MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermofilum pendens Hrk 5 plasmid pTPEN01

Total Repeats: 693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008696	CAC	2	6	146	151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709758
2	NC_008696	CGC	2	6	254	259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119709758
3	NC_008696	TAT	2	6	260	265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119709758
4	NC_008696	GAC	2	6	275	280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709758
5	NC_008696	CGG	2	6	283	288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709758
6	NC_008696	CCAG	2	8	295	302	25 %	0 %	25 %	50 %	119709758
7	NC_008696	ACC	2	6	342	347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709758
8	NC_008696	CAG	2	6	407	412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709758
9	NC_008696	GGA	2	6	451	456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119709758
10	NC_008696	GCC	2	6	491	496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119709758
11	NC_008696	CAG	2	6	542	547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709758
12	NC_008696	CCA	2	6	604	609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709758
13	NC_008696	CGG	2	6	649	654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709758
14	NC_008696	ACG	2	6	678	683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709758
15	NC_008696	C	6	6	696	701	0 %	0 %	0 %	100 %	119709758
16	NC_008696	TAGC	2	8	792	799	25 %	25 %	25 %	25 %	119709758
17	NC_008696	CAG	2	6	806	811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709758
18	NC_008696	CGA	2	6	826	831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709758
19	NC_008696	TCC	2	6	843	848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709758
20	NC_008696	GCCC	3	12	862	873	0 %	0 %	25 %	75 %	119709758
21	NC_008696	GCC	2	6	936	941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119709758
22	NC_008696	AGT	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119709758
23	NC_008696	CCT	2	6	1057	1062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709758
24	NC_008696	CGG	2	6	1087	1092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709758
25	NC_008696	CGG	3	9	1165	1173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709758
26	NC_008696	CCT	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709758
27	NC_008696	TCC	2	6	1341	1346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709758
28	NC_008696	GC	3	6	1398	1403	0 %	0 %	50 %	50 %	119709758
29	NC_008696	TCA	2	6	1408	1413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119709758
30	NC_008696	TC	3	6	1460	1465	0 %	50 %	0 %	50 %	119709758
31	NC_008696	CTC	2	6	1469	1474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709758
32	NC_008696	CCT	3	9	1489	1497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709758
33	NC_008696	CTC	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709758
34	NC_008696	TCCACC	2	12	1518	1529	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	119709758
35	NC_008696	CCT	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709758
36	NC_008696	CCT	2	6	1594	1599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709758
37	NC_008696	CTC	3	9	1628	1636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709758
38	NC_008696	CTT	2	6	1694	1699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709758
39	NC_008696	CTC	2	6	1703	1708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709758
40	NC_008696	AAG	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008696	TA	3	6	1738	1743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008696	G	6	6	1753	1758	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008696	A	7	7	1763	1769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008696	CGG	2	6	1843	1848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709759
45	NC_008696	GAT	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119709759
46	NC_008696	CCT	2	6	1904	1909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709759
47	NC_008696	CAT	2	6	1940	1945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119709759
48	NC_008696	CCA	2	6	2076	2081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709760
49	NC_008696	ACC	2	6	2240	2245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709760
50	NC_008696	GAA	2	6	2269	2274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119709760
51	NC_008696	CTG	2	6	2342	2347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119709760
52	NC_008696	GTG	2	6	2372	2377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119709760
53	NC_008696	GTA	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119709760
54	NC_008696	GGC	2	6	2431	2436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709760
55	NC_008696	TCC	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709760
56	NC_008696	ACG	2	6	2462	2467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709760
57	NC_008696	AAC	2	6	2468	2473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119709760
58	NC_008696	ATG	2	6	2474	2479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119709760
59	NC_008696	GCCC	2	8	2502	2509	0 %	0 %	25 %	75 %	119709760
60	NC_008696	GAC	2	6	2617	2622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709760
61	NC_008696	GGC	2	6	2629	2634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709760
62	NC_008696	GCC	2	6	2638	2643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119709760
63	NC_008696	G	6	6	2671	2676	0 %	0 %	100 %	0 %	119709760
64	NC_008696	AAG	2	6	2696	2701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119709760
65	NC_008696	GAC	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709760
66	NC_008696	GTT	2	6	2809	2814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119709760
67	NC_008696	C	6	6	2826	2831	0 %	0 %	0 %	100 %	119709760
68	NC_008696	GCC	2	6	2881	2886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119709760
69	NC_008696	CAG	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709760
70	NC_008696	CTCA	2	8	3011	3018	25 %	25 %	0 %	50 %	119709760
71	NC_008696	CAC	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709761
72	NC_008696	CTT	2	6	3045	3050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709761
73	NC_008696	CGG	2	6	3167	3172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709761
74	NC_008696	CCA	2	6	3200	3205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709761
75	NC_008696	TGA	3	9	3212	3220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119709761
76	NC_008696	GGA	2	6	3278	3283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119709761
77	NC_008696	TA	3	6	3322	3327	50 %	50 %	0 %	0 %	119709761
78	NC_008696	GCG	2	6	3424	3429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709761
79	NC_008696	TGCC	2	8	3449	3456	0 %	25 %	25 %	50 %	119709761
80	NC_008696	GAC	2	6	3468	3473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709761
81	NC_008696	GTG	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119709761
82	NC_008696	CAC	2	6	3576	3581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008696	CTCC	2	8	3644	3651	0 %	25 %	0 %	75 %	119709762
84	NC_008696	CCA	2	6	3713	3718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709762
85	NC_008696	CTTT	2	8	3788	3795	0 %	75 %	0 %	25 %	119709762
86	NC_008696	AC	3	6	3827	3832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008696	CTC	2	6	3862	3867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709763
88	NC_008696	CCT	2	6	3879	3884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709763
89	NC_008696	CTCC	2	8	3900	3907	0 %	25 %	0 %	75 %	119709763
90	NC_008696	GCC	2	6	3922	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119709763
91	NC_008696	CTC	2	6	3963	3968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709763
92	NC_008696	CTCGC	2	10	3982	3991	0 %	20 %	20 %	60 %	119709763
93	NC_008696	GA	3	6	4076	4081	50 %	0 %	50 %	0 %	119709763
94	NC_008696	CTT	2	6	4125	4130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709763
95	NC_008696	TA	3	6	4161	4166	50 %	50 %	0 %	0 %	119709763
96	NC_008696	CAGC	2	8	4192	4199	25 %	0 %	25 %	50 %	119709763
97	NC_008696	TCA	2	6	4233	4238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008696	CCT	2	6	4341	4346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709764
99	NC_008696	CTC	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709764
100	NC_008696	CTT	3	9	4381	4389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119709764
101	NC_008696	CCGT	2	8	4397	4404	0 %	25 %	25 %	50 %	119709764
102	NC_008696	GTC	2	6	4408	4413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119709764
103	NC_008696	AG	3	6	4425	4430	50 %	0 %	50 %	0 %	119709764
104	NC_008696	GA	3	6	4439	4444	50 %	0 %	50 %	0 %	119709764
105	NC_008696	ACC	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709764
106	NC_008696	CTC	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709764
107	NC_008696	CGA	2	6	4548	4553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709764
108	NC_008696	AAG	2	6	4571	4576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119709764
109	NC_008696	CCG	2	6	4595	4600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119709764
110	NC_008696	CGG	2	6	4612	4617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119709764
111	NC_008696	C	6	6	4643	4648	0 %	0 %	0 %	100 %	119709764
112	NC_008696	TTG	2	6	4747	4752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119709765
113	NC_008696	CTC	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709765
114	NC_008696	CGAC	2	8	4793	4800	25 %	0 %	25 %	50 %	119709765
115	NC_008696	ACC	2	6	4813	4818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709765
116	NC_008696	CGA	2	6	4887	4892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709765
117	NC_008696	C	6	6	5098	5103	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_008696	GGA	2	6	5164	5169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008696	CCT	2	6	5255	5260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709766
120	NC_008696	TCC	3	9	5266	5274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709766
121	NC_008696	CTC	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709766
122	NC_008696	TCC	2	6	5329	5334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709766
123	NC_008696	TGT	2	6	5432	5437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119709766
124	NC_008696	CTC	2	6	5460	5465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709766
125	NC_008696	CAC	2	6	5469	5474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119709766
126	NC_008696	C	6	6	5506	5511	0 %	0 %	0 %	100 %	119709766
127	NC_008696	CTC	2	6	5580	5585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709766
128	NC_008696	GAG	2	6	5626	5631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008696	A	6	6	5632	5637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008696	TCT	3	9	5664	5672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008696	GA	4	8	5726	5733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008696	GC	3	6	5746	5751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008696	GTC	2	6	5786	5791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119709767
134	NC_008696	CTC	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709767
135	NC_008696	CTG	2	6	5847	5852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119709767
136	NC_008696	TAGGCT	2	12	5944	5955	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	119709767
137	NC_008696	CT	3	6	5959	5964	0 %	50 %	0 %	50 %	119709767
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401	NC_008696	CAG	2	6	17747	17752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119709786
402	NC_008696	TGG	2	6	17793	17798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119709786
403	NC_008696	TGG	2	6	17814	17819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119709786
404	NC_008696	G	6	6	17831	17836	0 %	0 %	100 %	0 %	119709786
405	NC_008696	G	6	6	17849	17854	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_008696	AGGGGG	2	12	18720	18731	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_008696	CT	3	6	19440	19445	0 %	50 %	0 %	50 %	119709791
441	NC_008696	CCT	2	6	19451	19456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709791
442	NC_008696	CCT	2	6	19463	19468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119709791
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451	NC_008696	A	6	6	19858	19863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_008696	C	7	7	19921	19927	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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