MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 183436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008312	AGT	2	6	172057	172062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474031
4002	NC_008312	TAA	2	6	172104	172109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4003	NC_008312	AT	3	6	172147	172152	50 %	50 %	0 %	0 %	113474031
4004	NC_008312	T	7	7	172281	172287	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4005	NC_008312	ATA	2	6	172343	172348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4006	NC_008312	AAT	2	6	172393	172398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4007	NC_008312	CAC	2	6	172438	172443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113474031
4008	NC_008312	CTG	2	6	172459	172464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474031
4009	NC_008312	TGA	2	6	172473	172478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474031
4010	NC_008312	TCT	2	6	172494	172499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474031
4011	NC_008312	TGATTT	2	12	172545	172556	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	113474031
4012	NC_008312	CTG	2	6	172585	172590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474031
4013	NC_008312	TGA	2	6	172599	172604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474031
4014	NC_008312	TCT	2	6	172620	172625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474031
4015	NC_008312	ATT	2	6	172664	172669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474031
4016	NC_008312	TGATTT	2	12	172671	172682	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	113474031
4017	NC_008312	CTG	2	6	172711	172716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474031
4018	NC_008312	TGA	2	6	172725	172730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474031
4019	NC_008312	TCT	2	6	172746	172751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474031
4020	NC_008312	AT	3	6	172762	172767	50 %	50 %	0 %	0 %	113474031
4021	NC_008312	ATT	2	6	172790	172795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474031
4022	NC_008312	TGATTT	2	12	172797	172808	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	113474031
4023	NC_008312	TAA	2	6	172839	172844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4024	NC_008312	ATTT	2	8	172981	172988	25 %	75 %	0 %	0 %	113474031
4025	NC_008312	T	6	6	173018	173023	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4026	NC_008312	TAA	2	6	173106	173111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4027	NC_008312	TA	3	6	173207	173212	50 %	50 %	0 %	0 %	113474031
4028	NC_008312	T	7	7	173284	173290	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4029	NC_008312	GCT	3	9	173316	173324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474031
4030	NC_008312	CTC	2	6	173384	173389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113474031
4031	NC_008312	ATA	2	6	173390	173395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4032	NC_008312	ATTT	2	8	173474	173481	25 %	75 %	0 %	0 %	113474031
4033	NC_008312	TTTC	2	8	173506	173513	0 %	75 %	0 %	25 %	113474031
4034	NC_008312	AAT	2	6	173531	173536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4035	NC_008312	ATT	3	9	173540	173548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474031
4036	NC_008312	T	7	7	173552	173558	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4037	NC_008312	T	6	6	173575	173580	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4038	NC_008312	GAT	2	6	173621	173626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474031
4039	NC_008312	GAT	2	6	173712	173717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474031
4040	NC_008312	CTA	2	6	173775	173780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474031
4041	NC_008312	AAC	2	6	173792	173797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474031
4042	NC_008312	AAT	2	6	173822	173827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4043	NC_008312	ATC	2	6	173837	173842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474031
4044	NC_008312	CTG	2	6	173852	173857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474031
4045	NC_008312	ATT	2	6	173859	173864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474031
4046	NC_008312	GA	3	6	173903	173908	50 %	0 %	50 %	0 %	113474031
4047	NC_008312	AAT	2	6	173926	173931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4048	NC_008312	GTA	2	6	173946	173951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474031
4049	NC_008312	TAA	2	6	174005	174010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4050	NC_008312	GCA	2	6	174073	174078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474031
4051	NC_008312	TTC	2	6	174101	174106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474031
4052	NC_008312	TCT	2	6	174166	174171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474031
4053	NC_008312	T	7	7	174324	174330	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4054	NC_008312	AAAG	2	8	174333	174340	75 %	0 %	25 %	0 %	113474031
4055	NC_008312	T	6	6	174344	174349	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4056	NC_008312	GCT	2	6	174363	174368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474031
4057	NC_008312	GTA	2	6	174410	174415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474031
4058	NC_008312	T	6	6	174451	174456	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4059	NC_008312	T	6	6	174520	174525	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4060	NC_008312	ATA	2	6	174590	174595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4061	NC_008312	CTT	2	6	174604	174609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474031
4062	NC_008312	T	7	7	174620	174626	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4063	NC_008312	A	6	6	174730	174735	100 %	0 %	0 %	0 %	113474031
4064	NC_008312	CTAATT	2	12	174808	174819	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	113474031
4065	NC_008312	TTTA	2	8	174848	174855	25 %	75 %	0 %	0 %	113474031
4066	NC_008312	T	6	6	174895	174900	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4067	NC_008312	ACCT	2	8	174902	174909	25 %	25 %	0 %	50 %	113474031
4068	NC_008312	CTT	3	9	174923	174931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474031
4069	NC_008312	T	7	7	174943	174949	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4070	NC_008312	TTG	2	6	174962	174967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474031
4071	NC_008312	TTCT	2	8	174968	174975	0 %	75 %	0 %	25 %	113474031
4072	NC_008312	ACT	2	6	174995	175000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474031
4073	NC_008312	T	7	7	175018	175024	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4074	NC_008312	AAT	2	6	175031	175036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4075	NC_008312	ATA	2	6	175080	175085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4076	NC_008312	TCT	2	6	175086	175091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474031
4077	NC_008312	TCT	2	6	175140	175145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474031
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4079	NC_008312	AAT	3	9	175192	175200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4080	NC_008312	ATA	2	6	175257	175262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4081	NC_008312	AAT	2	6	175289	175294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4082	NC_008312	ACAA	2	8	175355	175362	75 %	0 %	0 %	25 %	113474031
4083	NC_008312	CTT	3	9	175390	175398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474031
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4085	NC_008312	TA	4	8	175436	175443	50 %	50 %	0 %	0 %	113474031
4086	NC_008312	CCTA	2	8	175547	175554	25 %	25 %	0 %	50 %	113474031
4087	NC_008312	AATT	2	8	175577	175584	50 %	50 %	0 %	0 %	113474031
4088	NC_008312	T	6	6	175583	175588	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4089	NC_008312	ATTTT	2	10	175623	175632	20 %	80 %	0 %	0 %	113474031
4090	NC_008312	ACTA	2	8	175685	175692	50 %	25 %	0 %	25 %	113474031
4091	NC_008312	A	9	9	175692	175700	100 %	0 %	0 %	0 %	113474031
4092	NC_008312	AT	3	6	175753	175758	50 %	50 %	0 %	0 %	113474031
4093	NC_008312	ATA	2	6	175798	175803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4094	NC_008312	T	6	6	175822	175827	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4095	NC_008312	TTC	2	6	175841	175846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474031
4096	NC_008312	TCA	2	6	175872	175877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474031
4097	NC_008312	TTGA	2	8	175940	175947	25 %	50 %	25 %	0 %	113474031
4098	NC_008312	ATT	2	6	175961	175966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474031
4099	NC_008312	ATC	2	6	175968	175973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474031
4100	NC_008312	T	6	6	175979	175984	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4101	NC_008312	TAG	2	6	176012	176017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474031
4102	NC_008312	TGTTTC	2	12	176030	176041	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	113474031
4103	NC_008312	GTT	2	6	176082	176087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474031
4104	NC_008312	CCA	2	6	176156	176161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113474031
4105	NC_008312	GAT	3	9	176187	176195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474031
4106	NC_008312	T	7	7	176219	176225	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4107	NC_008312	TAA	3	9	176296	176304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4108	NC_008312	TCT	2	6	176358	176363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474031
4109	NC_008312	T	6	6	176390	176395	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4110	NC_008312	ATA	2	6	176396	176401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4111	NC_008312	TAGA	2	8	176453	176460	50 %	25 %	25 %	0 %	113474031
4112	NC_008312	TTTC	2	8	176482	176489	0 %	75 %	0 %	25 %	113474031
4113	NC_008312	T	6	6	176517	176522	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4114	NC_008312	TAA	2	6	176585	176590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4115	NC_008312	GTTCTA	2	12	176725	176736	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	113474031
4116	NC_008312	GAT	2	6	176800	176805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474031
4117	NC_008312	T	6	6	176843	176848	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4118	NC_008312	AAGT	2	8	176850	176857	50 %	25 %	25 %	0 %	113474031
4119	NC_008312	T	6	6	176878	176883	0 %	100 %	0 %	0 %	113474031
4120	NC_008312	ATT	2	6	176903	176908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474031
4121	NC_008312	GTC	2	6	176921	176926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474031
4122	NC_008312	CTT	2	6	176944	176949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474031
4123	NC_008312	TGC	2	6	176963	176968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474031
4124	NC_008312	TTGC	2	8	177067	177074	0 %	50 %	25 %	25 %	113474031
4125	NC_008312	TAA	2	6	177098	177103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
4126	NC_008312	TAA	2	6	177135	177140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
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4128	NC_008312	TAA	2	6	177197	177202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474031
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4135	NC_008312	ACT	2	6	177442	177447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4137	NC_008312	CCTA	2	8	177475	177482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4138	NC_008312	TTAAT	2	10	177518	177527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_008312	ATA	2	6	177546	177551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_008312	TCT	2	6	177598	177603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4142	NC_008312	TAT	2	6	177710	177715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_008312	T	7	7	177728	177734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_008312	AAAT	2	8	177758	177765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_008312	GTA	2	6	177772	177777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4152	NC_008312	ATA	2	6	178073	178078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4154	NC_008312	ATG	2	6	178146	178151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4156	NC_008312	T	6	6	178176	178181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4157	NC_008312	TTAA	2	8	178207	178214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4158	NC_008312	TAA	2	6	178236	178241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_008312	TGG	2	6	178318	178323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4163	NC_008312	AT	3	6	178551	178556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4164	NC_008312	AT	3	6	178572	178577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4195	NC_008312	CAA	2	6	180369	180374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4220	NC_008312	TAA	2	6	181246	181251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4221	NC_008312	GTC	2	6	181377	181382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4226	NC_008312	A	6	6	181541	181546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4245	NC_008312	TTG	2	6	182454	182459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474035
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4249	NC_008312	CCA	2	6	182577	182582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113474035
4250	NC_008312	CAA	2	6	182585	182590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474035
4251	NC_008312	TAA	2	6	182616	182621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474035
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4253	NC_008312	A	6	6	182637	182642	100 %	0 %	0 %	0 %	113474035
4254	NC_008312	A	6	6	182671	182676	100 %	0 %	0 %	0 %	113474035
4255	NC_008312	TAA	2	6	182694	182699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474035
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4287	NC_008312	CTTA	2	8	183916	183923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4291	NC_008312	A	7	7	184105	184111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4292	NC_008312	AT	3	6	184121	184126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4375	NC_008312	ACT	2	6	187583	187588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474037
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4377	NC_008312	TAT	4	12	187665	187676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474037
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