MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 183436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008312	CTG	2	6	124	129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113473943
2	NC_008312	AAT	2	6	141	146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473943
3	NC_008312	TA	3	6	201	206	50 %	50 %	0 %	0 %	113473943
4	NC_008312	ATTT	2	8	255	262	25 %	75 %	0 %	0 %	113473943
5	NC_008312	ACT	2	6	264	269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473943
6	NC_008312	T	6	6	269	274	0 %	100 %	0 %	0 %	113473943
7	NC_008312	TAG	2	6	284	289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473943
8	NC_008312	A	6	6	290	295	100 %	0 %	0 %	0 %	113473943
9	NC_008312	AT	3	6	392	397	50 %	50 %	0 %	0 %	113473943
10	NC_008312	GTA	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473943
11	NC_008312	AAT	2	6	423	428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473943
12	NC_008312	CTT	2	6	445	450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113473943
13	NC_008312	TGG	2	6	500	505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113473943
14	NC_008312	TGATT	2	10	611	620	20 %	60 %	20 %	0 %	113473943
15	NC_008312	GCT	2	6	621	626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113473943
16	NC_008312	AGC	2	6	668	673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113473943
17	NC_008312	TAG	2	6	685	690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473943
18	NC_008312	AGG	2	6	727	732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113473943
19	NC_008312	T	6	6	735	740	0 %	100 %	0 %	0 %	113473943
20	NC_008312	AGT	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473943
21	NC_008312	A	6	6	908	913	100 %	0 %	0 %	0 %	113473943
22	NC_008312	AT	3	6	956	961	50 %	50 %	0 %	0 %	113473943
23	NC_008312	GGAG	2	8	995	1002	25 %	0 %	75 %	0 %	113473943
24	NC_008312	GTT	2	6	1014	1019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113473943
25	NC_008312	TATTTC	2	12	1025	1036	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	113473943
26	NC_008312	TTA	2	6	1117	1122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473943
27	NC_008312	GTT	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113473943
28	NC_008312	ACA	2	6	1226	1231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113473943
29	NC_008312	GGA	2	6	1269	1274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113473943
30	NC_008312	ACCAC	2	10	1279	1288	40 %	0 %	0 %	60 %	113473943
31	NC_008312	AATT	2	8	1373	1380	50 %	50 %	0 %	0 %	113473943
32	NC_008312	GTC	2	6	1387	1392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113473943
33	NC_008312	TTAG	2	8	1394	1401	25 %	50 %	25 %	0 %	113473943
34	NC_008312	AAG	2	6	1409	1414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008312	TAAC	2	8	1427	1434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008312	ATCC	2	8	1437	1444	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008312	AAT	2	6	1500	1505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473944
38	NC_008312	TGA	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113473944
39	NC_008312	CTA	2	6	1641	1646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113473944
40	NC_008312	TAA	2	6	1653	1658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473944
41	NC_008312	T	7	7	1660	1666	0 %	100 %	0 %	0 %	113473944
42	NC_008312	ATG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008312	TAA	2	6	1720	1725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008312	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008312	CTA	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008312	T	6	6	1870	1875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008312	T	7	7	1879	1885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008312	TAA	2	6	1932	1937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008312	T	6	6	1960	1965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008312	ATA	2	6	1987	1992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008312	TTTC	2	8	2012	2019	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008312	GTT	2	6	2031	2036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008312	T	8	8	2035	2042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008312	ATTC	2	8	2051	2058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008312	ATT	2	6	2156	2161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008312	TCTAA	2	10	2162	2171	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008312	TA	3	6	2228	2233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008312	AAAT	2	8	2253	2260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008312	ACC	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_008312	TTA	2	6	2302	2307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008312	ATT	2	6	2368	2373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008312	AAC	2	6	2404	2409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008312	AT	3	6	2415	2420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008312	TGC	2	6	2459	2464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008312	CTG	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008312	A	6	6	2542	2547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008312	CT	3	6	2619	2624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008312	T	6	6	2653	2658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008312	AAGTT	2	10	2670	2679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008312	TC	3	6	2750	2755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008312	T	6	6	2770	2775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008312	TAG	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008312	AT	5	10	2825	2834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008312	A	7	7	2846	2852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008312	T	7	7	2862	2868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008312	AT	3	6	2869	2874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008312	AAT	3	9	2875	2883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008312	TAT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008312	TA	3	6	2960	2965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008312	AAT	2	6	2966	2971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008312	A	6	6	2985	2990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008312	TAGTTT	2	12	2992	3003	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008312	A	6	6	3011	3016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008312	A	7	7	3033	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008312	GTT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008312	T	6	6	3089	3094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008312	ATTT	2	8	3096	3103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008312	GTT	2	6	3108	3113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008312	AGTA	2	8	3138	3145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008312	AAAT	2	8	3159	3166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008312	A	7	7	3172	3178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008312	TTTA	2	8	3202	3209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008312	AATG	2	8	3258	3265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008312	AGG	2	6	3298	3303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008312	AGA	2	6	3313	3318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008312	ATTT	2	8	3343	3350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008312	ATT	2	6	3354	3359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008312	TAT	2	6	3384	3389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008312	T	6	6	3409	3414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008312	AAAAT	2	10	3476	3485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008312	A	8	8	3525	3532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008312	CTTT	2	8	3622	3629	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008312	CTAC	2	8	3663	3670	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008312	TTA	2	6	3671	3676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008312	AAAT	2	8	3688	3695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008312	ATT	2	6	3702	3707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008312	TTAT	2	8	3717	3724	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008312	A	6	6	3809	3814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008312	TAA	2	6	4074	4079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008312	ACT	2	6	4147	4152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008312	AAAT	2	8	4225	4232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008312	TATT	2	8	4255	4262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008312	A	10	10	4283	4292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008312	TTA	2	6	4334	4339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008312	ATT	2	6	4372	4377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008312	A	6	6	4422	4427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008312	CTA	2	6	4505	4510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008312	GTG	2	6	4594	4599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008312	CCG	2	6	4605	4610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_008312	TGT	2	6	4614	4619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008312	GAAT	2	8	4649	4656	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008312	CAA	2	6	4851	4856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008312	TAA	2	6	4901	4906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008312	CT	3	6	4929	4934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008312	AAG	2	6	5028	5033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008312	TA	3	6	5163	5168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008312	GAA	2	6	5231	5236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008312	TTA	2	6	5327	5332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008312	GAAA	2	8	5376	5383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008312	ACT	2	6	5384	5389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008312	GGT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008312	ATT	3	9	5432	5440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008312	GTA	2	6	5463	5468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008312	AAG	2	6	5535	5540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008312	GGT	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008312	ACA	2	6	5645	5650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008312	CAA	2	6	5662	5667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008312	TCAGA	2	10	5704	5713	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008312	TTA	2	6	5754	5759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008312	TGA	2	6	5827	5832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008312	CAG	2	6	5898	5903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008312	TAGT	2	8	5915	5922	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008312	AAT	2	6	6008	6013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008312	ACC	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_008312	TGT	2	6	6076	6081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008312	TTA	2	6	6228	6233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008312	ATT	2	6	6308	6313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008312	AAC	2	6	6314	6319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008312	CT	3	6	6392	6397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008312	AAG	2	6	6407	6412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008312	TAA	2	6	6482	6487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008312	TAA	2	6	6544	6549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008312	TAA	2	6	6561	6566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008312	GAA	2	6	6685	6690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008312	GTG	2	6	6839	6844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008312	TAA	2	6	6853	6858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008312	TTAG	2	8	6931	6938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_008312	TGA	2	6	6998	7003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008312	GCTT	2	8	7066	7073	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_008312	ACT	2	6	7080	7085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_008312	CAG	2	6	7175	7180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_008312	TTTAC	2	10	7201	7210	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_008312	GTTA	2	8	7253	7260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
166	NC_008312	TGA	2	6	7265	7270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_008312	AG	4	8	7763	7770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008312	AAC	2	6	7830	7835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_008312	AAT	2	6	7868	7873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_008312	ATTT	2	8	7884	7891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_008312	CCAAAA	2	12	7946	7957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_008312	GAA	2	6	7987	7992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_008312	A	7	7	8063	8069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_008312	TAC	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_008312	GAAA	2	8	8133	8140	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
181	NC_008312	AT	3	6	8198	8203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_008312	TAA	2	6	8226	8231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_008312	CTT	2	6	8261	8266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_008312	AAT	2	6	8485	8490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_008312	ATT	2	6	8512	8517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_008312	AGA	2	6	8595	8600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
188	NC_008312	AGTC	2	8	8708	8715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
189	NC_008312	AGAT	2	8	8796	8803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
190	NC_008312	A	6	6	8805	8810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_008312	AACA	2	8	8846	8853	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
192	NC_008312	AGGAG	2	10	8991	9000	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_008312	TGA	2	6	9281	9286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
197	NC_008312	TGG	2	6	9487	9492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113473945
198	NC_008312	TTG	3	9	9509	9517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113473945
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234	NC_008312	AAG	2	6	11319	11324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_008312	T	7	7	12721	12727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_008312	T	6	6	12789	12794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_008312	ATA	2	6	12798	12803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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