MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 183436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_008312	AGC	2	6	799983	799988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474366
18502	NC_008312	AGG	2	6	799992	799997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113474366
18503	NC_008312	ATC	2	6	800001	800006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474366
18504	NC_008312	CTT	2	6	800051	800056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474366
18505	NC_008312	AGT	2	6	800079	800084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474366
18506	NC_008312	TAA	2	6	800085	800090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474366
18507	NC_008312	GAA	2	6	800137	800142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474366
18508	NC_008312	TAAAT	2	10	800151	800160	60 %	40 %	0 %	0 %	113474366
18509	NC_008312	AATT	2	8	800251	800258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18510	NC_008312	ATC	2	6	800272	800277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18511	NC_008312	CTA	2	6	800279	800284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18512	NC_008312	TCA	2	6	800341	800346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18513	NC_008312	A	7	7	800356	800362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18514	NC_008312	TTA	2	6	800434	800439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18515	NC_008312	T	6	6	800559	800564	0 %	100 %	0 %	0 %	113474367
18516	NC_008312	TTA	2	6	800566	800571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474367
18517	NC_008312	GAA	2	6	800599	800604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474367
18518	NC_008312	TCC	2	6	800616	800621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113474367
18519	NC_008312	TTG	2	6	800709	800714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474367
18520	NC_008312	AGCT	2	8	800816	800823	25 %	25 %	25 %	25 %	113474367
18521	NC_008312	GCA	2	6	800941	800946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474367
18522	NC_008312	ATA	2	6	800953	800958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474367
18523	NC_008312	GAT	2	6	801055	801060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474367
18524	NC_008312	TCA	2	6	801094	801099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474367
18525	NC_008312	AAG	2	6	801114	801119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474367
18526	NC_008312	CAA	2	6	801149	801154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474367
18527	NC_008312	TAC	2	6	801171	801176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474367
18528	NC_008312	GGA	2	6	801197	801202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113474367
18529	NC_008312	CTG	2	6	801230	801235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474367
18530	NC_008312	AGC	2	6	801270	801275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474367
18531	NC_008312	AAT	2	6	801318	801323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474367
18532	NC_008312	AGC	2	6	801393	801398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474367
18533	NC_008312	AAC	2	6	801411	801416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474367
18534	NC_008312	AAC	2	6	801423	801428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474367
18535	NC_008312	AACC	2	8	801439	801446	50 %	0 %	0 %	50 %	113474367
18536	NC_008312	CTA	2	6	801503	801508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474367
18537	NC_008312	ATAG	2	8	801588	801595	50 %	25 %	25 %	0 %	113474367
18538	NC_008312	TCT	2	6	801631	801636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474367
18539	NC_008312	TGCT	2	8	801695	801702	0 %	50 %	25 %	25 %	113474367
18540	NC_008312	AAG	2	6	801772	801777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474367
18541	NC_008312	TGT	2	6	801819	801824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474367
18542	NC_008312	CCA	2	6	801848	801853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113474367
18543	NC_008312	T	6	6	801973	801978	0 %	100 %	0 %	0 %	113474367
18544	NC_008312	TCC	2	6	801984	801989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113474367
18545	NC_008312	ATAGCT	2	12	802045	802056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113474367
18546	NC_008312	AGATT	2	10	802130	802139	40 %	40 %	20 %	0 %	113474367
18547	NC_008312	TCG	2	6	802153	802158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474367
18548	NC_008312	AATT	2	8	802164	802171	50 %	50 %	0 %	0 %	113474367
18549	NC_008312	ACT	2	6	802329	802334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474368
18550	NC_008312	GTA	2	6	802435	802440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474368
18551	NC_008312	T	6	6	802460	802465	0 %	100 %	0 %	0 %	113474368
18552	NC_008312	TA	3	6	802477	802482	50 %	50 %	0 %	0 %	113474368
18553	NC_008312	T	6	6	802532	802537	0 %	100 %	0 %	0 %	113474368
18554	NC_008312	TTA	2	6	802587	802592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474368
18555	NC_008312	TTTGAG	2	12	802599	802610	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	113474368
18556	NC_008312	TGC	2	6	802649	802654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474368
18557	NC_008312	AATT	2	8	802730	802737	50 %	50 %	0 %	0 %	113474368
18558	NC_008312	AGG	2	6	802745	802750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18559	NC_008312	ACT	2	6	802842	802847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18560	NC_008312	TC	3	6	802862	802867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18561	NC_008312	GAT	2	6	802900	802905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_008312	TCTTT	2	10	802996	803005	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18563	NC_008312	TTA	2	6	803044	803049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_008312	TA	3	6	803048	803053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18565	NC_008312	GGGA	2	8	803061	803068	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18566	NC_008312	CA	3	6	803118	803123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18567	NC_008312	TA	3	6	803232	803237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18568	NC_008312	ATT	2	6	803272	803277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18569	NC_008312	ATTA	2	8	803344	803351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18570	NC_008312	A	8	8	803440	803447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18571	NC_008312	T	6	6	803451	803456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18572	NC_008312	ATT	2	6	803478	803483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18573	NC_008312	TACT	2	8	803504	803511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18574	NC_008312	A	6	6	803512	803517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18575	NC_008312	A	7	7	803553	803559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18576	NC_008312	AAT	2	6	803587	803592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18577	NC_008312	TAT	2	6	803665	803670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474369
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18579	NC_008312	AGGG	2	8	803689	803696	25 %	0 %	75 %	0 %	113474369
18580	NC_008312	TC	3	6	803701	803706	0 %	50 %	0 %	50 %	113474369
18581	NC_008312	AAT	2	6	803841	803846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474369
18582	NC_008312	GTT	2	6	803847	803852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474369
18583	NC_008312	A	6	6	803902	803907	100 %	0 %	0 %	0 %	113474369
18584	NC_008312	TAA	2	6	803952	803957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474369
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18587	NC_008312	CTG	2	6	804164	804169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474369
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18589	NC_008312	T	7	7	804246	804252	0 %	100 %	0 %	0 %	113474369
18590	NC_008312	GAA	2	6	804270	804275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474369
18591	NC_008312	AT	4	8	804342	804349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18592	NC_008312	AATT	2	8	804477	804484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18593	NC_008312	TTG	2	6	804508	804513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18594	NC_008312	ATA	2	6	804541	804546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18595	NC_008312	T	6	6	804618	804623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18596	NC_008312	TTA	2	6	804733	804738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474370
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18599	NC_008312	ATA	2	6	804856	804861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474370
18600	NC_008312	ATA	2	6	804903	804908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474370
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18603	NC_008312	AT	3	6	805123	805128	50 %	50 %	0 %	0 %	113474370
18604	NC_008312	CTT	2	6	805134	805139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474370
18605	NC_008312	A	6	6	805157	805162	100 %	0 %	0 %	0 %	113474370
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18607	NC_008312	AATT	2	8	805194	805201	50 %	50 %	0 %	0 %	113474370
18608	NC_008312	ATA	2	6	805294	805299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474370
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18611	NC_008312	ATC	2	6	805456	805461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474370
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18613	NC_008312	AGC	2	6	805480	805485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474370
18614	NC_008312	T	6	6	805500	805505	0 %	100 %	0 %	0 %	113474370
18615	NC_008312	TTA	2	6	805514	805519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474370
18616	NC_008312	AATAA	2	10	805527	805536	80 %	20 %	0 %	0 %	113474370
18617	NC_008312	TTA	2	6	805566	805571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18618	NC_008312	TTA	2	6	805573	805578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18619	NC_008312	TTA	2	6	805580	805585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18620	NC_008312	TTA	2	6	805587	805592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18621	NC_008312	AGG	2	6	805606	805611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18622	NC_008312	T	8	8	805626	805633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18623	NC_008312	TAAG	2	8	805706	805713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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