MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 183436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008312	TA	3	6	128249	128254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_008312	GAA	2	6	128258	128263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_008312	ATTT	2	8	128339	128346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008312	AGA	2	6	128398	128403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_008312	AAGAA	2	10	128446	128455	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_008312	AGA	2	6	128488	128493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_008312	AGG	2	6	128523	128528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008312	AGGG	2	8	128550	128557	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_008312	CAA	2	6	128558	128563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_008312	GA	3	6	128627	128632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_008312	ATA	2	6	128711	128716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_008312	AAT	2	6	128760	128765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_008312	CAA	2	6	128784	128789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_008312	TAA	2	6	128791	128796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_008312	TAA	2	6	128798	128803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_008312	ATT	2	6	128807	128812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_008312	T	6	6	128862	128867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_008312	GAA	2	6	128871	128876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_008312	CTT	2	6	128889	128894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_008312	TAA	2	6	128899	128904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008312	ATTT	2	8	128928	128935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_008312	A	6	6	129024	129029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_008312	A	8	8	129045	129052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_008312	T	6	6	129089	129094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_008312	TAG	2	6	129119	129124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_008312	GCAT	2	8	129129	129136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_008312	A	7	7	129149	129155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_008312	TAA	2	6	129165	129170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_008312	TAT	2	6	129181	129186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_008312	A	6	6	129291	129296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_008312	ATTAAC	2	12	129307	129318	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3032	NC_008312	AAAT	2	8	129371	129378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_008312	TTTA	2	8	129379	129386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_008312	ATT	2	6	129401	129406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_008312	AAT	2	6	129507	129512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_008312	TTA	2	6	129563	129568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_008312	AAC	2	6	129584	129589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_008312	ATT	2	6	129630	129635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474010
3039	NC_008312	A	8	8	129637	129644	100 %	0 %	0 %	0 %	113474010
3040	NC_008312	ATT	2	6	129675	129680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474010
3041	NC_008312	TGT	2	6	129688	129693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474010
3042	NC_008312	GGA	2	6	129711	129716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113474010
3043	NC_008312	ATT	2	6	129744	129749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474010
3044	NC_008312	GATA	2	8	129785	129792	50 %	25 %	25 %	0 %	113474010
3045	NC_008312	T	7	7	129809	129815	0 %	100 %	0 %	0 %	113474010
3046	NC_008312	AAAT	2	8	129831	129838	75 %	25 %	0 %	0 %	113474010
3047	NC_008312	TAT	3	9	129839	129847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_008312	GTTA	2	8	129866	129873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008312	TA	3	6	130000	130005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_008312	AT	3	6	130080	130085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_008312	ATCT	2	8	130114	130121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3052	NC_008312	TTTAT	2	10	130122	130131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_008312	TTTG	2	8	130152	130159	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008312	T	6	6	130181	130186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_008312	AGA	2	6	130278	130283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474011
3056	NC_008312	AAAT	2	8	130287	130294	75 %	25 %	0 %	0 %	113474011
3057	NC_008312	TAA	2	6	130311	130316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474011
3058	NC_008312	TCC	2	6	130368	130373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113474011
3059	NC_008312	TTA	2	6	130377	130382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474011
3060	NC_008312	TCC	2	6	130386	130391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113474011
3061	NC_008312	AG	3	6	130405	130410	50 %	0 %	50 %	0 %	113474011
3062	NC_008312	TGTTA	2	10	130588	130597	20 %	60 %	20 %	0 %	113474011
3063	NC_008312	ATG	2	6	130598	130603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474011
3064	NC_008312	GGA	2	6	130636	130641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113474011
3065	NC_008312	TGG	2	6	130693	130698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113474011
3066	NC_008312	AAT	2	6	130701	130706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474011
3067	NC_008312	GA	3	6	130720	130725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_008312	TAAAA	2	10	130734	130743	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_008312	AAG	2	6	130751	130756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_008312	ATTT	2	8	130769	130776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_008312	GAT	2	6	130777	130782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_008312	T	7	7	130833	130839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_008312	TGA	2	6	130857	130862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_008312	TGA	3	9	130871	130879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_008312	A	6	6	130879	130884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_008312	TAC	2	6	130947	130952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_008312	A	6	6	130964	130969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_008312	A	6	6	130975	130980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_008312	TAAT	2	8	131056	131063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_008312	A	7	7	131078	131084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_008312	A	6	6	131088	131093	100 %	0 %	0 %	0 %	113474012
3082	NC_008312	TGA	2	6	131094	131099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474012
3083	NC_008312	AT	3	6	131179	131184	50 %	50 %	0 %	0 %	113474012
3084	NC_008312	GAT	2	6	131227	131232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474012
3085	NC_008312	A	7	7	131257	131263	100 %	0 %	0 %	0 %	113474012
3086	NC_008312	T	6	6	131332	131337	0 %	100 %	0 %	0 %	113474012
3087	NC_008312	CAAA	2	8	131388	131395	75 %	0 %	0 %	25 %	113474012
3088	NC_008312	ATC	2	6	131497	131502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474012
3089	NC_008312	ATTC	2	8	131528	131535	25 %	50 %	0 %	25 %	113474012
3090	NC_008312	CTT	2	6	131585	131590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474012
3091	NC_008312	GAA	2	6	131594	131599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474012
3092	NC_008312	ATT	2	6	131609	131614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474012
3093	NC_008312	AAG	2	6	131742	131747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474012
3094	NC_008312	TTA	2	6	131810	131815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474012
3095	NC_008312	TAGT	2	8	131823	131830	25 %	50 %	25 %	0 %	113474012
3096	NC_008312	ATT	2	6	131877	131882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474012
3097	NC_008312	GGA	2	6	131905	131910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113474012
3098	NC_008312	TAT	2	6	131945	131950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474012
3099	NC_008312	GAA	3	9	131966	131974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474012
3100	NC_008312	CTA	2	6	132072	132077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474013
3101	NC_008312	AAG	2	6	132117	132122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474013
3102	NC_008312	TCTT	2	8	132157	132164	0 %	75 %	0 %	25 %	113474013
3103	NC_008312	GCA	2	6	132182	132187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474013
3104	NC_008312	ATA	2	6	132202	132207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474013
3105	NC_008312	AGT	2	6	132238	132243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474013
3106	NC_008312	CTA	2	6	132285	132290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474013
3107	NC_008312	TAC	2	6	132292	132297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474013
3108	NC_008312	TA	3	6	132301	132306	50 %	50 %	0 %	0 %	113474013
3109	NC_008312	CAA	2	6	132336	132341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474013
3110	NC_008312	TCG	2	6	132355	132360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474013
3111	NC_008312	CTT	2	6	132546	132551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474013
3112	NC_008312	ACTA	2	8	132565	132572	50 %	25 %	0 %	25 %	113474013
3113	NC_008312	CGT	2	6	132638	132643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474013
3114	NC_008312	GAAA	2	8	132750	132757	75 %	0 %	25 %	0 %	113474013
3115	NC_008312	TTC	2	6	132767	132772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474013
3116	NC_008312	AGA	2	6	132780	132785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474013
3117	NC_008312	AAT	3	9	132844	132852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474013
3118	NC_008312	ACG	2	6	132868	132873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474013
3119	NC_008312	ACC	2	6	132905	132910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113474013
3120	NC_008312	TTA	2	6	132941	132946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474013
3121	NC_008312	AGC	2	6	132988	132993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474013
3122	NC_008312	AGC	2	6	132997	133002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474013
3123	NC_008312	CATC	2	8	133027	133034	25 %	25 %	0 %	50 %	113474013
3124	NC_008312	ATT	2	6	133054	133059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474013
3125	NC_008312	CAA	2	6	133146	133151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474013
3126	NC_008312	AAT	2	6	133171	133176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474013
3127	NC_008312	AGC	2	6	133198	133203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474013
3128	NC_008312	TGT	2	6	133333	133338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_008312	AAGTCC	2	12	133408	133419	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_008312	AG	3	6	133473	133478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_008312	ATG	2	6	133500	133505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_008312	CAA	2	6	133529	133534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_008312	A	6	6	133533	133538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_008312	G	6	6	133548	133553	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_008312	TGT	2	6	133606	133611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_008312	AAGTCC	2	12	133681	133692	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3161	NC_008312	ATT	2	6	135110	135115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3162	NC_008312	CAG	2	6	135128	135133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3242	NC_008312	GAA	2	6	138693	138698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_008312	TAAT	2	8	138699	138706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_008312	TAA	2	6	138719	138724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_008312	TGT	2	6	138748	138753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3248	NC_008312	TTG	2	6	138831	138836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_008312	AGT	2	6	138843	138848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_008312	AAC	2	6	138949	138954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_008312	TCC	2	6	138979	138984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3252	NC_008312	TTC	2	6	139095	139100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_008312	CAT	2	6	139311	139316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3254	NC_008312	ACT	2	6	139325	139330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3255	NC_008312	TC	3	6	139341	139346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3256	NC_008312	CTA	2	6	139458	139463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474015
3257	NC_008312	CTGGTA	2	12	139546	139557	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113474015
3258	NC_008312	GTC	2	6	139606	139611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474015
3259	NC_008312	C	6	6	139681	139686	0 %	0 %	0 %	100 %	113474015
3260	NC_008312	T	6	6	139696	139701	0 %	100 %	0 %	0 %	113474015
3261	NC_008312	TCA	2	6	139728	139733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474015
3262	NC_008312	CT	3	6	139756	139761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3263	NC_008312	GACTTG	2	12	139810	139821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3265	NC_008312	CCT	2	6	139945	139950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3266	NC_008312	CTAC	2	8	139994	140001	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3267	NC_008312	CTT	2	6	140073	140078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3268	NC_008312	TCTTT	2	10	140106	140115	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3269	NC_008312	T	6	6	140113	140118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_008312	TAA	2	6	140126	140131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_008312	CAAAT	2	10	140167	140176	60 %	20 %	0 %	20 %	113474016
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3291	NC_008312	A	8	8	140986	140993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3292	NC_008312	TAA	2	6	140995	141000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3293	NC_008312	TTA	2	6	141043	141048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3294	NC_008312	T	6	6	141096	141101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3381	NC_008312	ATTA	2	8	144710	144717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3382	NC_008312	T	6	6	144729	144734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3383	NC_008312	ATT	2	6	144741	144746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3384	NC_008312	ATT	3	9	144763	144771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3385	NC_008312	T	9	9	144842	144850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3386	NC_008312	ATT	2	6	144856	144861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3387	NC_008312	TA	5	10	144888	144897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3388	NC_008312	ACAAT	2	10	144930	144939	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3389	NC_008312	TA	3	6	145011	145016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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