MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 183436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_008312	AG	3	6	642281	642286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_008312	A	6	6	642311	642316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_008312	TCC	2	6	642461	642466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15004	NC_008312	ACT	2	6	642596	642601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_008312	T	8	8	642638	642645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_008312	ATC	2	6	642662	642667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_008312	TAAA	2	8	642700	642707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_008312	ATA	3	9	642991	642999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_008312	TA	3	6	642998	643003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_008312	ACT	2	6	643019	643024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_008312	TC	3	6	643035	643040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15012	NC_008312	C	8	8	643047	643054	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15013	NC_008312	TAC	2	6	643080	643085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15014	NC_008312	TTGT	2	8	643117	643124	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_008312	CTT	2	6	643144	643149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_008312	TAA	2	6	643164	643169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_008312	TGA	2	6	643188	643193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_008312	A	8	8	643305	643312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_008312	A	8	8	643361	643368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_008312	ATT	2	6	643413	643418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_008312	ATAAA	2	10	643435	643444	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_008312	AAATA	2	10	643446	643455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_008312	AAG	2	6	643469	643474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_008312	T	7	7	643489	643495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_008312	ATT	2	6	643496	643501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_008312	TAC	2	6	643507	643512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_008312	GA	3	6	643522	643527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_008312	TA	3	6	643568	643573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_008312	TTA	2	6	643597	643602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_008312	T	7	7	643634	643640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_008312	TAC	2	6	643652	643657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15032	NC_008312	GGTTG	2	10	643683	643692	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_008312	A	6	6	643751	643756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_008312	AAGT	2	8	643777	643784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_008312	GAA	2	6	643791	643796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_008312	ATT	2	6	643841	643846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_008312	AGGGAT	2	12	643899	643910	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_008312	T	6	6	643999	644004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_008312	AGAA	2	8	644008	644015	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_008312	CAA	2	6	644019	644024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15041	NC_008312	AAT	2	6	644075	644080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_008312	AT	3	6	644120	644125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_008312	A	9	9	644151	644159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_008312	AGC	3	9	644177	644185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15045	NC_008312	CAAA	2	8	644344	644351	75 %	0 %	0 %	25 %	113474286
15046	NC_008312	TGG	2	6	644454	644459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113474286
15047	NC_008312	TGG	2	6	644577	644582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113474286
15048	NC_008312	AAT	2	6	644607	644612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113474286
15049	NC_008312	CT	3	6	644645	644650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15050	NC_008312	CTA	2	6	644676	644681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15051	NC_008312	ATTA	2	8	644711	644718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_008312	GGTA	2	8	644723	644730	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_008312	AT	3	6	644833	644838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_008312	TTA	2	6	644874	644879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_008312	AT	4	8	644897	644904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_008312	ATT	2	6	644919	644924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_008312	CAG	2	6	644995	645000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15058	NC_008312	TAT	2	6	645031	645036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_008312	T	7	7	645046	645052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_008312	ATAAA	2	10	645075	645084	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_008312	TA	3	6	645124	645129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_008312	T	7	7	645158	645164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_008312	TAC	2	6	645180	645185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15064	NC_008312	TAA	2	6	645198	645203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_008312	CAT	2	6	645317	645322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15066	NC_008312	ATC	2	6	645339	645344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15067	NC_008312	T	6	6	645357	645362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_008312	ATTA	2	8	645384	645391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_008312	T	6	6	645416	645421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_008312	TCAA	2	8	645471	645478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15071	NC_008312	AG	3	6	645512	645517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_008312	ATT	2	6	645643	645648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15074	NC_008312	TGT	2	6	645681	645686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_008312	TGT	2	6	645688	645693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15077	NC_008312	GAA	2	6	645765	645770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_008312	TAA	2	6	645834	645839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_008312	TG	3	6	645861	645866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_008312	TAA	2	6	645874	645879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_008312	TAA	2	6	645944	645949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_008312	GAG	2	6	646123	646128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113474287
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15093	NC_008312	A	6	6	646674	646679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_008312	TGTT	2	8	646722	646729	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_008312	CTC	2	6	646828	646833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15096	NC_008312	T	6	6	646862	646867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_008312	T	6	6	646874	646879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_008312	TC	4	8	646935	646942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15099	NC_008312	TG	3	6	646943	646948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_008312	CTT	2	6	647001	647006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_008312	TCA	2	6	647053	647058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15102	NC_008312	TAGG	2	8	647074	647081	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_008312	CCA	2	6	647184	647189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15104	NC_008312	GCA	2	6	647243	647248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15106	NC_008312	TTG	2	6	647466	647471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_008312	CTT	2	6	647481	647486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15108	NC_008312	TATT	2	8	647571	647578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_008312	A	6	6	647603	647608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_008312	TAA	2	6	647623	647628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_008312	TAA	2	6	647637	647642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_008312	AAC	2	6	647663	647668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474288
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15114	NC_008312	TA	3	6	648016	648021	50 %	50 %	0 %	0 %	113474288
15115	NC_008312	GTC	2	6	648038	648043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113474288
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15120	NC_008312	AAC	2	6	648378	648383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113474288
15121	NC_008312	AATT	2	8	648391	648398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_008312	TA	3	6	648404	648409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_008312	A	6	6	648446	648451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_008312	A	7	7	648484	648490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15127	NC_008312	TGA	2	6	648546	648551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15129	NC_008312	CCA	2	6	648628	648633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15130	NC_008312	T	6	6	648657	648662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15131	NC_008312	ATT	2	6	648692	648697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15133	NC_008312	CTT	2	6	648775	648780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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