MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 183436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008312	TA	3	6	107515	107520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_008312	TAG	2	6	107571	107576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_008312	TCT	3	9	107589	107597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_008312	CTA	2	6	107604	107609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_008312	ATT	2	6	107622	107627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_008312	T	6	6	107794	107799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_008312	ATT	2	6	107816	107821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_008312	ATT	2	6	107824	107829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473998
2509	NC_008312	TAA	2	6	107966	107971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473998
2510	NC_008312	AATTCT	2	12	107985	107996	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	113473998
2511	NC_008312	TGA	2	6	108044	108049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_008312	ATT	2	6	108144	108149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_008312	CTG	3	9	108277	108285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_008312	TAA	2	6	108294	108299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_008312	TGG	2	6	108324	108329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_008312	GAA	2	6	108390	108395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_008312	TCA	3	9	108423	108431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_008312	TA	3	6	108488	108493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_008312	TAG	2	6	108544	108549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_008312	TCT	3	9	108562	108570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_008312	CTA	2	6	108577	108582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_008312	ATT	2	6	108595	108600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_008312	T	6	6	108767	108772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_008312	ATT	2	6	108789	108794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_008312	ATT	2	6	108797	108802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113473999
2526	NC_008312	TAA	2	6	108939	108944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113473999
2527	NC_008312	AATTCT	2	12	108958	108969	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	113473999
2528	NC_008312	TGA	2	6	109017	109022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_008312	ATT	2	6	109117	109122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_008312	CTG	3	9	109250	109258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_008312	TAA	2	6	109267	109272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_008312	TGG	2	6	109297	109302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_008312	GAA	2	6	109363	109368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_008312	TCA	3	9	109396	109404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_008312	TA	3	6	109461	109466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_008312	TAG	2	6	109517	109522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_008312	TCT	3	9	109535	109543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_008312	CTA	2	6	109550	109555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_008312	ATT	2	6	109568	109573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_008312	GCA	2	6	109718	109723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_008312	T	6	6	109740	109745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_008312	ATT	2	6	109762	109767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_008312	ATT	2	6	109770	109775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474000
2544	NC_008312	TAA	3	9	109909	109917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474000
2545	NC_008312	AATTCT	2	12	109931	109942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	113474000
2546	NC_008312	TTA	2	6	110124	110129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474000
2547	NC_008312	GTT	2	6	110139	110144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474000
2548	NC_008312	CCA	2	6	110162	110167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113474000
2549	NC_008312	AAC	2	6	110173	110178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474000
2550	NC_008312	ATTA	2	8	110197	110204	50 %	50 %	0 %	0 %	113474000
2551	NC_008312	AAT	2	6	110268	110273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474000
2552	NC_008312	T	6	6	110349	110354	0 %	100 %	0 %	0 %	113474000
2553	NC_008312	AAT	2	6	110374	110379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474000
2554	NC_008312	AG	3	6	110428	110433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_008312	GCA	2	6	110446	110451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_008312	A	7	7	110462	110468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_008312	GC	3	6	110494	110499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2558	NC_008312	ATT	2	6	110511	110516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_008312	TAGAT	2	10	110539	110548	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_008312	ATTT	2	8	110570	110577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_008312	TTC	2	6	110650	110655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474001
2562	NC_008312	GCTAAA	2	12	110668	110679	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	113474001
2563	NC_008312	TAA	2	6	110762	110767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474001
2564	NC_008312	AAG	2	6	110768	110773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474001
2565	NC_008312	CAA	2	6	110837	110842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474001
2566	NC_008312	CAA	2	6	110848	110853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474001
2567	NC_008312	TA	3	6	110870	110875	50 %	50 %	0 %	0 %	113474001
2568	NC_008312	CAT	2	6	110903	110908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474001
2569	NC_008312	CTG	2	6	111002	111007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474001
2570	NC_008312	GCA	2	6	111040	111045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474001
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2572	NC_008312	A	6	6	111136	111141	100 %	0 %	0 %	0 %	113474001
2573	NC_008312	TA	3	6	111168	111173	50 %	50 %	0 %	0 %	113474001
2574	NC_008312	T	6	6	111177	111182	0 %	100 %	0 %	0 %	113474001
2575	NC_008312	CAC	2	6	111332	111337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113474001
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2577	NC_008312	GTAA	2	8	111440	111447	50 %	25 %	25 %	0 %	113474001
2578	NC_008312	T	8	8	111466	111473	0 %	100 %	0 %	0 %	113474001
2579	NC_008312	TAA	2	6	111498	111503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474001
2580	NC_008312	T	7	7	111510	111516	0 %	100 %	0 %	0 %	113474001
2581	NC_008312	TATTT	2	10	111522	111531	20 %	80 %	0 %	0 %	113474001
2582	NC_008312	TGA	2	6	111583	111588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_008312	AATTTT	2	12	111599	111610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_008312	TAA	2	6	111636	111641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_008312	AT	3	6	111644	111649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_008312	TA	3	6	111684	111689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_008312	T	6	6	111690	111695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_008312	TAT	2	6	111705	111710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_008312	A	6	6	111751	111756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_008312	TTC	2	6	111821	111826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_008312	TC	3	6	111825	111830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2592	NC_008312	GAA	2	6	111853	111858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_008312	A	6	6	111860	111865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_008312	T	6	6	111913	111918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_008312	TGAT	2	8	111941	111948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_008312	CTG	2	6	111953	111958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_008312	ATA	2	6	111959	111964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_008312	TTTCTA	2	12	111988	111999	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2599	NC_008312	TAT	2	6	112044	112049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_008312	TAT	2	6	112055	112060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_008312	T	8	8	112067	112074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_008312	T	6	6	112091	112096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_008312	TA	3	6	112114	112119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_008312	ACT	2	6	112143	112148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_008312	TA	3	6	112149	112154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_008312	AT	3	6	112160	112165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_008312	T	7	7	112168	112174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_008312	ATT	2	6	112186	112191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_008312	T	6	6	112216	112221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_008312	AAC	2	6	112231	112236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_008312	T	6	6	112262	112267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_008312	TAA	2	6	112321	112326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_008312	TAAAA	2	10	112350	112359	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_008312	AAT	2	6	112389	112394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_008312	GAAGT	2	10	112406	112415	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_008312	ATT	3	9	112419	112427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_008312	TA	3	6	112428	112433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_008312	TTG	2	6	112559	112564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_008312	TCT	2	6	112584	112589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_008312	ATT	2	6	112601	112606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_008312	ATT	2	6	112612	112617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_008312	T	6	6	112623	112628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_008312	CAA	2	6	112632	112637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_008312	T	7	7	112672	112678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_008312	TAA	2	6	112714	112719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_008312	TTA	2	6	112824	112829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_008312	ATCT	2	8	112857	112864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2628	NC_008312	T	6	6	112864	112869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_008312	T	7	7	112952	112958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_008312	TATT	2	8	113014	113021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_008312	CTAG	2	8	113064	113071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2632	NC_008312	ATT	2	6	113075	113080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_008312	AGTT	2	8	113098	113105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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