257635	257640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_008698	TTC	2	6	257664	257669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_008698	GGC	2	6	257678	257683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_008698	TCA	2	6	257691	257696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_008698	A	6	6	257714	257719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_008698	CCGG	2	8	257758	257765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_008698	AAAT	2	8	257882	257889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_008698	GC	3	6	257907	257912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5079	NC_008698	CTA	2	6	257943	257948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_008698	GAG	2	6	258049	258054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119719207
5081	NC_008698	AG	4	8	258053	258060	50 %	0 %	50 %	0 %	119719207
5082	NC_008698	ATG	2	6	258142	258147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719207
5083	NC_008698	GGCT	2	8	258152	258159	0 %	25 %	50 %	25 %	119719207
5084	NC_008698	CTT	2	6	258246	258251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719207
5085	NC_008698	GCG	2	6	258266	258271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719207
5086	NC_008698	GA	3	6	258288	258293	50 %	0 %	50 %	0 %	119719207
5087	NC_008698	CTTCC	2	10	258357	258366	0 %	40 %	0 %	60 %	119719208
5088	NC_008698	CTAGCT	2	12	258401	258412	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119719208
5089	NC_008698	AG	3	6	258438	258443	50 %	0 %	50 %	0 %	119719208
5090	NC_008698	CTC	2	6	258444	258449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719208
5091	NC_008698	TAT	2	6	258504	258509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119719208
5092	NC_008698	AAGA	2	8	258612	258619	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_008698	AAAT	2	8	258623	258630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_008698	T	7	7	258640	258646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_008698	TCCTTC	2	12	258675	258686	0 %	50 %	0 %	50 %	119719209
5096	NC_008698	TCT	2	6	258700	258705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719209
5097	NC_008698	CGG	2	6	258716	258721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119719209
5098	NC_008698	AGC	2	6	258725	258730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719209
5099	NC_008698	TCG	2	6	258738	258743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719209
5100	NC_008698	GCCT	2	8	258818	258825	0 %	25 %	25 %	50 %	119719209
5101	NC_008698	AGCT	2	8	258989	258996	25 %	25 %	25 %	25 %	119719209
5102	NC_008698	CTG	2	6	259002	259007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719209
5103	NC_008698	CTC	2	6	259060	259065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719209
5104	NC_008698	CT	3	6	259085	259090	0 %	50 %	0 %	50 %	119719209
5105	NC_008698	ACG	2	6	259104	259109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719209
5106	NC_008698	CGT	2	6	259117	259122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719209
5107	NC_008698	TCG	2	6	259140	259145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719209
5108	NC_008698	CTC	2	6	259162	259167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719209
5109	NC_008698	TTGGGG	2	12	259188	259199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119719209
5110	NC_008698	CGA	2	6	259207	259212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119719209
5111	NC_008698	TCT	2	6	259219	259224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719209
5112	NC_008698	TCCTC	2	10	259237	259246	0 %	40 %	0 %	60 %	119719209
5113	NC_008698	TCC	2	6	259284	259289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719209
5114	NC_008698	CTT	2	6	259343	259348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719209
5115	NC_008698	AGT	2	6	259384	259389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119719209
5116	NC_008698	CAT	2	6	259399	259404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119719209
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5119	NC_008698	TCT	2	6	259450	259455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719209
5120	NC_008698	CTT	2	6	259460	259465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119719209
5121	NC_008698	CCT	2	6	259480	259485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719209
5122	NC_008698	GCT	2	6	259504	259509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119719209
5123	NC_008698	TCTCTA	2	12	259549	259560	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	119719209
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5125	NC_008698	CCT	2	6	259624	259629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119719209
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5493	NC_008698	ATA	2	6	278130	278135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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