MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 183436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008312	TA	3	6	688622	688627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_008312	CTA	2	6	688704	688709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_008312	ATT	2	6	688839	688844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_008312	TTAT	2	8	688916	688923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_008312	AGAC	2	8	688952	688959	50 %	0 %	25 %	25 %	113474308
16006	NC_008312	T	6	6	688981	688986	0 %	100 %	0 %	0 %	113474308
16007	NC_008312	TAA	2	6	689006	689011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474308
16008	NC_008312	ATTA	2	8	689061	689068	50 %	50 %	0 %	0 %	113474308
16009	NC_008312	TA	3	6	689067	689072	50 %	50 %	0 %	0 %	113474308
16010	NC_008312	GTTG	2	8	689137	689144	0 %	50 %	50 %	0 %	113474308
16011	NC_008312	CAAA	2	8	689145	689152	75 %	0 %	0 %	25 %	113474308
16012	NC_008312	ATT	2	6	689166	689171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474308
16013	NC_008312	T	6	6	689218	689223	0 %	100 %	0 %	0 %	113474308
16014	NC_008312	ACT	2	6	689256	689261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474308
16015	NC_008312	CTG	2	6	689267	689272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474308
16016	NC_008312	CAG	2	6	689387	689392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474308
16017	NC_008312	ATC	2	6	689451	689456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474308
16018	NC_008312	TCT	2	6	689497	689502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474308
16019	NC_008312	ATA	2	6	689532	689537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474308
16020	NC_008312	CATT	2	8	689578	689585	25 %	50 %	0 %	25 %	113474308
16021	NC_008312	TATT	2	8	689633	689640	25 %	75 %	0 %	0 %	113474308
16022	NC_008312	ATA	2	6	689663	689668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474308
16023	NC_008312	ATC	2	6	689676	689681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474308
16024	NC_008312	AATT	2	8	689760	689767	50 %	50 %	0 %	0 %	113474308
16025	NC_008312	TA	3	6	689801	689806	50 %	50 %	0 %	0 %	113474308
16026	NC_008312	CCG	2	6	689842	689847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113474308
16027	NC_008312	TGA	2	6	689932	689937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474308
16028	NC_008312	GTA	2	6	689989	689994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474308
16029	NC_008312	TTTG	2	8	690097	690104	0 %	75 %	25 %	0 %	113474308
16030	NC_008312	CCT	2	6	690118	690123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113474308
16031	NC_008312	TA	3	6	690140	690145	50 %	50 %	0 %	0 %	113474308
16032	NC_008312	AGC	2	6	690201	690206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474308
16033	NC_008312	AATTCA	2	12	690325	690336	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	113474308
16034	NC_008312	ACCCCG	2	12	690348	690359	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	113474308
16035	NC_008312	AAT	2	6	690369	690374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474308
16036	NC_008312	AGC	2	6	690390	690395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113474308
16037	NC_008312	CTG	2	6	690479	690484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474308
16038	NC_008312	AGT	2	6	690540	690545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474308
16039	NC_008312	ATTTTC	2	12	690559	690570	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	113474308
16040	NC_008312	A	6	6	690593	690598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_008312	TAG	2	6	690628	690633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_008312	AT	3	6	690659	690664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_008312	ATA	2	6	690692	690697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_008312	A	6	6	690726	690731	100 %	0 %	0 %	0 %	113474309
16045	NC_008312	CAAA	2	8	690767	690774	75 %	0 %	0 %	25 %	113474309
16046	NC_008312	ATT	2	6	690850	690855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474309
16047	NC_008312	TTA	2	6	690873	690878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474309
16048	NC_008312	ATT	2	6	690898	690903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474309
16049	NC_008312	A	6	6	691024	691029	100 %	0 %	0 %	0 %	113474309
16050	NC_008312	ATG	2	6	691047	691052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474309
16051	NC_008312	AAG	2	6	691092	691097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474309
16052	NC_008312	A	7	7	691112	691118	100 %	0 %	0 %	0 %	113474309
16053	NC_008312	A	7	7	691122	691128	100 %	0 %	0 %	0 %	113474309
16054	NC_008312	ATTA	2	8	691146	691153	50 %	50 %	0 %	0 %	113474309
16055	NC_008312	AAAAG	2	10	691163	691172	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_008312	TGAT	2	8	691236	691243	25 %	50 %	25 %	0 %	113474310
16057	NC_008312	TCT	2	6	691252	691257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474310
16058	NC_008312	AGAC	2	8	691334	691341	50 %	0 %	25 %	25 %	113474310
16059	NC_008312	TTA	2	6	691342	691347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474310
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16061	NC_008312	CAA	2	6	691456	691461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474310
16062	NC_008312	AGA	3	9	691546	691554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113474310
16063	NC_008312	TTG	2	6	691556	691561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113474310
16064	NC_008312	ATC	2	6	691653	691658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113474310
16065	NC_008312	AGT	2	6	691675	691680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474310
16066	NC_008312	T	6	6	691697	691702	0 %	100 %	0 %	0 %	113474310
16067	NC_008312	ATG	2	6	691814	691819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_008312	A	9	9	691846	691854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_008312	ATTAA	2	10	691871	691880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_008312	ATA	2	6	691894	691899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_008312	ATA	2	6	691912	691917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_008312	ATTA	2	8	691942	691949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_008312	TATT	2	8	691965	691972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_008312	T	8	8	691981	691988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_008312	TTA	2	6	691999	692004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_008312	AAT	2	6	692005	692010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_008312	T	6	6	692027	692032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_008312	CT	3	6	692034	692039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16079	NC_008312	GTTAAT	2	12	692048	692059	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_008312	TAT	3	9	692060	692068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_008312	T	7	7	692127	692133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_008312	TAA	2	6	692156	692161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_008312	TAAT	2	8	692174	692181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_008312	ATT	2	6	692200	692205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_008312	TGT	2	6	692210	692215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_008312	T	9	9	692383	692391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16087	NC_008312	T	10	10	692439	692448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_008312	ATTAA	2	10	692498	692507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_008312	AAT	2	6	692516	692521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_008312	TAA	2	6	692533	692538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_008312	ATTTT	2	10	692564	692573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_008312	AAT	2	6	692590	692595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_008312	CTTTT	2	10	692617	692626	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16094	NC_008312	TCT	2	6	692670	692675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113474311
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16096	NC_008312	TGG	2	6	692795	692800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113474311
16097	NC_008312	GCTT	2	8	692849	692856	0 %	50 %	25 %	25 %	113474311
16098	NC_008312	A	6	6	692876	692881	100 %	0 %	0 %	0 %	113474311
16099	NC_008312	ATG	2	6	692897	692902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113474311
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16101	NC_008312	GCATTG	2	12	692961	692972	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113474311
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16103	NC_008312	TAT	3	9	692998	693006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113474311
16104	NC_008312	AAC	2	6	693050	693055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474311
16105	NC_008312	ATTT	2	8	693102	693109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_008312	ATT	2	6	693115	693120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_008312	ATT	2	6	693122	693127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_008312	T	7	7	693179	693185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_008312	TTA	2	6	693188	693193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_008312	TTA	2	6	693195	693200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_008312	ACT	2	6	693221	693226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16112	NC_008312	AGC	2	6	693234	693239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_008312	TTAA	2	8	693318	693325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_008312	AATAG	2	10	693351	693360	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_008312	AATT	2	8	693427	693434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_008312	ACT	2	6	693459	693464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_008312	TCT	2	6	693516	693521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_008312	ATTT	2	8	693598	693605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_008312	T	6	6	693707	693712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_008312	TCT	2	6	693734	693739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_008312	TAA	2	6	693756	693761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_008312	AT	4	8	693766	693773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_008312	AAT	2	6	693790	693795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_008312	TTA	2	6	693903	693908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_008312	T	6	6	693954	693959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_008312	ATA	2	6	694019	694024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16128	NC_008312	TCTT	2	8	694054	694061	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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