MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 183436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_008312	TA	3	6	778379	778384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18003	NC_008312	TTTA	2	8	778390	778397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_008312	TG	3	6	778418	778423	0 %	50 %	50 %	0 %	113474354
18005	NC_008312	CT	3	6	778446	778451	0 %	50 %	0 %	50 %	113474354
18006	NC_008312	ATCAA	2	10	778482	778491	60 %	20 %	0 %	20 %	113474354
18007	NC_008312	ATT	2	6	778546	778551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474354
18008	NC_008312	GATG	2	8	778561	778568	25 %	25 %	50 %	0 %	113474354
18009	NC_008312	CTA	2	6	778590	778595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474354
18010	NC_008312	GTAA	2	8	778597	778604	50 %	25 %	25 %	0 %	113474354
18011	NC_008312	T	8	8	778611	778618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18012	NC_008312	TCT	2	6	778630	778635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_008312	AAT	2	6	778662	778667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_008312	TTA	2	6	778686	778691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18015	NC_008312	AAAT	2	8	778694	778701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_008312	CAA	2	6	778735	778740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18017	NC_008312	T	7	7	778775	778781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18018	NC_008312	TA	3	6	778783	778788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_008312	TAA	2	6	778792	778797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_008312	TAAA	2	8	778840	778847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18021	NC_008312	TTAA	2	8	778875	778882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_008312	TAAA	2	8	778943	778950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_008312	AGT	2	6	778966	778971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18024	NC_008312	TTA	2	6	779061	779066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_008312	A	8	8	779151	779158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18027	NC_008312	T	8	8	779227	779234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18028	NC_008312	AGT	2	6	779267	779272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_008312	AGA	2	6	779298	779303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18030	NC_008312	A	7	7	779303	779309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_008312	TTG	2	6	779371	779376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18032	NC_008312	AT	3	6	779387	779392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_008312	T	6	6	779392	779397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18034	NC_008312	TTTA	2	8	779455	779462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_008312	ATTA	2	8	779509	779516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18036	NC_008312	TAA	2	6	779528	779533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_008312	A	6	6	779532	779537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18038	NC_008312	A	6	6	779555	779560	100 %	0 %	0 %	0 %	113474355
18039	NC_008312	A	6	6	779565	779570	100 %	0 %	0 %	0 %	113474355
18040	NC_008312	A	8	8	779603	779610	100 %	0 %	0 %	0 %	113474355
18041	NC_008312	CAA	2	6	779718	779723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474355
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18043	NC_008312	GCA	2	6	779771	779776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474355
18044	NC_008312	CAA	2	6	779940	779945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474355
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18047	NC_008312	ATTA	2	8	780056	780063	50 %	50 %	0 %	0 %	113474355
18048	NC_008312	TAA	2	6	780067	780072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474355
18049	NC_008312	AGCT	2	8	780088	780095	25 %	25 %	25 %	25 %	113474355
18050	NC_008312	T	6	6	780101	780106	0 %	100 %	0 %	0 %	113474355
18051	NC_008312	GAA	2	6	780107	780112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474355
18052	NC_008312	TAG	2	6	780114	780119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474355
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18057	NC_008312	A	7	7	780729	780735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_008312	ATT	2	6	780777	780782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18059	NC_008312	T	8	8	780788	780795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18060	NC_008312	TAT	2	6	780805	780810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18061	NC_008312	TCTTAT	2	12	780820	780831	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18062	NC_008312	CATC	2	8	780838	780845	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18063	NC_008312	GGA	2	6	780871	780876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18064	NC_008312	TGA	2	6	781006	781011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18065	NC_008312	TCA	2	6	781023	781028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18066	NC_008312	CTC	2	6	781042	781047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18067	NC_008312	A	6	6	781114	781119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_008312	AAG	2	6	781151	781156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18069	NC_008312	CTT	2	6	781222	781227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18070	NC_008312	TAA	2	6	781242	781247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18072	NC_008312	AATC	2	8	781265	781272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18074	NC_008312	TGG	2	6	781300	781305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18077	NC_008312	A	8	8	781408	781415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18078	NC_008312	A	7	7	781546	781552	100 %	0 %	0 %	0 %	113474356
18079	NC_008312	ATG	2	6	781556	781561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474356
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18099	NC_008312	AAT	2	6	782539	782544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474356
18100	NC_008312	TGA	3	9	782547	782555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474356
18101	NC_008312	GAT	2	6	782572	782577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474356
18102	NC_008312	ATG	2	6	782600	782605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474356
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18104	NC_008312	TAGT	2	8	782834	782841	25 %	50 %	25 %	0 %	113474356
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18110	NC_008312	G	7	7	783049	783055	0 %	0 %	100 %	0 %	113474356
18111	NC_008312	TA	3	6	783119	783124	50 %	50 %	0 %	0 %	113474356
18112	NC_008312	TAG	2	6	783170	783175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474356
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18114	NC_008312	TAC	2	6	783237	783242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474356
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18118	NC_008312	TG	4	8	783458	783465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18119	NC_008312	GTGAA	2	10	783468	783477	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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18122	NC_008312	ATT	2	6	783620	783625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474357
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18125	NC_008312	TTAAA	2	10	783862	783871	60 %	40 %	0 %	0 %	113474357
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